Oznacznikami (markerami) enzymatycznymi dla lizosomów (zataczanych do organelli komórkowych) są następujące enzymy: fosfataza kwaśna, ryfaonukleaza. dezoksvrvbonukleaza II. katepsvnv I B-ołfrironidaza , Wszystkie te enzymy wykrywane są w fizosomach tak metodami biochemicznymi, jak i histochemicznymi
Enzymatycznym oznacznikiem (markerem) dla aparatu Golgiego jest tiaminowa pirofosfataza. Wykonanie odczynu Nstoche micznego na ten enzym tak dokładnie .konturuje" układ beleczek i wakuofi aparatu Golgiego, źe z powodzeniem zastąpić może dotychczas stosowane wybarwienie tej organelli metodami histologicznymi opartymi na srebrzeniu
Enzymatycznymi ornacznkami (markerami) dla chondriomu komórkowego biorącego (ze względu właśnie na enzymy w nim zawarte) bezpośredni udział w procesach oksydoredukcyjnych i w tlenowej fosforylacji są odpowiednio dehydrogenaza kwasu bursztynowego i adenozynotrójfosfataza mitochondrialna.
Teoretyczne, oznacznikami enzymatycznymi dla tej organelli mogą być prawie wszystkie enzymy biorące udział w tych procesach (m m prawie wszystkie enzymy wchodzące w tzw. cykl Krebsa), praktycznie, metodami histochemicznymi wykrywane jest ich kilkanaście, a wśród nich najczęściej w tym celu stosowane są właśnie metody na wyżej wymienione dwa enzymy.
Podstawą odczynu histochemiczneao metody Nachlasa i wspófpr na dehydrogenazę kwasu bursztynowego jest odłączenie przez enzym (dehydrogenazę) z substratu (sól sodowa kwasu bursztynowego) dwu atomów wodoru, które łącząc sie z solą tetrazotowa Nitro BT dała produkt końcowy w postaci barwnych złogów formazanu w miejscach występowania (aktywności) tego enzymu .Konturowanie" chondriomu komórkowego przez tę dehydrogenazę jest wyjątkowo precyzyjne ze względu na umiejscowienie enzymu na błonach bądź w samych błonach tej organelli
Istnieją tez możliwości barwienia mitochondruim zielenią Janusową lub hematoksyliną źelazistą