2. Wywołanie i /bud u nie. Ma mokrym jeszcze clmimntogramic zaznaczyć linię czol Po wysuszeniu chromatgramu wywołać go w 0,5% roztworze ninhydryny, za znaczyć obwody i punki środkowe plam aminokwasów. Obliczyć współczynniki Rf i za ich pomocą zidenyfikować plamy badanej mieszaniny aminokwasów.
Ćwiczenie 4.7. Ilościow)rozdział mieszaniny kilku aminokwasów w drodze spływowej chromatografii bibułowej jednowymiarowej
Zasada: Ilościowy charakti tej chromatografii polega na nakropleniu i rozwinięciu na jednym arkuszu bibuły Whtman nr 1 zarówno plam dla wzrastających stężeń wzór: wego roztworu aminokwas>w, jak i plam badanego roztworu aminokwasów. Rozdzi aminokwasów przeprowada się na drodze chromatografii jednowymiarowej zstępuj cej arkuszowej w prostokąiych szczelnych komorach Chropa, w temp. ok. 20°C. Odczynniki:
1) 0,0025 M roztwór wzorowy aminokwasów (zawierający cysteinę, argininę, kwas glutaminowy, alaninę i Icucynę) przygc&wany przez 2-krolne rozcieńczenie 0,005 M roztworu aminokwasów w 0,1 M roztworze HO.
2) 0,005 M roztwór wzorcoty aminokwasów w 0,1 M roztworze HC1. W małej zlewce (ok. 25 ml) | przygotować odpowicdni:odważki aminokwasów i rozpuścić w 10 ml roztworu HC1 ogrzar do temperatury ok. 60 ( Następnie przenieść je ilościowo do kolby miarowej na 100 ml] i uzupełnić do kreski HO 2 x destylowaną. Roztwór wzorcowy przechowuje się w mały pojemnikach w stanic zairożonym w temp. ok. - 10’C.
3) 0,0025 M, 0,0033 M i 0,00 M roztwory badanych aminokwasów.
4) 0,5% roztwór ninhydryn>v acetonie.
5) 0,005% roztwór CuS04 v75% etanolu.
6) CHjCOOH lodowaty cz.a.
Wykonanie:
1. Przygotowanie rozpuszcalnika. Jest nim n-butanol/CH3COOH/H20 (4:1:5) wstawiony do pokoju chromzograficznego na okres co najmniej 24 godz. (Układ dwufazowy: rozwijać w faz: butanolowej).
2. Przygotowanie chromattąramu. Na arkuszu bibuły Whatman nr 1 nakreślić ołówkiem równolegle do Irótszego brzegu 2 linie w odległości 5 i 9 cm. Linia pionowa równoległa do dhgiego brzegu arkusza bibuły oddziela „pole roztworów wzorcowych" od „pola rozworów badanych”. Na linii startu (9 cm od brzegu) zaznacza się punkty nakropenia plam w odległości 3,5 cm od siebie, a na kontrolne próby pozostawia się pas szrokości 6 cm przy wspomnianej linii pionowej.
Na linii startu nakrapla sit roztwór wzorcowy aminokwasów w ilości 10, 20, 30 i 40 pl za pomocą mikropbetki o pojemności 10 pl, a roztworu badanego: 20 pl (3 oddzielne plamy). Chronuogram rozwijać jednorazowo przez cały arkusz bibuły, przestrzegając jednocześnie tasycenia komory fazą wodną butanolowego rozpuszczalnika oraz kondycjonownia nakroplonego chromatogramu w ciągu 1-2 godz.
3. Wywoływanie ehromatognmu. Suchy chromatogram rozcina się wzdłuż pionowej linii i wywołuje przcprowadając go jednym ruchem przez 0,5% roztwór ninhydryny w acetonie, znajdujący się wwanicnce porcelanowej. Na chromatogramie uwidaczniają się plamy aminokwastw w następującej kolejności od linii startu: Cys, Lys. His, Arg, Asp, Ser, Gly, Glu.Thr, Ala, Pro, Tyr, Met, Val, Phe, Len-file.
4. Ilościowe oznaczanie aminokwasów. Na chromatognimie ujmuje się plamy odpowiedniego aminokwasu z roztworu badanego i wzorcowego w prostokąty o powierzchni odpowiadającej największej plamie. Identyczne pole wykreśla się na pasku bibuły przeznaczonym na próby kontrolne w linii poszczególnych aminokwasów wzorcowych i badanych. Wycięte prostokątne pola z plamami aminokwasów roztworu badanego i wzorcowego kroi się wzdłuż utkania bibuły na wąskie paski (ok. 2 3 mm), które wkłada się do probówki, przestrzegając ich równoległego ułożenia. Elucję barwnych pasm przeprowadza się za pomocą 5 ml 0,005% CuS04 w 75% etanolu. Czas elucji: 1 godz. Pomiaru absorbancji dokonuje się w foto-kolorymetrze przy /. = 520 nm.
Seria roztworów' wzorcowych aminokwasów pozwala wykreślić krzywą kalibracyjną obrazującą zależność absorbancji od stężenia aminokwasów, ewentualnie wartości absorbancji dla np. 1 pg aminokwasu wzorcowego. Znając średnią wartość absorbancji roztworu badanego aminokwasu oblicza się łatwo stężenie danego aminokwasu w eluacie, następnie w hydrolizacie i wreszcie w badanym białku.
Uwagi: t) Prolina i hydroksyprolinu reagują bardzo słabo z ninhydryną, natomiast z izatyną dają intensywną barwę błękitną. Chromatogramy zawierające te aminokwasy rozwija się w układzie M-butanol/HCOOH/H20 (75:15:10) przez 18 godz. Po wysuszeniu wywołuje się je w 2% roztworze i/atyny w butanolu zawierającym 4% CHjCOOH lodowatego. Prolina ukazuje się w postaci intensywnych niebieskich plam na żółtym tle całego chromatogramu. Zawartość proliny oznacza się planimctrycz-nie, pr/ckalkowując za pomocą nakłuć igłą obrysy plam z bibuły na papier milimetrowy. Porównanie ilościowe powierzchni plam roztworów wzorcowych i badanych wyznacza stężenie proliny w roztworze z błędem nic większym niż ±5%. 2) Ilościowe oznaczanie tryptofanu patrz ćw. 9.7.
Ćwiczenie 4.8. Elektrochromatograficzny rozdział aminokwasów (patrz ćw. 5.3).
Ćwiczenie 4.9. Oznaczanie N-końcowego aminokwasu metodą dinitrofenylowania i za pomocą chromatografii bibułowej dwuwymiarowej (patrz ćw. 6.25).
Ćwiczenie 4.10. Chromatografia bibułowa jednowymiarowa nukleotydów RNA
(patrz ćw. 10.30).
Ćwiczenie 4.11. Chromatografia bibułowa jednowymiarowa zasad azotowych DNA
(patrz ćw. 10.31).
U podstaw leżą te same procesy, które decydują o pomyślnym rozdzielaniu substancji innymi metodami chromatograficznymi. Są to procesy: odwracalnej adsorpcji fizycznej, wymiany jonowej i rozdziału substancji między dwie fazy ciekłe. Najczęściej zachodzi kombinacja wszystkich trzech jawisk, z przewagą jednego lub drugiego.
Właściwego wyboru jednej z wymienionych technik do rozdziału badanej mieszaniny trzeba dokonać po rozpatrzeniu różnic strukturalnych związków wchodzących w jej skład. Jak wynika z tabeli 4.4, różnice w rozmiarach cząsteczek (wyrażające się
125