GRUPA A
Dwa głowne enzymy w Met. Elisa
Peroksydaza (chrzanowa) i fosfataza alkaliczna
Wzór, specyficzność substratowa, poligalakturonaza
Pullulanaza- enzym degradujący rozgałęzienia w amylopektynie, można dzieki niej przyspieszyc proces scukrzania.\
pullulan-6-glukanohydrolaza; EC 3.2.1.41
Enzym ten umożliwia usunięcie rozgałęzień zarówno amylopektyny jak i amylozy. Efektem finalnym jego działania są oligo- i poli- sacharydy o stopniu polimeryzacji z zakresu 115 - 2300.
Enzym ten jest z reguły stosowany w kombinacji z innymi amylazami.
Chociaż enzym ten zidentyfikowano w takich roślinach jak: bawełna, ryż i szpinak to jednak w celach przemysłowych izoluje się go głównie ze szczepów bakterii. Pullulanaza umożliwia hydrolizę wiązań 1,6- glikozydowych jedynie gdy wiązanie to scala łańcuchy polisacharydowe połączone wiązaniem 1,4-glikozydowym.
W zależności od zdolności pollulanazy do hydrolizy wiązań glikozydowych rozróżnia się dwa typy pollulanaz: I (nieaktywne w hydrolizie wiązań 1,4-) i II (aktywne w hydrolizie wiązań 1,4-).
Katal- jednostka SI aktywności enzymatycznej i innych katalizatorow. Wyrazaja akt. Katalityczna. 1 katal taka ilość katalizatora która przekonwertuje 1 mol substratu w czasie 1 s w określonych warunkach reakcji; 1 kat = 1mol/s = 60*106U
Teoria indukowanego dopasowania Koschlanda
Konformacje zmieniaja się na pasujące do siebie bezpośrednio przed polaczeniem enzymu z substratem. Z teorii wynika, że enzym pod wpływem substratu zmienia swa strukture tak, że centrum aktywne z charakterystycznymi grupami funkcyjnymi otacza substrat lub jego fragment, co umozliwia dokonanie się zalozonej reakcji, przy czym zmianie ulega tez konformacja substratu co dodatkowo ułatwia wzajemne dopasowanie
Np. działanie B-amylazy na fragment czasteczki skrobii
Wiązanie stabilizujące strukture wtórna białek
w. wodorowe (2*)
w.wodorowe, kowalenc. w.dwusiarczkowe, w.jonowe, oddz.van der Waalsa, oddz hydrofobowe (3*)
7) TEMED - N,N,N',N'-Tetraetylenodiamina- organiczny zw. Chemiczny z gr. Diamin o wzorze półstrulturalnym (CH3)2-N-CH2-CH2-N-(CH3)2,
Stosowany jako katalizator polimeryzacji akrylamidi (powoduje rozbicie czasteczek nadsiarczanu amonu, który daje rodniki niezbędne do polimeryzacji)
Jest tez skutecznym związkiem chelatujacym.
Białe, drobnokrystaliczne ciało stałe.
Łatwopalny, żrący
ALDEHYD GLUTAROWY (glutaral) - organiczny zw. Chemiczny z gr. Aldehydów ,
Wykorzystywany do sterylizacji jako substancja konserwujaca.
Trujacy.
Aktywny w stosunku do form wegetatywnych bakterii, wirusów i grzybów.
Nie powoduje korozji metali.
Może podrażniać skore oczy i blony sluzowe
Bezbarwna ciecz o ostrym zapachu
Toksyczny
Czego wynikiem jest barwa w Met. Lowryego?
Pozytywna reakcja (niebieska barwa błękitu fosfomolibdenowego) bialka, łancuchy polipept, tyrozyna, tryptofan; fenole, puryny, pirymidyny, kwas moczowy
Metody immobilizacji:
ZALETY: zwiększają (mogą) specyficzność enzymow, selektywność względem niektórych substratow
Fizyczne metody są łagodne, nie powoduja strat w aktywności enzymu, proste i tanie
Chemiczne zapewniaja stabilność układu
WADY: Fizyczne powoduje czeste wymywanie enzymu ze złoża
Chemiczne: Stabilnosc układu wiąze się z czesciowa utrata aktywności enzymu
GUMA GUAR zagęstnik, środek żelujący, WIELOCUKIER,
Reszty D-mannozy -------D-galaktozy
|
β-1,4-glikozydowe
Dodatek do żelu agarozowego poprawia jego wytrzymałość mechaniczna i bierze udzial w sieciowaniu go
KARAGENIAN- reszty β-D-galaktozy-------3,6-anhydro-α-D-galaktoza
|
β-1,4-glikozydowe
2 czasteczki karagenianu tworza podwójną helise i wraz z jonami K uklada się w trójwymiarowa siec tworząc tzw domene
Kappa (κ)i iota(ι) maja zdolność tworzenia żeli
Wraz ze zmniejszeniem gr SO3- maleje elastyczność, ilość czast. Polisacharydu
Wzrasta sztywność i kruchość żeli
Wraz ze zmniejszenie zaw. Anhydrogalaktozy wzrasta wrazliowosc na dział. Jonów i zdolność żelowania.
