1
WPROWADZENIE DO MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ – PODSTAWOWE DEFINICJE I POJĘCIA.
BAKTERIE, WIRUSY, GRZYBY.
MIKROBIOLOGIA MEDYCZNA zajmuje się mikroorganizmami wywołującymi choroby u ludzi.
Opisuje czynniki etiologiczne chorób, ich przebieg, sposoby leczenia i profilaktyki.
Do drobnoustrojów chorobotwórczych zaliczamy:
drobnoustroje eukariotyczne – GRZYBY np. Candida albicans, Cryptococcus neoformans, Aspergillus
flavus
drobnoustroje prokariotyczne – BAKTERIE np. Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes,
Clostridium difficile
formy bezkomórkowe – WIRUSY np. wirus Epstein – Barr (EBV), wirus cytomegalii (CMV), wirus
zapalenia wątroby typu B (WZW B); PRIONY
BAKTERIE
mikroorganizmy prokariotyczne
brak jądra komórkowego, materiał genetyczny DNA (kwas dezoksyrybonukleinowy) zlokalizowane w
cytoplazmie w postaci nukleoidu (chromosom bakteryjny)
rozmnażanie przez podział komórki
zdolność do horyzontalnego transferu genów – nabywania DNA od innych mikroorganizmów i włączania
go do własnego genomu
KSZTAŁTY KOMÓREK BAKTERII
bakterie kuliste, ziarniaki
• dwoinki np. Neisseria meningitidis (dwoinka zaplenia opon mózgowo-rdzeniowych), Neisseria
gonorrhoeae (dwoinka rzeżączki)
• paciorkowce np. Streptococcus pyogenes, Stretococcus pneumoniae
• gronkowce np. Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis
bakterie cylindryczne
• pałeczki np. Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Proteus mirabilis
• laseczki np. Clostridium perfringens (laseczka zgorzeli gazowej), Clostridium tetani (laseczka tężca),
Clostridium difficile, Clostridium botulinum (laseczka jadu kiełbasianego), Bacillus anthracis, Bacillus
cereus
• maczugowce np. Corynebacterium diphteriae (maczugowiec błonicy)
bakterie spiralne
2
• przecinkowce np. Vibrio cholerae
• krętki np. Treponema pallidum, Borrelia burgdonferi
UKŁADY KOMÓREK
pary
dwoinki
grona
gronkowce
łańcuchy
paciorkowce
BUDOWA KOMÓRKI BAKTERYJNEJ
CYTOPLAZMA
zawieszone są w niej biologicznie czynne struktury (nukleoid, plazmidy, rybosomy, ciałka wtrętowe)
NUKLEOID (CHROMOSOM BAKTERYJNY)
odpowiednik jądra komórkowego u Eukaryota
nie jest oddzielony od cytoplazmy błoną jądrową
pojedyncza, kolista cząsteczka dwuniciowego DNA
zawiera informację genetyczną dotyczącą właściwości komórek bakteryjnych, ich cechy strukturalne i
funkcjonalne
PLAZMIDY
pozachromosomalne, dwuniciowe, koliste cząsteczki DNA
zdolne do autonomicznej replikacji, niezależnej od chromosomu
niosą geny odpowiedzialne za oporność na leki przeciwbakteryjne i metale ciężkie, wytwarzanie
czynników zjadliwości, antybiotyków i bakteriocyn
RYBOSOMY
odpowiedzialne za syntezę białek
BŁONA CYTOPLAZMATYCZNA
typowa struktura trójwarstwowa
zbudowana z lipidów oraz białek
jako półprzepuszczalna stanowi barierę osmotyczną komórki, kontroluje wnikanie i usuwanie różnych
substancji
często tworzy wpuklenia do wnętrza komórki, z których powstają wewnętrzne struktury takie jak
mezosomy
ŚCIANA KOMÓRKOWA
stanowi barierę ochronną przed czynnikami zewnętrznymi fizycznymi i chemicznymi, a także przed
innymi mikroorganizmami
3
podstawowym jej składnikiem jest peptydoglikan (mureina) - polimer zbudowany z łańcuchów
polisacharydowych, które połączone są polipeptydami
ŚCIANA KOMÓRKOWA
BAKTERIE GRAM(+)
gruby peptydoglikan
kwasy tejchojowe
w komórkach kwasoopornych obecność kwasu mykolowego (np. Mycobacterium tuberculosis)
białka powierzchniowe
BAKTERIE GRAM(-)
cienki peptydoglikan
brak kwasów tejchojowych
błona zewnętrzna: fosfolipidy, lipopolisacharyd (LPS), białka
LIPOPOLISACHARYD
składa się z części lipidowej (lipid A), rdzenia bogatego w polisacharydy oraz bocznego łańcucha
polisacharydowego (antygen somatyczny O)
występuje u bakterii Gram-ujemnych
endotoksyna
uwalniany w czasie lizy komórki bakteryjnej
aktywuje układ immunologiczny makroorganizmu
odpowiedzialny za rozwój posocznicy i objawów wstrząsu septycznego
BARWIENIE METODĄ GRAMA – podstawowe barwienie w bakteriologii, różnicujące bakterie na
Gram-dodatnie i Gram-ujemne.
