Stanza Heliodora do 1514 - różne epizody uratowania kościoła od zagrażających mu niebezpieczeństw:
Wypędzenie ze świątyni jerozolimskiej Heliodora
Spotkanie Leona I Wielkiego z wodzem Hunów Attylą pod murami Rzymu
Uwolnienie św. Piotra z więzienia
Msza Bolseńska (niewierzącemu księdzu na Hostii ukazują się krople krwi)
Stanza del Incendio Pożar Borgo
- Madonna Sykstyńska 1513-1514 dla kościoła św. Sykstusa w Piacenzy - Madonna przedstawiona jako kochanka Rafaela Margherita Luti, zwana La Fornarina. Po lewej stronie adorujący ją Św. Sykstus ma twarz papieża Juliusza II
-1514 po śmierci Bramantego obejmuje kierownictwo budowy kościoła Św. Piotra -1510 portret Juliusza II
-1517-19 portret Leona X z dwoma kardynałami - przy pomocy Gulio Romano
- portret Donna Velata w Galerii Pitti 1515
- portret zezowatego prałata Tomasza Inghiramiego
- Madonna di Loreto (kopia w Luwrze)
- tondo Madonna z domu Alba w Ermitażu
- Madonna dellaSedia, Muzeum Prado
- Madonna z rybą 1513
- Madonna del Baldachino 1514 Galeria Pitti
- Madonna di Foligno 1511 Pinakoteka Watykańska
- Św. Cecylia w Pinakotece Bolońskiej
- 10 arrasów watykańskich 1514-16 na zlecenie Leona X przeznaczone do kaplicy Sykstyńskiej -utkane w Brukseli i zawieszone w 1519 roku, epizody dot. założenia i początkowych dziejów kościoła: 7 autorstwa Rafaela: 2 epizody z Ewangelii (Cudowny połów ryb, Wręczenie kluczy św. Piotrowi), 5 epizodów z Dziejów Apostolskich (Uzdrowienie chromego przez Św. Piotra i Jana, Śmierć Ananiasza, Oślepienie Elymasa, Ofiara w Lystrze, Kazanie Św. Pawła w Atenach), 3 projekty uczniów Rafaela (Nawrócenie św. Pawła, Ukamieniowanie Św. Szczepana, Uwolnienie Św. Pawła z więzienia)
- dekoracja Loggi watykańskich 1517-19-52 epizody biblijne, groteski na filarach
- dekoracja willi Farnesiny na zlecenie bankiera Agostino Chigi Fresk Triumf Galatei 1514
Sceny z historii Amora i Psyche
-1514 Sybille w Santa Maria della Pace na zlecenie Agostino Chigi -1515 portret Baltazara Castiglione
-1515-19 Madonna Sykstyńska do wielkiego ołtarza Św. Sykstusa w Piacenzy (obecnie w Dreźnie)
- Transfiguracja w Watykanie - ukończona po śmierci artysty przez jego uczniów, przemienienie na górze Tabor w strefie górnej, przyprowadzenie opętanego do apostołów w strefie dolnej
- święta Rodzina Franciszka 11518 - obraz ofiarowany przez Watykan królowi Francji, Franciszkowi I
- święty Michał 1518 - obraz ofiarowany przez Watykan królowi Francji, Franciszkowi I
- obraz ołtarzowy Przemienienie Pańskie