plik


ÿþL A B O R A T O R I U M 5 / 2 0 0 9 . . . W LABORATORI UM | Nowe metody stosowane w analizie |ywno[ci  aspekt mikrobiologiczny STRESZCZENIE GBówne cigu ostatniej dekady obser- liwe jest bardzo dokBadne okre[lenie niebezpieczeDstwo dla zdrowia, wowano wzrost infekcji wywo- przynale|no[ci gatunkowej bakterii, a nawet |ycia konsumenta zwizane WBanych spo|yciem produktów a nawet okre[lenie ich szczepu. jest z pogorszeniem jako[ci zdrowotnej |ywno[ciowych o niedostatecznej ja- produktu, co wynika z obecno[ci ko[ci. Epidemiologia tych zatru wci| PRZYCZYNY ROZWOJU i rozwoju mikroorganizmów, przede ewoluuje nie tylko dlatego, |e populacja SZYBKICH TECHNIK wszystkim chorobotwórczych. Dlatego staBa si wyjtkowo wra|liwa, ale przede IDENTYFIKACJI te| jednoznaczna i szybka identyfi kacja wszystkim z powodu zmiany stylu |y- Rozwój nowoczesnych technik z zakre- zagro|eD mikrobiologicznych w surowcu, cia, tj. jemy coraz ró|norodniej  |dni su mikrobiologii, immunologii, biolo- na wszystkich etapach procesu przygód kulinarnych, po[wicamy mniej gii, biochemii i biofizyki przyczyniB si technologicznego i w samym produkcie czasu na przygotowanie posiBków, korzy- do postpu w zakresie szybkich metod jest konieczna. W artykule przedstawiono stamy z wygodnej |ywno[ci. RozwinBy oznaczania i charakterystyki mikroorga- zestawienie gBównych nurtów i technik si równie| nowe zagro|enia, nowe grupy nizmów w |ywno[ci. Nowoczesne meto- mikrobiologicznych stosowanych obecnie patogenów zwizane z rozwojem tech- dy mikrobiologiczne s ukierunkowane w praktyce laboratoryjnej i przemysBowej. nologii produkcji |ywno[ci, procesów przede wszystkim na szybkie i niezawodne SAOWA KLUCZOWE metody przetwarzania i dystrybucji. wykrywanie bakterii chorobotwórczych. detekcji mikroorganizmów W zakresie szybkiego wykrywania i iden- METODY IDENTYFIKACJI tyfikacji mikroorganizmów prym wiod SUMMARY The main hazard MIKROORGANIZMÓW nauki z zakresu medycyny. Postpujcy to consumer s health, or even life, Do identyfikacji mikroorganizmów wy- rozwój metod instrumentalnych i testów is connected with the decrease of korzystujemy metody, które mo|emy diagnostycznych oraz postp naukowy product s health quality which is the podzieli na 3 grupy: wykorzystuje si do ulepszenia metod fi rst of a number of consequences of  metody fenotypowe  wykorzystujce izolacji, wczesnego wykrywania, liczenia, the presence and growth of pathogenic cechy fenotypowe mikroorganizmów, charakterystyki i identyfikacji mikroor- microorganisms. Therefore unequivocal które mo|na zaobserwowa pod mi- ganizmów. Monitorowanie produkcji and fast identifi cation of microbiological kroskopem. Na podstawie wygldu |ywno[ci poprzez system HACCP (Ha- risks in raw material, at all stages of zewntrznego nie mo|na zidentyfi- zard Analysis Critical Control Points) oraz production process and in fi nished kowa bakterii ze wzgldu na podo- kontrol higieny w ramach GHP (Good product is necessary. In the paper bieDstwo komórek midzy ró|nymi Hygienic Practice), GMP (Good Manufactu- the review of the main trends and filogenetycznie rodzinami, ring Practice), MRA (Microbial Risk Asses- microbiological techniques being used  metody biochemiczne  metody stosowa- sment), RM (Risk Management), RC (Risk at present in laboratory and industrial ne gBównie w przemy[le i wykorzystujce Communication) oraz TQM (Total Quality practice has been presented. produkty szlaków metabolicznych cha- Management) jest skutecznym, zgodnym KEY WORDS methods of rakterystyczne dla danych drobnoustro- z obecnymi trendami sposobem zarzdza- microorganisms detection jów. Na podstawie analizy metabolitów nia jako[ci i bezpieczeDstwem |ywno[ci. bakteryjnych jeste[my w stanie zaklasyfi- Systemy te wymagaj jednak nowocze- kowa je do danej grupy, a porównujc snych, a przede wszystkim szybkich i jed- otrzymane wyniki z wynikami w bazach noznacznych testów oceny m.in. stanu danych, czsto mo|emy precyzyjnie mikrobiologicznego maszyn i urzdzeD okre[li przynale|no[ taksonomiczn produkcyjnych, surowca i produktu. mikroorganizmów, Dlatego w ostatnich latach obserwuje  metody genetyczne  najbardziej pre- si szybki transfer technik wykrywania cyzyjne techniki wykorzystujce zdoby- i identyfikacji drobnoustrojów z za- dr in|. Kamila Goderska cze biologii molekularnej, opierajce kresu medycyny klinicznej do praktyki dr in|. Artur Szwengiel si gBównie na materiale genetycznym przemysBowej. Adaptacja metod wymaga INSTYTUT TECHNOLOGII {YWNOZCI POCHODZENIA ROZLINNEGO UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W POZNANIU drobnoustrojów, dziki którym mo|- jednak|e opracowania wBa[ciwych proce- 10 . . . W LABORATORI UM L A B O R A T O R I U M 5 / 2 0 0 9 | dur analizy skomplikowanej matrycy, jak nietypowych i niekorzystnych mikro- jest |ywno[, i dotyczy gBównie sposobu organizmów oraz ich metabolitów, przygotowywania próbki. które mo|na szybko zidentyfikowa Analiza mikrobiologiczna |ywno[ci i oznaczy), in|. JÓZEF NITKA sprowadza si do oznaczenia ogólnej  wskazniki bezpiecznej |ywno[ci (wykry- 44-172 Niewiesze k. Gliwic, ul. Pyskowicka 12 liczby drobnoustrojów oraz stwierdzenia wanie niepo|danych i patogennych tel. 032 230 32 01, fax 032 230 33 01 e-mail: info@sylant.pl obecno[ci i poziomu patogenów. Licz- mikroorganizmów w sposób szybki, b drobnoustrojów oznacza si poprzez Batwy i pewny, np. E. coli, Enterobacter, posiewy pBytkowe metod wgBbn oraz Klebsiella, Salmonella, Listeria monocy- metod powierzchniow. Tradycyjne togenes, Staphylococcus aureus), procedury s wieloetapowe, czasochBon-  wskazniki matematycznego mode- ne, materiaBochBonne, ponadto czsto lowania wzrostu niepo|danych mi- wymagaj du|ego do[wiadczenia perso- kroorganizmów w danym produkcie, nelu. Zaletami nowoczesnych technik sBu|ce do przewidywania jako[ci mi- s przede wszystkim: oszczdno[ czasu, krobiologicznej |ywno[ci (Predictive mo|liwo[ oceny liczebno[ci populacji, Microbiology). identyfikacja gatunkowa oraz mo|liwo[ zró|nicowania w obrbie gatunku. CHARAKTERYSTYKA ANALIZATOR ANALIZATOR Nowe narzdzia, jakie daj nam osi- TECHNIK DETEKCJI BAKTERII gnicia naukowe w dziedzinie immuno- Najwiksz uwag skupia si obecnie logii, biologii molekularnej, biochemii, na szybkich metodach detekcji mikroor- MODEL biologii z elementami chemii, fizyki ganizmów i ich automatyzacji. Praktycz- i biofizyki, powinny by wykorzystywa- ne znaczenie maj testy biochemiczne BACTRAC 4300 ne w dwóch pBaszczyznach w celu