Biochemia 3 !, Zootechnika SGGW, biochemia


Centrum aktywne enzymu znajduje się w szczelinach bądź w zagłębieniach.

Katalizują przebieg reakcji (przyspieszają reakcje)

Jednym z najdłużej żyjących białek są białka mięśni (okres półtrwania to ok. miesiąc a enzymów nawet kilka sekund bądź minut)

2 modele działania enzymów:

1. Model klucza i zamka - jeżeli mamy cząsteczkę enzymu. To jego centrum aktywne ma jakiś kształt. Substrat ma kształt, który pasuje do centrum aktywnego enzymu

Po reakcji: enzym i Np. 2 produkty reakcji

2. model elastycznego dopasowania - związanie substratu pociąga za sobą zmianę kształtu enzymu. Kształt miejsca aktywnego staje się komplementarny do kształtu substratu dopiero po związaniu substratu

Enzymy przyspieszają reakcje przez stabilizacje stanu przejściowego (interakcja enzymu z substratem), to proste lub złożone białka nazywane obecnie biokatalizatorami, powstają w komórce ( organizmie),katalizują( wspomagają) przebieg reakcji metabolicznych.

Enzymy zbudowane są z części białkowej( apoenzym) , w niej znajduje się centrum aktywne.Oraz z części niebiałkowej - koenzym.

Apoenzym+ koenzym = holoenzym.

Częścią niebiałkową w enzymie mogą być: witaminy ,ATP, jony żelaza, jony wapnia, FAD, NAD.

CECHY ENZYMÓW: enzymy obniżają energię katalizujących reakcji, tzw; energię aktywacji( zmniejszają energię potrzebną do rozpoczęcia reakcji) , enzymy mogą działać wielokrotnie, wykazują dużą aktywność katalityczną

Na aktywność enzymów wpływa: temperatura im wyższa temperatura tym wzrasta aktywność enzymów. Wyższa temp ok. 40 st C niszczy enzymy powodując denaturację białka. kwasowość środowiska pH enzymy działają w określonym środowisku :zasadowym( pH 7,1- 14), kwaśnym ( pH 1-6,9) lub obojętnym ( pH=7)

Aktywnośc enzymów jest hamowana przez inhibitory: są to związki przestrzenie podobne do substratów,mogą w sposób czasowy lub trwały połączyć się z enzymem.

Substrat stan przejściowy Produkt

Przejście ze stanu przejściowego do produktu jest nieodwracalne, ponieważ energia swobodna produktu jest zawsze mniejsza niż substratu

Specyficzność substratowa (wąska lub szeroka)

Proteinazy (proteinazy) to enzymy hydrolizujące białka

Potrafi rozpoznać wiązanie peptydowe i potrafi je rozbić - taki enzym ma szeroka specyficzność substratowa

Ale Np. trypsyna będzie hydrolizować to wiązanie tylko wtedy, gdy w skład tego wiązania będzie wchodzić po stronie karboksylowej Arg lub Lys jest to wąska specyficzność substratowa;

Oraz trombina (krzepliwość krwi), ale tylko, gdy wiązanie peptydowe jest pomiędzy Arg i Gly

Regulacja aktywności:

hamowanie przez sprzężenie zwrotne

A B C D Z

Przez produkt Z hamowany będzie enzym, który prowadzi do wytworzenia B z A

Gdy produkt reakcji hamuje powstanie wcześniejszego produktu

1bierna regulacja

karmodulina 1 kDa białko???

modyfikacje kowalencyjne

Kinazy - enzymy, które biorą udział w fosforylacji białek

Fosfataza - gdy katalizuje reakcje odłączania reszty fosforanowej

Aktywacja enzymów nieaktywnych

Ciecia proteolityczne - hymotrypsynogen; wycinanie fragmentów w celu aktywacji enzymów