- bakterie Gram-dodatnie – barwią się na fioletowo np. bakterie z rodzju Staphylococcus, Streptococcus,
Enterococcus, Clostridium, Bacillus
- bakterie Gram-ujemne – barwią się na różowo np. pałeczki Gram-ujemne z rodziny Enterobacteriaceae
(E.coli, Salmonella, Shigella, Yersinia, Klebsiella, Proteus, Enterobacter, Citrobacter, Morgalella,
Serratia), Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter spp., Haemophilus spp.)
BAKTERIE O NIETYPOWEJ BUDOWIE ŚCIANY KOMÓRKOWEJ
Mycoplasma, Ureoplasma
• brak peptydoglikanu
Mycobacterium
• obecność kwasów mykolowych, nie barwią się metodą Grama, stosuje się barwienie Ziehl-Neelsena
Chlamydie
• ściana komórkowa zbudowana z lipopolisacharydów
Riketsje
• ściana komórkowa zbudowana z mukopolisacharydów i aminokwasów
4
FORMY PRZETRWALNE BAKTERII (ENDOSPORY), PRZETRWALNIKI
wytwarzane przez bakterie z rodzaju. Bacillus spp. i Clostridium spp.
rola - przetrwanie w niekorzystnych warunkach życia (brak składników odżywczych, wody)
sporulacja - proces tworzenia przetrwalnika
germinacja- przejście w formę komórki wegetatywnej
są odporne na działanie szkodliwych czynników zewnętrznych
OTOCZKI
przylegają do zewnętrznej powierzchni ściany komórkowej
zbudowane z polisacharydów, wyjątek: otoczka polipeptydowa u Bacillus anthracis
chronią komórkę bakteryjną przed wysychaniem
ułatwiają adhezję
uniemożliwiają fagocytozę, chronią komórkę bakteryjną przed strawieniem po wchłonięciu jej przez
fagocyta
RZĘSKI
zbudowane z kurczliwego białka- flageliny
struktury umożliwiające czynny ruch
FIMBRIE (PILI)
zbudowane z białka piliny
fimbrie zwykłe występują u licznych bakterii Gram-ujemnych z rodziny Enterobacteriaceae, rodzaju
Pseudomonas, Haemophilus i dwoinki rzeżączki, biorą udział w adhezji i kolonizacji
fimbrie płciowe (fimbrie typu F) służą do przenoszenia DNA podczas koniugacji
ZIARNA CYTOPLAZMY (ciałka wtrętowe, ziarnistości zapasowe)
są to zapasowe substancje odżywcze
charakterystyczne są ziarnistości występujące u Corynebacterium diphtheriae określane, jako ciałka
Ernsta-Babesa
ZAPOTRZEBOWANIE BAKTERII NA TLEN
BEZWZGLĘDNE TLENOWCE (AEROBY OBLIGATORYJNE) - rosną tylko w obecności tlenu i
czerpią energię drogą oddychania tlenowego (np. Pseudomonas spp.)
BEZWZGLĘDNE BEZTLENOWCE (ANAEROBY OBLIGATORYJNE) - rosną tylko w
nieobecności tlenu, czerpią energię drogą beztlenową (np. Clostridium spp.)
WZGLĘDNE BEZTLENOWCE (ANAEROBY FAKULTATYWNE) -rosną zarówno w warunkach
tlenowych, jak i beztlenowych, stanowią większość bakterii chorobotwórczych (np. E.coli)
BAKTERIE MIKROAEROFILNE - namnażają się w atmosferze o obniżonym ciśnieniu parcjalnym
tlenu do 5% (np. H.pylori, Neisseria spp.)