kom- do identyfikacji mikroorganizmów. Naj- Cechy: pleksowego zapewnienia bezpieczeDstwa bardziej znanymi testami biochemicznymi w peBni zautomatyzowany zdrowotnego |ywno[ci. Z jednej strony s testy API. W zasadzie oparte s one pomiar powinno si prowadzi badania monito- na prostych reakcjach chemicznych, któ- metoda impedancyjna z pomiarem parametrów ringowe obejmujce zakBad produkcyjny. re zachodz w podBo|ach wzrostowych; M i E Z drugiej strony szczegóBowa wiedza o za- niekiedy zachodzi potrzeba dodania zastpuje metod chowaniu si mikroorganizmów w odpo- do podBo|a po inkubacji odpowiedniego pBytkow wiedzi na okre[lone warunki [rodowi- odczynnika. Do badaD u|ywa si tak|e redukuje kilkakrotnie czas detekcji ska pozwala na obiektywne okre[lenie mikrotitrera pBytkowego, wykorzystujce- mikroorganizmów wpBywu procesu technologicznego oraz go inokulacj za pomoc wielopunktowej Batwa preparatyka dla analiz warunków dystrybucji i magazynowania pipety inokulacyjnej. W badaniach mi- ilo[ciowych i jako[ciowych na stopieD ska|enia mikrobiologicznego krobiologicznych stosowane s równie| redukuje koszta analizy i nakBad pracy i jego jako[; wiedz t, jak i procedu- testy immunoenzymatyczne, które oparte wysoka wydajno[ ry, powinny z kolei zakBadom zapewni s na metodach ELISA. SBu| one gBównie (do 64 stanowisk placówki naukowe. do szybkiego wykrywania drobnoustro- pomiarowych jów patogennych, takich jak: Salmonella, i powy|ej, a| do 768) upraszcza i kompletuje CELE I ZAKRES Listeria, Staphylococcus, E. coli 0157:H7. dokumentacj analiz OCENY STANU Do identyfikacji paBeczek Salmonella MIKROBIOLOGICZNEGO oraz gronkowców chorobotwórczych Zastosowania: Mikrobiologiczne badania monitoringowe stosowane s testy serologiczne, czyli te- screening patogenów powinny zatem uwzgldnia: sty hemaglutacyjne oraz testy lateksowe. caBkowita liczba bakterii testy sterylno[ci  mikrobiologiczn ocen surowców, Modyfikacj pBytkowej metody oznacza- detekcja wzrostu  higien zakBadu (personelu, urzdzeD nia liczby mikroorganizmów w produk- mikroorganizmów i pomieszczeD produkcyjnych), tach jest Petrifilm, zBo|ony z podwójnej testy aktywno[ci  konfekcjonowanie, dystrybucj i trans- warstwy zawierajcej podBo|e wzrostowe kinetyka wzrostu testy inhibitorów port produktów oraz ich przechowy- w postaci |elu rozpuszczalnego w zimnej analiza grzybów i ple[ni wanie. wodzie i tworzcego bBonk. Petrifilmy optymalizacja skBadu Monitorowanie, w tym rutynowa sBu| do oznaczenia ogólnej liczby bak- artykuBów spo|ywczych kontrola jako[ci i bezpieczeDstwa surow- terii tlenowych, dro|d|y i ple[ni oraz badania biofilmów i wiele innych ców oraz gotowych produktów, wymaga E. coli. Inna metoda to zastosowanie posBugiwania si odpowiednimi i specy- pBytki pokrytej podBo|ami, w przypadku Legislacja: ficznymi dla mikrobiologii wskaznika- której posiew przeprowadza si przez za- *DIN 10115/10120 mi. Wskazniki mikrobiologiczne mo|na nurzenie, pocieranie lub metod kontak- + §35 LMBG, podzieli na: tow (dociskow). Wykorzystywany jest OeNORM, GOSSTANDARD, AFNOR  wskazniki jako[ci produktu (oznacze- tak|e system pBytki spiralnej, polegajcy nie typowych, po|danych bdz te| na rozprowadzeniu pBynnej próbki na po- 11 reklama L A B O R A T O R