Strategie regulacyjne

1. kontrola allostetyczna

Enzymy są hamowane na zasadzie sprzężenia zwrotnego przez końcowy produkt

A B C D Z

2. stymulacja i hamowanie przez białka regulacyjne

- karmodulina? białko wiążące wapń

- cAMP wewnątrzkomórkowy przekaźnik w sygnalizacji hormonalnej - aktywuje kinaze białkowa A

- czynnik przeciw hemofilowy -białko zwiększające aktywność proteazy serynowej

3. odwracalna modyfikacja kowalencyjna

kinazy białkowe, fosforylacja / defosforylacja

4. aktywacja proteolityczna

Zymogen ? lub proenzym, nieaktywny prekursor enzymu

Zymogeny żołądkowe i trzustki

MIEJSCE SYNTEZY

ZYMOGEN

AKTYWNY ENZYM

Żołądek

Pepsynogen

Pepsyna

Trzustka

Chymotrypsynogen

Chymotrypsyna

Trzustka

Prokarboksypeptydaza

Karboksypeptydaza

Trzustka

Proelastaza

Elastaza

Cechy wspólne miejsc aktywnych enzymów:

  1. miejsca aktywne zajmują stosunkowo mała część całkowitej objętości cząsteczki enzymu

  2. miejsce aktywne jest układem przestrzennym złożonym z grup chemicznych leżących w różnych pozycjach liniowej sekwencji aminokwasów

  3. w połączeniach substratów z enzymami biorą udział stosunkowo słabe siły wiązania: stala równowagi kompleksu ES zazwyczaj wynosi około 10-2 do 10-8 M co odpowiada energii swobodnej wiązania ok. -12 do -50 kJ/Mol

  4. miejsca aktywne są zagłębieniami lub szczelinami

  5. specyficzność wiązania zależy od precyzyjnie określonego ułożenia atomów w miejscu aktywnym

1890 Emil Fleischer układ enzym-substrat przypomina układ klucz-zamek

1958 Daniel E. Koshland miejsca aktywne niektórych enzymów nie są strukturami sztywnymi a ich kształt ulega modyfikacji na skutek związania substratu (wymuszone dopasowanie)

Klasyfikacja enzymów zgodna z typem reakcji

  1. oksydoreduktazy - katalizuje reakcje ox - redox

  2. transferaza - katalizują reakcje gdzie są przenoszone różne grupy

  3. hydrolazy - hydrolityczne; rozkładające związki w obecności wody

  4. liazy - rozpad bez udziału wody

  5. izomerazy

  6. ligazy - katalizują reakcje przyłączania

Biochemia wykład 3

2



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
biochemia poprawka1, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
biochemia 6 wykl!, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
EGZAMIN BIOCHEMIA, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
sciaga biochemia, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
2popr biochemia 2006, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
Biochemia- Ustnie, Zootechnika SGGW, biochemia
Biochemia 4 wyk!, Zootechnika SGGW, semestr II, biochemia
Biochemia 5!, Zootechnika SGGW, biochemia
SCKIAGA 2, Zootechnika SGGW, biochemia
pytania na egzmian opracowane, Zootechnika SGGW, biochemia
Biochemia - pytania na egzamin, Zootechnika SGGW, biochemia
Wpływ stężenia enzymu, Zootechnika SGGW, biochemia
pytania1234, Zootechnika SGGW, semestr V, towaroznawstwo
higiena agacia, Zootechnika SGGW, semestr IV, higiena, Higiena
PYTANIA NA EGZAMIN Z HIGIENY ZWIERZ T, Zootechnika SGGW, semestr IV, higiena, Higiena
wyklad rachunkowosc, Zootechnika SGGW, semestr VI, rachunkowość
opracowane pytania na egzamin, Zootechnika SGGW, semestr VI, rozród
Higiena zw, Zootechnika SGGW, semestr IV, higiena, Higiena
Drób ćw 5, Zootechnika SGGW, Drób(1)

więcej podobnych podstron