ZASTOSOWANIE ENZYMÓW DO ILOŚCIOWEJ ANALIZY METABOLITÓW
Oznaczanie stężenia glukozy w materiale biologicznym
Enzymy są doskonałym narzędziem stosowanym w analizie wielu związków. Wykorzystuje się je w analizie żywności, leków i diagnostyce medycznej. Szczególnie użyteczne są enzymy w badaniach biochemicznych i biotechnologicznych. W biochemii stosuje się je do analizy metabolitów (alkohol, glukoza, fruktoza, 2,3-difosfoglicerynian, kreatynina, cholesterol, CO2 itd.). Metody analityczne z udziałem enzymów charakteryzują się wysoką specyficznością, powtarzalnością, szybkością i ogromną czułością. Dzięki specyficzności enzymów analiza może być wykonywana w homogenatach, płynach fizjologicznych i nie oczyszczonych próbach, a wysoka czułość pozwala na użycie do badań niewielkich ilości materiału.
W oznaczeniach z udziałem enzymów bardzo często reakcje sprzężone są z procesami fosforylacji lub defosforylacji oraz utlenieniem lub redukcją NAD lub NADP. Enzymy stosuje się do analizy ilościowej cukrów tj. glukozy, fruktozy lub skrobi.
W analizie glukozy wykorzystuje się enzymy metabolizujące ten cukier: heksokinazę i dehydrogenazę glukozo-6-fosforanu (glikoliza, cykl pentozofosforanowy) (1) lub oksydazę glukozy w reakcji sprzężonej z aktywnością peroksydazy (2).
heksokinaza
(1) glukoza + ATP glukozo-6-fosforan + ADP
glukozo-6-fosforan + NADP+ 6-fosfoglukonian + NADPH + H+
(2) glukoza + H2O +O2 glukonian + H2O2
2H2O2 + 4-aminofenazon + fenol chinonoimina + 4H2O
W wyniku reakcji katalizowanej przez dehydrogenazę glukozo-6-fosforanu (1) dochodzi do spadku poziomu NADP i wzrostu poziomu NADPH w mieszaninie reakcyjnej. Ilość powstającego w reakcji NADPH jest proporcjonalna do ilości glukozy. Ilość glukozy wyznaczamy na podstawie rosnącej absorbancji próby mierzonej przy λ = 340nm. Zmiany te wynikają z tego, że widmo adsorpcyjne NADP i NADPH jest różne. NADP posiada jedno maksimum absorbcji przy λ = 260 nm, a powstający po redukcji NADPH zyskuje dodatkowe maksimum absorbcji przy λ = 340nm.
Odczynniki:
5M HClO4
2,5M KOH
100 mM bufor Tris-HCl pH 8,0
10mM ATP
3mM NADP+
Mieszanina heksokinaza 140U/ml i dehydrogenaza glukozo-6-fosforanu l U/ml w 100mM buforze Tris-HCl pH 8,0 + 0,9% albumina + 0,05% NaN3
100mM MgCl2
Roztwór standardowy glukozy o stężeniu 0,1 mg/ml
Materiał:
Surowica krwi
Wątroba
Kiełki pszenicy lub kukurydzy
Wykonanie:
A. Przygotowanie krzywej kalibracyjnej
Celem przygotowania krzywej kalibracyjnej dla każdej metody analizy ilościowej jest:
a/ wyznaczenie zależności między ilością analizowanej substancji, a wartością uzyskanych
w doświadczeniu danych np. absorbancji. Wartości te możemy wykorzystać do
sporządzenia wykresu, oraz do obliczenia współczynnika kalibracji,
b/ określenie zakresu metody, czyli wyznaczenie najmniejszej i największej ilości lub
stężenia substancji jaką możemy zmierzyć stosując daną metodę analityczną,
c/ zbadanie czy stosowana metoda spełnia kryteria wynikające ze zjawisk, które stanowią
podstawę używanej do analizy metody np. w metodach kolorymetrycznych wypełniają
kryterium liniowej zależności między stężeniem analizowanej substancji, a absorbancją
uzyskanych roztworów barwnych.
Z roztworu standardowego glukozy o stężeniu 0,1mg/ml przygotuj następujące roztwory:
1/ 10 μg glukozy/0,6ml; 2/ 20 μg glukozy/0,6ml; 3/ 30 μg glukozy/0,6ml
W probówce zmieszaj kolejno:
0,6 ml standardu o określonym stężeniu glukozy
0,6 ml 100 mM buforu Tris-HCl pH 8,0
0,1 ml 100mM MgCl2
0,05 ml 10mM ATP
0,05 ml mieszaniny heksokinazy i dehydrogenazy (przygotowany rozwór enzymów jest 50×rozc.)