I U M 5 / 2 0 0 9 . . . W LABORATORI UM | ikroskopia Mfluorescencyjna DEFT ma szczególne znaczenie m.in. w ocenie jako[ci bakteriologicznej mleka. wierzchni i tworzeniu spirali Archime- ni, które nastpnie barwione s oran|em metrów impedancyjnych próbki: M-value desa poprzez osadzenie smugi zawiesiny akrydyny. Niebieskie mikrokolonie liczo- (impedancja podBo|a) i E-value (impe- w strumieniu próby zmniejszajcym si ne s w mikroskopie fluorescencyjnym dancja elektrod). Mierzalna impedancja od [rodka pBytki do brzegów. lub za pomoc analizatora. [rodowiska nastpuje, gdy liczba bakterii Metoda Droplette polega na zmie- Kolejn metod jest pomiar aktywno[ci osiga poziom 106 komórek, a dro|d|y szaniu rozcieDczonej próby z upBynnio- metabolicznej oparty na testach redukta- i grzybów  po osigniciu poziomu ok. nym podBo|em agarowym w stosunku zowych, metodzie impedymetrycznej, mi- 104 komórek. Stosujc t technik, mo|na 1:9. Nastpnie zaszczepione podBo|e krokalorymetrii, cytometrii przepBywowej, okre[li caBkowit liczb mikroorganizmów, nanosi si w postaci kropelki o objto[ci biosensorach i pomiarze ilo[ci enzymów. a po zastosowaniu po|ywek selektywnych 0,1 ml na plastikowe pBytki i po skoD- Testy reduktazowe bazuj na obserwacjach równie| bakterii chorobotwórczych, dro|- czonym czasie inkubacji liczy si mi- zmian zachodzcych w po|ywkach w wy- d|y i ple[ni. Technika ta znajduje zasto- krokolonie. Kolejn metod s pomiary niku aktywno[ci metabolicznej mikroorga- sowanie w analizie mleka, soków, jarzyn, turbidymetryczne. Analizator Bioscreen nizmów. Enzymy bakteryjne, takie jak np. produktów mlecznych i przypraw. Zna- jest caBkowicie zautomatyzowanym syste- dehydrogenaza, przenosz atom wodoru mionuje j szybkie testowanie aktywno[ci mem analizy. ZBo|ony jest z inkubatora, z substratu na barwniki typu redox, powo- szczepionek przed ich wprowadzeniem wytrzsarki i automatycznego urzdzenia dujc zmian ich zabarwienia. Aktywno[ do procesów fermentacyjnych. do jako[ciowego i ilo[ciowego wykrywa- enzymu jest zale|na od liczby mikroorga- Mikrokalorymetria oparta jest na zja- nia mikroorganizmów. Próby lub ich roz- nizmów, a miernikiem ich ilo[ci jest czas, wisku wydzielania si ciepBa podczas cieDczenia s zaszczepiane automatycznie w którym zajdzie zmiana zabarwienia wzrostu mikroorganizmów. Minimalny w pBytkach mikrotitrera. Wzrost mikroor- stosowanego barwnika redox. Stosuje si poziom tworzenia ciepBa daj próby za- ganizmów monitoruje si przez pomiar takie barwniki, jak: bBkit metylenowy, wierajce ok. 1000 bakterii/ml. gsto[ci optycznej co 10 minut. resazuryna i chlorek tetrazoliowy. Cytometria przepBywowa opiera si Mikroskopia fluorescencyjna DEFT Metoda impedymetryczna jest pomia- na pomiarze fizycznych i niekiedy che- ma szczególne znaczenie w ocenie jako[ci rem oporno[ci, jak stawia podBo|e dla micznych cech komórek, które s zawie- bakteriologicznej mleka i misa oraz przy prdu zmiennego. Wykorzystuje si w niej szone w roztworze i pojedynczo przepBy- produkcji piwa. Technika ta obejmuje najnowszy analizator mikrobiologiczny waj przez sensory optyczne. Komórki filtrowanie próby wstpnie traktowanej BacTrac. Kompleksowe skBadniki po|ywek poruszaj si w pBynie o szybko[ci prze- enzymem celem