Dodatek do żywności, leków.
Nośnik do pulapkowania komórek i enzymów.
W piekarstwie:
Enzymy apolityczne i proteolityczne
Pod wpływem siły odśrodkowej nastepuje rozdiał czasteczek różniących się gęstością. Ten proces to:
Upłynnianie skrobi
Najczesciej stosowane 1-etapowe upłynnianie. Polega na:
- ogrzewanie zawiesiny skrobi z dodatkiem termo stabilnej α-amylazy, jonów wapniowych strumieniem pary (105-107*C) przez 5-8min
- nagle schlodzenie do 95*C
- powtorny dodatek enzymu
-dekstrynizacja
15) Rozkład wiazan 1,6-glikozydowych w amylopektynie
Pullalanaza (?)
16)Immunoenzymatyczna metoda ze zwielokrotniona reakcja enzymatyczna (EMIT)
Metoda homogenna, kompetencyjna, pozwala na wykoanie oznaczenia z pominieciem procesu separacji kompleksu.
Wykorzystuje ona możliwość zmiany aktywności enzymu przez blokowanie miejsca aktywnego dla substratu lub przez zmiane konformacji czasteczki enzymu.
W metodzie wykorzystuje się antygen sprzężony z enzymem i przeciwciała specyficzne dla antygenu.
Podczas wiazania powstałego koniugatu Ag-Enzym ze specyficznym dla niego przeciwciałami dochodzi do zahamowania akt. Enz. Kompleksu. Po dodaniu próbki, antygen znakowany enzymem współzawodniczy z antygenem z próbki o miejsce wiązace w czasteczkach przeciwciała.
Do ozn. Subst. Drobnocząsteczkowych, haptenow, leków
Spektrofotometryczne ozn. Białek
Absorbancja w nadfiolecie,
Większość bialek (dzieki obecn tyrozyny i tryptofanu) ma max absorbancji przy 280nm. Zwiazkami które mogą wpływac na ta wartość sa kwasy nukleinowe (max przy 260nm)
Cbiałka= 1,55 *A280nm - 0,76 * A260nm
Bład: rozne bialka i kwasy nukleinowe, w jednakowych stężeniach nie daka identy. Absorbancji max.
Wiele puryn, pirymidyn, fenoli (zw małoczast) ma duża absorbancje przy 260 i 280 nm
Metoda szybka, w małej ilości materiału, obecn duzych stezen soli, szeroko stosowana.
Nie, gdy >20% kw. Nukleinowych w mieszaninie
17)Met Bradforda. Za pomoca jakiej grupy barwnik Coomasie łaczy się i z czym? długość fali
Z białkiem w środowisku kwasowym (zabarw niebieskie). Z turozyna i tryptofanem (??)
Metoda Bradforda wykorzystuje zdolność wiązania barwnika błękitu brylantowego Coomassie G-250 (ang.Coomasie Brillant Blue) z białkiem. W środowisku kwaśnym widmo absorpcji barwnika charakteryzuje się maksimum przy 465 nm, natomiast po związaniu białka maksimum przesuwa się w stronę fal dłuższych i występuje w przy 595 nm. Mając wyznaczoną krzywą kalibracyjną dla wzorcowego białka (np. BSA, IgG) można określać zawartość białka w badanej próbce poprzez pomiar zmiany absorbancji w 595 nm roztworu barwnika po dodaniu do niego badanej próbki.
Większość białek dzięki obecności aminokwasów aromatycznych tryptofanu i tyrozyny, wykazuje maksimum absorbancji przy około 280 nm co pozwala na oznaczenie zawartości białka w roztworze przez bezpośredni pomiar absorbancji w nadfiolecie
18) Met. Lowryego
Kolorymetryczna, dwie reakcje
I)R.Biuretowa
Białko+ jony miedzi(ph zasad)
(w.peptyd)
II)R.Redukcji (ph10)
Odczynnik Folina-Ciocalteu redukcja Błekit fosfomolibdenowy
(fosfomolibdeno-fosfowolfram)
|
Kwas ortofosforowy i kwas molibdenowy
Czulsza metoda od biuretowej 100x
Pozytywna reakcja (nieb) białka, łanc polipept, tyrozyna, tryptofan, fenole, puryny, pirymidyny, kw moczowy)
19) Jednostka aktywności pektyno esterazy
Jednostkę aktywności pektynoesterazy (PEU) zdefiniowano jako ilość enzymu równoważną 1 ml 1 M NaOH potrzebnego do utrzymania stałego pH mieszaniny reakcyjnej przez 1 min w warunkach reakcji
20) Jednostka miedzynarodowa
Międzynarodowa jednostka enzymu (U) jest to taka ilość enzymu, która katalizuje przekształcenie 1 mikromola substratu w ciągu 1 min w temp. 30°C przy nasyceniu enzymu substratem i przy optymalnym pH dla jego aktywności.
Grupa B
Metoda kanapkowa- test immunoenzymatyczny
Może być wykorzysta. Do wyznaczania ilości określonego bialkoweho antygenu w próbie.
