1. Aminokwasy
a) budowa
Aminokwasy (ang. aminoacids = aa), jak sama nazwa wskazuje, należą do dwufunkcyjnych pochodnych węglowodorów, zawierających w cząsteczce grupę karboksylową oraz aminową. Ogólnie rzecz biorąc, względne położenie obu tych grup może być dowolne, jednak zdecydowanie największe znaczenie posiadają a-L-aminokwasy, ze względu na to, iż wchodzą w skład peptydów i białek. Określenie a-aminokwasy oznacza, iż obie główne grupy funkcyjne przyłączone są do tego samego, I-rzędowego atomu węgla; wynika stąd ich wzór ogólny postaci: H2N-CH(R)-COOH, gdzie R jest fragmentem zmiennym, charakterystycznym dla każdego aa i decydującym o jego właściwościach. Aa mogą również ulegać w organizmie rozmaitym modyfikacjom, np. hydroksylacji (4-hydroksy-Pro, 5-hydroksy-Lys), karboksylacji (y-karboksy-Glu), metylacji, formylacji, acetylacji (N-Ac-Glu), prenylacji, fosforylacji i innym.
b) nazewnictwo i wzory
Każdy aa białkowy posiada nazwę systematyczną, wynikającą z jego budowy chemicznej, jak również zwyczajową. W praktyce posługuje się wyłącznie tymi drugimi, jak również ich skrótami - trój- oraz jednoliterowymi. Nazwy zwyczajowe aa białkowych, ich skróty oraz wzory strukturalne przedstawia poniższa tabela.
Lp. |
Nazwa zwyczajowa i skróty |
Wzór strukturalny | |
1. |
glicyna, Gly, G |
H+- |
, z-o • % |
2. |
alanina, Ala, A |
h3c- |
-CH-cf° ^h3 |
3. |
walina, Val, V |
h3C\ !" p\ CH-hCH-C i ur' €>' Yr M3l | NH3 | |
4. |
leucyna, Leu, L |
H3C\ P CH-CH9-(-CH-C i H J'/ * €>' Y® M3l vNH3 0 | |
5. |
izoleucyna, Ile, I |
h3c-h2c\ i P i | |
6. |
seryna, Ser, S |
P CH?^CH-0 A OH NH3 0 | |
7. |
treonina, Thr, T |
p HoC-CH-CH-C _ 3 ' <&' Ye OH YlH3 u | |
8. |
cysteina, Cys, C |
ch9 1 2 SH |
p -CH-C ^ €>! Y° nh3 0 ; |
-7-