lepszej filtracji próby (sacharydy, biaBka, tBuszcze) s katabolizo- pBywu od 10 m/s do 20 m/s; po o[wie- i separacji optycznej bakterii od otacza- wane do naBadowanych produktów meta- tleniu ich [wiatBem rejestruje si liczb jcego tBa. Oran| akrydyny barwi osiadBe bolizmu, takich jak: aminokwasy, kwasy i rozmiar czsteczek. W tej metodzie bakterie, a |ywe komórki [wiec na po- organiczne i inne niskoczsteczkowe me- wykorzystuje si równie| znakowanie maraDczowo lub |óBto, natomiast martwe tabolity. Rozwój mikroorganizmów pro- skBadników komórkowych, takich jak:  na zielono. Modyfikacj tej metody jest wadzi do obni|enia caBkowitej impedancji biaBka, kwasy nukleinowe, lipidy czy membrane filter microcolony fluorescent me- podBo|a. Miernikiem detekcji mikroor- antygeny powierzchniowe, za pomoc thod (MMCF), stosowana do oceny ilo[ci ganizmów jest czas detekcji, po którym fluorochromów. Metod t stosuje si dro|d|y i ple[ni w piwie. Unieruchomione nastpuje mierzalna zmiana impedancji do okre[lenia ogólnej liczby dro|d|y i pa- na filtrach mikroorganizmy hoduje si [rodowiska. Do okre[lenia profilu wzro- Beczek mlekowych, coraz cz[ciej jednak na selektywnych podBo|ach agarowych, stu drobnoustrojów ska|ajcych próby wykorzystywana jest te| do wykrywania umo|liwiajcych tworzenie si mikrokolo- wykorzystywane s pomiary dwóch para- poszczególnych grup mikroorganizmów. 12 fot. Shutterstock . . . W LABORATORI UM L A B O R A T O R I U M 5 / 2 0 0 9 | Biosensory daj sygnaB w odpowiedzi jest charakterystyka [ciany komórkowej, si jedynie z DNA oznaczanego mikro- na zmiany [rodowiskowe, reagujc np. która zawiera chityn, oraz membran organizmu. W oznaczeniach systemu na ciepBo, [wiatBo i pH. Sensorami s ró|- cytoplazmatycznych, zawierajcych er- Gene-Trak stosowane s fluorescencyj- nego typu elektrody. gosterol. Poziom ergosterolu [wiadczy nie znakowane sondy DNA, natomiast Bakterie z rodzaju Enterobacteriaceae o jako[ci |ywno[ci i mo|e by oznacza- w systemie Gene-Probe wykorzystywane wytwarzaj enzym ß-D-glukuronidaz. ny za pomoc chromatografii HPLC, s sondy znakowane akrydynowym es- Jest on produkowany przez E. coli i cz[ chromatografii gazowej i cienkowarstwo- trem. W obydwu systemach oligonukle- szczepów z rodzaju Shigella, Salmonella wej oraz spektrometrii w ultrafiolecie otydowe sondy DNA s komplementarne i Arizona. PozostaBe bakterie z rodziny i podczerwieni. wobec charakterystycznych dla anali- Enterobacteriaceae nie wytwarzaj tego zowanego mikroorganizmu sekwencji enzymu. MUG jest substratem, który NAJNOWOCZEZNIEJSZE rybosomalnego RNA. RRNA wystpuje pozwala do[ szybko wykry aktywno[ METODY w komórce w du|ej liczbie kopii, ponie- tego enzymu. Zwizek ten, w wyniku Biologia molekularna stanowi najno- wa| jest integraln cz[ci bakteryjnego hydrolizy przez enzym glukuronidaz, wocze[niejsze narzdzie do oznaczeD rybosomu. Analiza taka skBada si z czte- ulega rozkBadowi z wydzieleniem 4-me- mikrobiologicznych. Mo|na stosowa rech etapów. Liz próbki dla bakterii tyloumbeliferolu, wykazujcego niebiesk sondy, które Bcz si z okre[lonym G(-) powoduje zasadowe [rodowisko, fluorescencj w [wietle UV. mikroorganizmem, wirusem czy te| a dla G(+) wspomaga si j lizozymem. Kolejn metod jest pomiar