Do obojetnie chemicznego polimerowego podloza przylacza się przeciwciało, po czym naklada się na badana próbe.
Po wymyciu niezwiązanego bialka dodaje się drugie przeciwciało i rozpoznające inny epitot antygenu. To drugie przeciwciało jest znakowane za pomoca enzymu przekształcającego bezbarwny substrat w barwny il bialk. Antygenu wyznaczymy w próbie przez okreslenie intens. powstałej barwy
4 zalety ELISA w analizie żywności:
- łatwość wykonania-
- Możliwość rutynowego, jednoczesnego przeanalizowania duzej liczby prób w tym samym czasie (monitoring
- szerokie spektrum (zaw drobnoustr, ich metabolitow, toksyn, antybioz, pestycyd, lipidów, polisacharyd, witamin, leków, zw.alergennych)
- wysoka czułość
- bezpieczniejsza
- oszczedna
Stosujac ELISA można wykryc aflatoksyny, kt mogą wyst w zbozu, kukur, orzechach zaatakowanych plesniami ASPERGILLUS FLAVUS i APSERGILLUS PARASTIKUS które maja zdolność do prod aflatoksyn
Fałszywe. Wysokometylowane pektyny:
Zdolne do tworzenia żeli niskocukrowych lub bezcukrowych w obecn jonow Ca (FAŁSZ??)
Dlaczego przy oznaczaniu akt.pekrynoesterazy utrzymuje się stale nie przekraczające 7,3pH?
Powyżej tego pH dezaktywacja enzymu
Rozpad substratu
Powyżej tego pH akt enzymu nie jest max
Wszystkie odp poprawne
Przykład polisacharydu kwasnego uzywanego przy pulapkowaniu
Agarowa, karaginian
Pulapkowanie fizyczne na:
- adsorpcja enzymu na nierozpuszczalnej matrycy
- pułapk. Biokataliza. Wewnątrz struktury Nat lub synt polimerow
Żel poliakrylamidowy
- powstaje gdy liniowe łancuchy zbud z jednostek akryl amidu zostana usieciowane przez tworzenie poprzecznych wiazan z N,N''metylenobisakrylamidem (BIS)
- wlk porów w zelu może być regulowana zarówno przez zmiane całkowitego stez akryl amidu T% (AA+BIS) jak i przez zmiane stosunku obu monomerów C% (BIS/AA)
Niektóre enzymy, to enzymy allosteryczne, zmieniające swoją konformację w odpowiedzi na związanie efektora (inhibitora lub aktywatora)
Enzymatyczna hydroliza laktozy w serwatce lub w mleku jest procesem realizowanym w systemie ciągłym z wykorzystaniem:
Galaktozydazy
Preparat- PROTEOPOL (??) - zawiera enzym prod. Przez Bacillus subtilis
α-amylaza
Co otrzymujemy w wyniku działania izomerazy glukozowej?
wykazująca in vitro aktywność izomeracji glukozy we fruktozę,
izomeraza glukozowa jest otrzymywana głownie ze Streptomyces.
Czemy enzym nieruchomiony jest lepszy od ruchomego (???!!!?
Zalety pułapkowanie
- nie niszczy struktury enzymu (poliakrylamid)
- łatwy, odporny, nie klei się (poliakrylamid)
- miekki, nie rozmazuje się (żelatyna)
β-galaktozydaza
Enzym β-galaktozydaza, kodowany przez jeden z genów struktury operonu laktozowego u E.coli, hydrolizuje laktozę na dwa cukry proste: glukozę i galaktozę
syrop glukozowy (bakterie) ???? wg mnie te które produkują a-amylaze, amyloglukozydaze i pullunalaza biorace udzial w prod syropu (patrz ponizej) np. Bacilius subtilis, B. amyloliquefaciens, Aerobacter aerogenes, B.acidodopullulyticus
(syrop kukurydziany/ang. Corn syrup)
Oczyszczony wodny roztwór sacharydów powstałych w wyniku hydrolizy skrobi. Posiada DE >20
procesy technologiczne w których sa stosowane preparaty enzymat. Rozluzniające:
- prod. Kiszonek
- procesy ekstrakcji barwników i zw. Zapach
- technologia kawy rozpuszcz.
- przetwórstwo soi
- przem. Olejarski
- prod. Wina ( zw. Wydajn. Tłoczenia, zw. Ekstrakcje zw. Barwnych i aromatow z tkanki, przyspiesza i polepsza klarowanie moszczu, szybsza i spokojna fermentacja, zmniejszenie pienienia się, ułatwia filtracje, przyspiesza dojrzewanie wina)
Fitazy- w procesie mokrego mielenia ziarna (kukur, pszenica) dodatek fitazy pozwala uzsykac bezfitynianowe namoki zbozowe (możliwe że zwieksza termostabilnosc α-amylzay, która w procesie upłynniania skrobi przeprowadza w znaczacy spsoć hydrolize niektórych rodzajow natywnej i nieskleikowanej skrobi)
Enzymy powodujące mętnienie wina:
Endogenna oksydaza polifenolowa (tyrozynaza) owoców
Oksydaza polifenolowa syntetyzowana przez Bacillus cinerea (lakkaza)