mógłby'po eksporcie działać regulująco na genom jądrowy. Zarazem, wbrew poprzednim sugestiom, żadne RNA powstałe z transkrypcji genomu jądrowego nie wnika do mitochondrium poza jedynym znanym wyjątkiem, jakim jest RNA odpowiadające 135 p.z., a stanowiące istotny składnik endonukleazy czynnej w metabolizmie primerowego RNA przy replikacji mtDNA. Natomiast wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA i polimerazy mtDNA i mtRN A są importowane Ho mitochondrium z cytoplazmy.
Tabela 11.5. Produkty genomu mitochondrialnego w różnych typach organizmów
Zwierzęta |
Drożdże |
Grzyby |
Rośliny | |
Wielkość genomu (kpz) |
14-18 |
78 |
19-108 |
200-2400 |
Wielkość genomu (pm) |
5 |
12 |
30 | |
rRNA duża podjedn. |
16s |
21s |
21s |
26$ |
mała podjedn. |
12s |
15s |
15s |
18s |
5s RNA |
— |
— |
— |
+ |
tRNA (liczba rodzajów) |
22 |
23-25 |
23-25 |
30 |
Rybosomowe białko (var-l) |
— |
+ |
+ |
? |
Oksydaza cyt. c, podjedn. 1, 2, 3 |
+ |
+ |
+ |
+ |
Oksydored. CoQ-cyt. c (apocytochrom b) |
+ |
+ |
+ |
+ |
FoATPaza podjedn. 6, 8 |
+ |
+ |
+ |
+ |
podjedn. 9 |
— |
+ |
— |
+ |
FiATPaza podjedn. a |
— |
— |
— |
+ |
Oksydored. NADH-CoQ (liczba kodowanych podjedn.) |
7 |
Ch- |
6 |
9 |
W mitochondriach zwierząt produktem translacji genów (symbol genów w nawiasach) jest: siedem podjednostek dehydrogenazy NADH wrażliwej na rotenon (ndh: 1, 2, 3, 4, 4L, 5, 6), apocytochrom b w oksydoreduktazie ubichinokcytochrom c (cob), trzy podjednostłri oksydazy cytochromu c (cox 1, 2, 3) i dwie podjednostki syntetazy ATP (atp 6, 8). Nie wszystkie z tych genów są obecne w mtDNA innych organizmów (tab. 11.4). Powszechnymi są tylko cox 1 i cob obok genów kodujących dużą (LSU) i małą (SSU) podjednostkę rRNA. Z drugiej strony pewne genomy mitochondrialne zawierają geny dodatkowe, np. dla białek mt rybosomów i białek biorących udział w procesie dojrzewania mtRNA lub transpozycji intronów. W większości .mtDNA są koliste, ale bywają i liniowe (pewne grzyby, drożdże, Protozoa) oraz wielokrotnie koliste (rośliny)J
r mtDNA, choć bardzo konserwatywne w swojej podstawowej funkcji genetycznej, wykazuje radykalne różnice pomiędzy czterema tradycyjnymi królestwami eukariotów (zwierzęta, rośliny,, -^grgybyrpierwetniaki), a także w ich obrębie. Różnice dotyczą wielkości genomu mitochondri&l-
_negojo ponad 150 razy, od 14 kpz u Ascańs do~24(Knćpz u melonahsgosobu transkrypcji a natyst
samego kodu genetycznego.
mtDNA drożdży
Rys. 11.23. Organizacja mtDNA człowieka (krąg wewnętrzny) i drożdży (krąg zewnętrzny). W rzeczywistości długość mtDNA drożdży jest 5-krotnie dłuższa od mtDNA człowieka. Zaznaczono obie nici DNA, ciężką (H) i lekką (L), Transkrypcja nici ciężkiej przebiega zgodnie z ruchem wskazówek zegara, a nici lekkich odwrotnie. Sekwencja mtDNA człowieka jest w pełni poznana, a geny nie zawierają intronów. Sekwencja mtDNA drożdży znana jest fragmentarycznie. Skróty aminokwasów oznaczają geny odpowiednich tRNA. W mtDNA ludzkim gen podjednostki 6 ATPazy nakłada się na koniec N podjednostki 8. Podjednostka 9 ATPazy jest kodowana przez mtDNA drożdży, ale w jądrowym DNA u człowieka. Odwrotnie, mtDNA człowieka koduje 1-7 podjednostek (ND) oksydoreduktazy NADH-CoQ (kompleks I), a geny te są nieobecne w mtDNA drożdży, URF — niezidentyfikowane ramki odczytu. Zakreskowano obszary kodujące rybosomowy RNA. Zaczerniono w pełni introny w genach drożdży kodujących oksydazę cyt. c (podj. 1 i 2), cyt. b i rRNA
Ludzki mtDNA został całkowicie zsekwencjonowany (rys, 11.23). Kolista cząsteczka o 16,570 p.z, koduje 22 tRNA, 2 rRNA i 13 mRNA rozpoczynających się kodonem ATG (metionina). Każde mRNA zawiera informację dla połipeptydu o ponad 50 aminokwasach. Chodażjcolejność ułożenia genów mitochondrialnych jest różna u poszczególnych typów zwier tZŁt, mtDNSlzffterzat wykazuje maksymalną kondensację informacji genetyczne!. „
mtDNA drożdży jest około pięciokrotnie^ większy (7TO0O^z) i tylko w połowie zsekwencjonowany (rys. 11.23). 7 podjednostek dehydrogenazy NADH, zakodowanych w mtDNA zwie-
191