metabo- specyficznym skBadnikiem organizmu, Nastpnie nastpuj hybrydyzacja, zwi- litów po[rednich lub produktów koD- a nastpnie wykorzystywa detekcj zanie hybrydu i detekcja. Do unikalnych, cowych. Oznacza si np. pirogronian. kompleksu sonda  analizowany skBad- ssiadujcych ze sob regionów tej samej W tym celu wykorzystuje si metod enzy- nik. Najcz[ciej stosowanymi sondami czsteczki rRNA testowanego organizmu matycznej redukcji kwasu pirogronowego s kwasy nukleinowe do detekcji DNA dodawane si dwie sondy wykazujce przez dehydrogenaz mleczanow. lub RNA oraz czsteczki przeciwciaB homologi. Jedna umo|liwia wizanie Inn znan metod jest biolumine- do detekcji biaBek, wglowodanów lub hybrydu z no[nikiem dziki poBcze- scencyjny pomiar ATP. Wszystkie |ywe lipidów. Je|eli sekwencja zasad w son- niu do jej 3 koDca poli dA, natomiast komórki zawieraj ATP  nukleotyd, dzie jest komplementarna do sekwen- druga sBu|y do detekcji, gdy| do jej oby- który peBni rol magazynu energii. St- cji charakterystycznej dla oznaczanego dwu koDców przyBczone s specjalne |enie ATP mo|e by mierzone w prosty mikroorganizmu, wówczas sonda wi|e zwizki chemiczne wywoBujce zmian sposób w reakcji z zastosowaniem lucy- reklama feryny i lucyferazy. W wyniku tej reakcji wydzielane jest [wiatBo w ilo[ciach rów- nowa|nych do ilo[ci ATP. Stosujc t me- tod, w cigu 1 minuty mo|na oceni stan sanitarny powierzchni. Test LAL jest szybk metod wykrywa- nia endotoksyn, czyli obecno[ci bakterii G(-). SkBadaj si one z kompleksów lipi- dów i polisacharydów o ró|nym skBadzie chemicznym. Techniki radiometryczne s oparte na pomiarze pobierania lub znakowania substratów lub produktów. Najcz[ciej stosowane metody radio- metryczne wykorzystuj pomiar 14CO2  tworzonego przez mikroorganizmy w wyniku metabolizowania znakowanych izotopowo substratów, np. glukozy czy laktozy, wprowadzonych do podBo|a hodowlanego. Szybko[ czasu detekcji jest skorelowana z pocztkow liczb mikroorganizmów w badanej próbie. Trudno[ w usuwaniu odpadów izoto- powych wyklucza t metod z zastoso- waD w analizie |ywno[ci. Ró|nicowanie do rodzajów mo|liwe jest na podstawie analizy lotnych produktów koDcowych przy pomocy chromatografii gazowej. Mo|na stosowa j do bakterii z rodza- ju Bacillus i Clostridium. W przypadku oznaczeD dotyczcych grzybów mo|liwa 13 L A B O R A T O R I U M 5 / 2 0 0 9 . . . W LABORATORI UM | TECHNOLOGIA DETEKCJI ZALETY WADY  ró|nicowanie |ywych/martwych komórek, minimalna interferencja z matryc próbki, wysoka specyficzno[,  Batwe wizanie (hybrydyzacja), Hybrydyzacja  kanapkowa (sandwich  nierozró|nianie serotypu lub podgatunku,  mo|liwo[ oznaczania wielu próbek (pBytka hybridisation)  Advantages of HybriScan®  limitowane przeznaczenie sondy z 96 mikrostudzienkami),  oznaczenia jako[ciowe i ilo[ciowe,  detekcja mikroorganizmów nie rosncych w warunkach laboratoryjnych  brak rozró|nienia midzy |ywymi i martwymi  du|a wydajno[, komórkami, PCR  czuBo[,  du|a interferencja z matryc,  oznaczenia ilo[ciowe  inhibicja polimerazy  rozró|nianie serotypu lub podgatunku,  niska czuBo[,  mo|liwo[ oznaczania wielu próbek (pBytka ELISA  niska specyficzno[, reaktywno[ krzy|owa, z 96 mikrostudzienkami),  wolna i droga procedura  oznaczenia jako[ciowe