mikroflorę solanek oraz drobnoustroje wniesione z mięsem, takie jak pałeczki z grupy okrężnicy (co//), enterokoki, bakterie z rodzaju Hacillus, Clostridium i Pseudomonas. Zbytni rozwój pałeczek z rodzaju Pseudomonas jest wskaźnikiem psucia się solanek. Powstaje wówczas tzw. błoto.
Bakterie halofilne występują wśród rodzajów Achromobacter, Pseudomonas, Micrococcus, Sarcina i GaJJkya. Najczęściej w solankach występują halofile z rodzajów: Achromobacter, Pseudomonas, Micrococcus i Yihrio. Typowe bakterie halofilne nie rozwijają się w stężeniach poniżej 1%. Halofile umiarkowane rozwijają się w stężeniach 1-20% soli. Występują też takie halofile, które nie rozwijają się w stężeniach niższych niż 15% oraz takie, które rozwijają się w 31-procentowych (nasyconych) roztworach soli.
Oprócz soli kuchennej do solanek dodaje się azotyn sodowy, azotan sodowy i cukier. Azotyny i azotany (po redukcji) są źródłem NO, który, łącząc się z mio-globmą, daje odporny na temperaturę barwnik nitrozomioglobinę. Azotany muszą być uprzednio zredukowane do azotynów przez mikroflorę denitryfikującą solanki, przede wszystkim przez rodzaje Micrococcus i Yihrio. Azotany i azotyny działają bakteriostatycznie na bakterie chorobotwórcze występujące w solance, takie jak Clostridium botulinum i Staphylococcus aureus, którym nie szkodzi wysokie stężenie soli.
Pożyteczna mikroflora solanek powinna:
- rozmnażać się w stężeniach soli do 20%,
- rozmnażać się w temperaturze 4-6°C,
- redukować azotany do azotynów,
- rozkładać cukry z wydzieleniem kwasów,
- występować w ilościach 10-10 komórek w 1 cm .
W solankach mogą występować następujące drobnoustroje szkodliwe:
1) Lactobacillus viridescens powodujący zielenienie mięsa,
2) pałeczki z grupy okrężnicy, których liczba zmniejsza się z czasem,
3) enterokoki oporne na wyższe stężenie soli utrzymujące się w solance dłużej niż co//,
4) gronkowce koagulazododatnie (chorobotwórcze) oporne na sól,
5) salmonelle utrzymujące się w solance przez mniej więcej miesiąc.
Mikroflora mięsa ryb odpowiada mikroflorze wody, w której ryby przebywają a więc są to psychrofile z rodzaju Pseudomonas, Achromobacter, Flavohacterium oraz Micrococcus. W przewodzie pokarmowym ryb występują bakterie z grupy okrężnicy oraz beztlenowce przetrwalnikujące Clostridium botulinum i C. tetanl Najwięcej drobnoustrojów znajduje się na skórze, skrzelach i w przewodzie pokarmowym ryb. Po złowieniu ryb drobnoustroje rozkładają ich tkankę mięsną. Rozkład ten zostaje przyspieszony, gdy w czasie transportu lub zabiegów technologicznych ryba zostanie zakażona treścią przewodu pokarmowego.