Do kolby (a) wrzucić porcelankę i starannie wysuszoną całość zważyć z dokładnością do 1 mg. Kolbę połączyć z ekstraktorem i umieścić w łaźni wodnej. Następnie 2-5 g tkanki wysuszonej do stałej wagi i roztartej starannie w moździerzu odważyć z dokładnością do 0,01% i przenieść ilościowo do torebki. Torebkę umieścić w ekstraktorze tak, aby górna jej część znajdowała się poniżej najwyższego punktu rurki przelewowej.
Ekstraktor napełnić eterem do zagięcia rurki syfonu i po spłynięciu rozpuszczalnika do kolby dodać jeszcze około 0,5 objętości eteru (ilość eteru dodanego nie może przekraczać objętości pustego ekstraktora). Ekstraktor połączyć z chłodnicą wodną i włączyć ogrzewanie kolby z eterem (autotransformator w poz. 100). Następuje ciągłe napełnianie ekstraktora skroplonym eterem i przelewanie eteru do kolby, w wyniku czego tłuszcze zostają wyekstrahowane z tkanki. Czas potrzebny na całkowite odtłuszczenie wynosi dla większości tkanek 2-4 godz.
Koniec ekstrakcji można ustalić za pomocą próby odparowania eteru. W tym celu po wyłączeniu ogrzewania i ustaniu wrzenia należy zdjąć chłodnicę i nieco eteru z ekstraktora przenieść na czyste, odtłuszczone szkiełko zegarkowe. Proces ekstrakcji jest zakończony wówczas, gdy po wyparowaniu eteru ze szkiełka nie pozostają na nim ślady tłuszczu.
Po skończonej ekstrakcji (w ćwiczeniu po 2 godz. Ekstrakcji — 3-4 pełne przelewy) przelać eter z ekstraktora (przez boczną rurkę) do kolby, wyjąć torebkę, a ekstraktor ponownie połączyć z kolbą i chłodnicą i oddestylować całą zawartość eteru z kolby do ekstraktora (opróżniać ekstraktor gdy poziom ekstraktu za każdym razem przekroczy % wysokości syfonu). Kolbę z ekstraktem tłuszczowym wysuszyć w gorącej łaźni wodnej w ciągu 5 min i pozostawić do następnego ćwiczenia w kolbie zamkniętej korkiem szklanym.
Następnie w ciągu 30 min w temp. 90°C suszyć w suszarce, do stałej wagi. Po wystudzeniu zważyć kolbę z dokładnością do 1 mg. Zawartość tłuszczu wyrazić w procentach suchej masy materiału odtłuszczanego.
% zawartość tłuszczu = 100 {a -b)/c,
gdzie: a -masa kolby wraz z pozostałością lipidową w gramach, b -masa samej kolby w gramach, c -ilość gramów odtłuszczanego materiału.