i ilo[ciowe  czasochBonne (okoBo 10 dni),  relatywnie niedrogie,  brak detekcji mikroorganizmów nie Metody konwencjonalne  proste procedury, rosncych w warunkach laboratoryjnych, (bazujce na hodowli komórek)  specyficzne,  niska wydajno[,  szeroko akceptowane metody  wymagaj du|ego nakBadu pracy Tabela 1. Wady i zalety ró|nych technik detekcji mikroorganizmów (na podstawie Advantages of HybriScan® over other detection techniques, pobrano ze strony internetowej www.sigmaaldrich.com) barwy lub luminescencj. Wstawienie metoda immunoenzymatyczna ELISA. Kolejn metod stanowi identyfikacja do testowanej mieszaniny staBego no- PrzeciwciaBo w stosunku do testowanego widma w podczerwieni, które jest odzwier- [nika zawierajcego poli dT umo|liwia mikroorganizmu poBczone jest z enzy- ciedleniem skBadu chemicznego komórek wychwycenie powstajcych wcze[niej mem. Po reakcji przeciwciaBo  antygen mikroorganizmów. Reprezentuje ono biaB- hybrydów. Detekcja odbywa si poprzez obmywany jest nadmiar przeciwciaBa, ka, elementy [ciany komórkowej i bBony pomiar zmiany barwy (Gene-Trak) lub a obecno[ organizmu mo|e by stwier- cytoplazmatycznej oraz kwasy nukleinowe. luminescencji (Gene-Probe) wywoBanych dzona przez dodanie odpowiedniego Analiza korelacji widm umo|liwia ró|nico- po zanurzeniu no[nika z przyBczonym substratu, zmieniajcego kolor w obec- wanie szczepów. Jednak|e niektóre z obser- hybrydem w specjalnych odczynnikach. no[ci enzymu. Zmiana koloru dowodzi wowanych pr|ków mogByby ju| obecnie Sondy wymagaj obecno[ci 105-106 ko- obecno[ci danego organizmu. W technice by przypisane grupom funkcyjnym okre- pii charakterystycznej sekwencji DNA. immunologicznej stosowane s latekso- [lonych zwizków chemicznych struktur Mo|na to pokona poprzez powielenie we, ró|nokolorowe kuleczki, specyficzne komórkowych. Widma w podczerwieni DNA charakterystycznego mikroorga- dla poszczególnych mikroorganizmów. s unikalne dla poszczególnych organizmów, nizmu technik PCR. Inn metod jest Obecno[ testowanych organizmów wic dysponujc odpowiednimi bazami analiza poliformizmu miejsc restrykcyj- w roztworze powoduje Bczenie si danych, mo|na je porówna, i obliczajc nych RFLP. Polega ona na wyizolowaniu ze sob kuleczek ze wzgldu na reakcj wspóBczynnik korelacji, ustali przyna- DNA z testowanego mikroorganizmu, przeciwciaBa z antygenami obecnymi le|no[ diagnostyczn mikroorganizmu. trawieniu odpowiednio dobranymi en- na powierzchni drobnoustrojów, co jest Szybk i wiarygodna metod identy- zymami restrykcyjnymi i rozdzieleniu widoczne w formie powstajcych agrega- fikacji i klasyfikacji mikroorganizmów ze wzgldu na wielko[ powstajcych tów. PrzeciwciaBa mog by przyBczone jest spektrometria MALDI-TOF (matrix- fragmentów DNA metod elektrofore- do kuleczek magnetycznych i wówczas -assisted laser desorption/ionization-time zy |elowej. Nastpnie rozdzielane frag- komórki testowanych organizmów bd of flight). WspóBczesne systemy spektrome- menty przenoszone s na membran si z nimi Bczy. Magnes umieszczony trii MALDI-TOF umo|liwiaj wykonanie i dodawana jest chemiluminescencyjnie pod pojemnikiem z testowan próbk analizy pozwalajcej na jednoznaczn znakowana, specyficzna sonda genetycz- powoduje przyciganie kuleczek wraz