GENETYKA
Populacja - zespół osobników zamieszkujących określone środowisko, swobodnie się krzyżujących i dających płodne potomstwo
Populację można traktować jako zbiór alleli, a ich stosunki ilościowe mogą ulegać zmianie w czasie i przestrzeni
Populacja mendlowska - zespół osobników, które krzyżują się między sobą na zasadzie losowego kojarzenia się par
Pula genów - cała inf. genetyczna zakodowana we wszystkich genach wyst. w populacji mendlowskiej w danym czasie
Prawo Hardy-Weinberga: w dużej panmiktycznej populacji zarówno frekwencja genów jak i genotypów jest stała z pokolenia na pokolenie
Jeśli pominąć mutacje, migracje i selekcję, populacja taka jest w stanie „równowagi Hardy-Weinberga”
Częstość genotypów równa się:
(p+q)2
p = częstość allelu a
q - częstość allelu A
(gdy są tylko dwa allele)
Zatem: aa=p2, AA=q2, Aa=2pq
|
MM |
MN |
NN |
razem |
liczba osobników |
36 |
48 |
16 |
100 |
liczba alleli M |
72 |
48 |
0 |
120 |
liczba alleli N |
0 |
48 |
32 |
80 |
całkowita liczba alleli |
72 |
96 |
32 |
200 |
Prawo Hardy-Weinberga - założenia:
populacja musi być dostatecznie duża (próbkowanie nie powinno zaburzyć wyników)
krzyżowanie jest losowe
żaden genotyp nie ma korzyści selekcyjnej (są równo żywotne i płodne)
brak mutacji, migracji i losowego dryfu genetycznego
allele wielokrotne:
grupa krwi - allele AB0
p(A) + q(B) + r(0) = 1
rozkład genotypów (p+q+r)2
rozkład genotypów:
A gdy IAIA i Iai - (p2+2pr)
B gdy IBIB i Ibi
…
…
Geny sprzężone z płcią
W zachodniej Europie odmiana ślepoty na kolory sprzężona z płcią występuje u 8% mężczyzn (q=0,08)
Ponieważ kobiety mają dwa chromosomy X częstość choroby u nich wynosi q2 a zatem 0,0064 co znaczy, że tylko 64/10000 ma tą cechę
Geny sprzężone z płcią - stan rownowagi
Jeśli częstość alleli sprzężonych z płcią różni się u obu płci to populacja nie jest w stanie równowagi.
Po kilku pokoleniach następuje zbliżenie do rownowagi.
Obliczanie częstości wyst. heterozygot
Albinizm (autosomalna recesywna cecha) - częstość występowania 1/10000 (q2=0,0001) częstość tego allelu to pierwiastek z 0,0001 = 1%
ponieważ p+q=1
p=0,99
q=0,01
2pq=2 * 0,99 * 0,01 = 0,02
2% osób w populacji jest nosicielami
Czynniki wpływające na częstość alleli w populacji
nielosowe kojarzenie się osobników (gdyby np. częściej kojarzyli się ze sobą osobniki MM z NN niż z innymi to wzrósłby w populacji procent heterozygot MN)
migracje
częstość allelu w następnym pokoleniu
p'=mpm+(1-m)p
gdzie m i 1-m określają względny udział migrantów i nie migrantów w genetycznej strukturze nowego pokolenia
mutacje
mutacje są losowe i bezkierunkowe; dla mutacji dominujących można stosować bezpośrednią metodę obliczania, jednak pod trzema warunkami:
musi ona produkować fenotyp różny od powstającego pod wpływem alleli recesywnych
cecha musi ulegać pełnej ekspresji (daje to możliwość identyfikacji mutanta)
cecha ta nie może powstawać pod wpływem czynników niegenetycznych (np. leki, środki chemiczne)
selekcja
bez działania selekcji mutacje można pomijać przy analizie czestości genów.
Rzadko w naturze istnieje równość między AA, Aa i aa jeśli chodzi o żywotność i płodność.
Jeśli aa jest bezpłodne, można obliczyć, że częstość allelu w pokoleniu n przy takiej selekcji będzie: qn=q0/(1+nq0)
np. q0 = ½ tp w nast. pokoleniu ¼, potem 1/5 itp.
Uwzględniając współczynnik selekcji „s”, np. s=0,01 (co znaczy że 99% osobników z danym genotypem odnosi sukces reprodukcyjny) można zmodyfikować wzór:
q1=q0-sq02/(1-………
pojęcie fitness („dostosowanie”)
definiuje się jako: 1-s
gdzie s to współczynnik selekcji
typy doboru naturalnego
dobór stabilizujący: eliminuje z populacji osobniki o skrajnych wartościach cech
dobór kierunkowy: eliminuje z populacji osobniki tylko z krańca rozkładu cech
dobór różnicujący: eliminuje z populacji osobniki o średnich wartościach cech
dryf genetyczny:
nieregularne (losowe) fluktuacje frekwencji genów zachodzące na skutek ograniczonej liczebności reprodukcyjnej w populacji, np. gwałtowna redukcja w populacji, w której eliminacji uległo wiele alleli
W wyniku dryfu genetycznego zwiększa się różnica między populacjami a zmniejsza wewnątrz populacji
Przypadkami dryfu mogą być:
efekt wąskiego gardła („bottleneck effect”)
efekt założyciela
3