Składniki dokładnie wymieszaj, przenieś do kuwety.
Dodaj 0,1 ml NADP+ i kuwetę wstaw do spektrofotometru.
Co 1 min notuj zmiany absorbancji przy λ= 340 nm aż do uzyskania stałej wartości odczytu.
Próbę „0” przygotuj jak wyżej dodając w miejsce roztworu glukozy 0,6 ml H2O.
B. Przygotowanie materiału
1/ Surowica
Do probówki Eppendorfa z 0,5 ml surowicy dodać 0,5 ml H2O i l ml 5M HClO4. Dokładnie wymieszać i wirować 2 min w mikrowirówce. Pobrać l ml supernatantu do probówki Eppendorfa i dodać l ml 2,5M KOH. Ponownie dokładnie wymieszać i odwirować. Do oznaczeń supernatant rozcieńczyć 5-krotnie H2O.
2/ Wątroba
5g wątroby rozdrobnić nożem i zhomogenizować w probówce plastikowej z 10 ml H2O używając homogenizatora nożykowego. 4ml homogenatu przenieść do 2 probówek Eppendorfa i wirować 10 min przy 15tys. obr/min. Supernatant rozcieńczyć 5 × wodą destylowaną. W kolejnej probówce Eppendorfa zmieszać l ml rozcieńczonego 5 × supernatantu z l ml 5M HCIO4 i wirować przez 2 min w mikrowirówce. Ponownie pobrać l ml supernatantu i przenieść do suchej probówki, dodać l ml 2,5M KOH, dokładnie wymieszać i odwirować w mikrowirówce. Do oznaczeń supernatant rozcieńczyć 5 × H2O.
3/ Kiełki
2,5 g kiełków rozetrzeć w moździerzu z l0 ml H2O. 4ml homogenatu przenieść do 2 probówek Eppendorfa i wirować 10 min przy 15 tys. obr/min. Do kolejnej probówki Eppendorfa przenieść 0,5 ml supernatantu, dodać 0,5 ml H2O i l ml 5 M HClO4. Po dokładnym wymieszaniu zawiesinę wirować przez 2 min w mikrowirówce. Do probówki Eppendorfa przenieść l ml supernatantu i 1 ml 2,5M KOH. Całość dokładnie wymieszać i odwirować jak wyżej. Do oznaczeń supernatant rozcieńczyć 10 × H2O.
C. Oznaczanie stężenia glukozy w surowicy krwi, komórkach watroby i kiełkach
Przed pomiarem ustaw długość fali w spektrofotometrze na λ = 340nm.
W probówce szklanej zmieszać:
0,6ml odbiałczonej próby
0,6 ml 100 mM buforu Tris-HCl pH 8,0
0,l ml 100mMMgCl2
0,05 ml 10 mM ATP
0,05 ml mieszaniny heksokinazy i dehydrogenazy glukozo-6-fosforanu (50× rozc)
Dokładnie wymieszać, przenieść do kuwety spektrofotometrycznej.
Dodać 0,1 ml NADP+ wymieszać, wstawić do spektrofotometru i notować zmiany absorbancji przy λ = 340 co l min aż do stałej wartości odczytu.
Próbę „zerową" przygotować jak wyżej dodając w miejsce odbiałczanej próby 0,6 ml wody.
Opracowanie wyników:
Na podstawie uzyskanych wyników wykreśl zależność wartości absorbancji od stężenia glukozy
w próbie (0,6ml) oraz oblicz współczynnik kalibracji k.
Posługując się krzywą standardową i korzystając ze współczynnika kalibracji oblicz stężenie
glukozy (mg/ml) w surowicy krwi, komórkach wątroby i kiełkach.
Molowy współczynnik absorpcji dla NAD+/NADP+ wynosi ε = 6220 l x mol-1 x cm-1
przy grubości warstwy 1 cm i długości fali λ = 340 nm.
Z prawa Lamberta-Beera:
A = c x ε x l gdzie: A - absorbancja roztworu
c - stężenie substancji
l - grubość warstwy (cm)
Korzystając z powyższego wzoru oblicz stężenie glukozy (mg/ml) w badanym materiale.
Uwaga! Przy obliczaniu całkowitego stężenia glukozy uwzględnij jej rozcieńczenie
w badanym materiale.
1
oksydaza glukozy
peroksydaza
dehydrogenaza
glukozo-6-fosforanu