HELISA
Jest to jedna ze struktur drugorzędowych występujących w białkach.
Została odkryta przez Paulinaga
Najczęściej jest to prawoskrętna -helisa, ale jak wiemy z biofizyki nie jest to jedyna możliwa (ostrzegam, że Staroń zasugerował, iż to już było w ramach tego przedmiotu, on tego powtarzał nie będzie, a umieć- musimy!)
Stabilizowana jest przez wiązania wodorowe tworzone między grupą C=O oraz N-H czwartego z kolei AA (w sensie ten AA od grupy karbonylowej jest n, a ten od aminowej n+4)
Powstaje w ten sposób struktura w postaci łańcucha peptydowego nawiniętego prawoskrętnie na wirtualny walec (kolumnę)
Na jeden skręt przypada 3,6 AA
Helisy mogą być zarówno długie- kilkadziesiąt AA, jaki i krótkie- kilka AA.
Wiązania stabilizujące helisę decydują o tym, że ta struktura likwiduje polarność łańcucha polipeptydowego. Występują więc one licznie w białkach błonowych, które nie mogą być polarne, bo błony mają charakter silnie niepolarny i hydrofobowy
( szczerze mówiąc to nie mam pojęcia, czy on mówi o niwelowaniu wpływu tych 2 ww. wymienionych grup, czy też o wiązaniach wodorowych między łańcuchami bocznymi, które owszem także stabilizują helisę; Staroń mówił bowiem coś o tym, że istnieją łańcuchy boczne polarne w helisach, a ich obecność jest niepożądana w białkach błonowych i to dobrze, że są wiązania wodorowe, bo likwidują ładunki; zatem mi się wydaje, że chodzi o te dodatkowe oddziaływania między grupami bocznymi- sorry za zawiłość, ale sama sluchałam to 10x żeby obczaić o co mu chodzi, a i tak wyciągnęłam własne wnioski )