identyfikacj bakterii, dro|d|y czy grzy- na. Z ró|norodno[ci sekwencji wynika z testowanymi drobnoustrojami i oczysz- bów w cigu kilku minut. obecno[ miejsc restrykcyjnych lub ich czenie roztworu. Immunomagnetyczna Zalety i wady wybranych technik de- brak, a konsekwencj tego jest hybrydy- separacja usuwa okre[lone mikroorga- tekcji mikroorganizmów przedstawiono zacja sond z fragmentami o ró|nej wiel- nizmy i stosowana jest do usuwania w tabeli 1. Wybór wBa[ciwej techniki ko[ci. Sondy pozwalaj uzyska rozkBad komórek Salmonella z przypraw i E. coli warunkowany jest czasem, jakim dyspo- pr|ków unikalny dla danego szczepu 0157:H7 z |ywno[ci. Je[li przykBado- nuje si do momentu uzyskania wyniku, mikroorganizmu. wo przeciwciaBa szczepów Salmonella [ci[le sprecyzowanym celem i zakresem Metody immunologiczne bazuj poBczymy z czerwonymi kuleczkami, identyfikacji, liczb próbek oraz akcep- na zastosowaniu przeciwciaB reagujcych a z niebieskimi  przeciwciaBa Listeria towanymi kosztami analiz. qð z antygenami obecnymi na powierzch- spp., to istnieje mo|liwo[ identyfiko- Pi[miennictwo dostpne na stronie ni testowanego mikroorganizmu. Naj- wania obecno[ci kilku rodzajów mikro- www.laboratorium.elamed.pl powszechniej stosowan technik jest organizmów. 14 Pi[miennictwo 1. Stanley P.E., McCarthy B.J., Smither R.: ATP  Luminescence rapid methods in microbiology. Blackwell Sci. Pub., Oxford 1989. 2. Barker J.M., Griffiths M.W., Collins-Thompson D.L.: Bacterial bioluminescence applications in food microbiology.  J. Food Prot. , 1992, 55, 62-70. 3. Czajkowska D.: Nowoczesne metody diagnostyczne w mikrobiologii |ywno[ci. MateriaBy Konferencji Naukowej  BezpieczeDstwo mikrobiologiczne produkcji |ywno[ci , PTT{, Warszawa 1997, 83-93. 4. Czaczyk K., Trojanowska K.: Zastosowanie szybkich metod oznaczania i identyfikacji drobnoustrojów.  PrzemysB Spo|ywczy , 2006, 2, 14-21. 5. Palka R.: Zastosowanie osigni biologii molekularnej w mikrobiologii |ywno[ci.  PrzemysB Spo|ywczy , 2007, 2, 6-8. 6. SaBek A.: Nowoczesne metody badaD mikrobiologicznych.  PrzemysB Spo|ywczy , 2004, 2, 28-32. 7. Ilinicka-Olejniczak O., Hornecka D.: Prognozowanie w mikrobiologii |ywno[ci.  PrzemysB Spo|ywczy , 1995, 2, 57-58. 8. HybriScan® Rapid Test Systems. MateriaBy reklamowe on-line, www.sigmaaldrich.com. 9. Meng J., Doyle M.P.: Introduction. Microbial food safety.  Microbes and Infection , 2002, 395-397.

Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
notatek pl charakterystyka metod stosowanych w analizie zywnosci
Metody reologiczne w analizie żywności
3 Metody jakoÂciowe analizy ryzyka [v3]
Metody stosowane w biologii molekularnej
Metody wykrywania zafałszowań żywności
szybkie metody identyfikacji mikroorganizmów w żywności
32 Wykonywanie wagowej analizy żywności
Transgeniczne mikroorganizmy w produkcji enzymów stosowanych w technologii żywności
Modul 2 Metody?dan stosowane w pedagogice
Metody elektrochemiczne w analizie chemicznej skrypt kulometria konduktometria potencjometria
metody stosowane w uszkodzeniu tkanek miekkich
Metody ankietowe i analiza tekstu w badaniach JOS
wykorzystanie elektroforezy kapilarnej w analizie żywności
PODSTAWOWE METODY STOSOWANE W?KTERIOLOGII

więcej podobnych podstron