5
WPŁYW TEMPERATURY NA WZROST BAKTERII
BAKTERIE PSYCHROFILNE
BAKTERIE MEZOFILNE - najlepiej rosną w temperaturze 20°C - 45°C. Należy do nich większość
bakterii chorobotwórczych.
BAKTERIE TERMOFILNE
TRANSPORT ŻELAZA
Systemy transportu żelaza u bakterii:
tworzenie SIDEROFORÓW- wykazują duże powinowactwo do żelaza, wychwytują je z kompleksów
białkowych, wydzielane do środowiska w warunkach niedoboru tego pierwiastka
obecność swoistych receptorów, które wiążą bezpośrednio żelazo
GRZYBY
jedno- lub wielokomórkowe organizmy eukariotyczne
w odróżnieniu od bakterii posiadają jądro komórkowe z błoną jądrową, mitochondria oraz siateczkę
endoplazmatyczną (ER)
mają sztywną ścianę komórkową, zbudowaną z chityny, mannanu, glikanu
wytwarzają strzępki oraz zarodniki (konidia)
GRZYBNIA (MYCELLIUM)
struktura grzybni może być różna w zależności od gatunku, warunków wzrostu, obecności substancji
pokarmowych w podłożu i innych czynników
u grzybów wyżej zorganizowanych strzępki grzybni podzielone są poprzecznymi ścianami (septami) na
wiele komórek, z których każda posiada jedno lub wiele jąder (grzybnia wielokomórkowa)
Typy grzybni
Grzybnia wegetatywna
• rozwija się zarówno na powierzchni, jak i w głębi pożywki
• jej funkcją jest pobieranie pokarmu i przytwierdzanie do podłoża
Grzybnia generatywna (powietrzna, rozrodcza)
• służy do rozmnażania bezpłciowego i płciowego
• strzępki wyrastają ponad powierzchnię podłoża (strzępki powietrzne)
• wykazuje duże zróżnicowanie form w zależności od rodzaju grzybów
Klasyfikacja grzybów:
Drożdżaki i grzyby drożdżopodobne (np.gatunki Candida, Cryptococcus, Pityrosporum, Geotrichum)
Grzyby pleśniowe (np. Aspergillus)
Grzyby dermatofitowe (np. Trichophyton, Epidermophyton, Microsporum)
Grzyby dimorficzne (np. Blastomyces dermatidis, Histoplasma capsulatum)
6
Rodzaje grzybic
GRZYBICE POWIERZCHNIOWE (SKÓRNE) - wywołują je dermatofity, schorzenia te ograniczają
się do zewnętrznej warstwy skóry, włosów i paznokci
GRZYBICE PODSKÓRNE - ograniczone do tkanki podskórnej, rzadko przechodzą w grzybicę
uogólnioną
GRZYBICE UOGÓLNIONE - dotyczą narządów wewnętrznych, są zakażeniami ogólnoustrojowymi
Grzybice
Drożdżyca, kandydoza, bielnica (candidiosis)
grzybica, oportunistyczna, infekcja skóry, błon śluzowych, paznokci, rzadko infekcja uogólniona
choroba ta najczęściej jest wywołana drożdżakami chorobotwórczymi z rodzaju Candida (szczególnie
Candida albicans)
drożdżycę rozpoznaje się głównie poprzez badania mikroskopowe i hodowlane
Do czynników sprzyjających występowaniu drożdżycy zalicza się:
upośledzona odporność komórkowa albo neutropenia
zabiegi inwazyjne (długotrwałe cewnikowanie, wszczepienie sztucznej zastawki serca)
nadmierna otyłość, cukrzyca, ciąża
upośledzona odporność wywołana przez stosowanie antybiotyków (wyniszczających florę bakteryjną
organizmu) lub leków obniżających odporność (np. leki immunosupresyjne, sterydy, leki stosowane w
chemioterapii nowotworów)
alkoholizm (zwiększa ryzyko drożdżycy pokarmowej)
WIRUSY
najmniejsze czynniki zakaźne
składają się z białek i kwasu nukleinowego (DNA lub RNA)
bezwzględne pasożyty wewnątrzkomórkowe
zakażają bakterie (bakteriofagi), rośliny, zwierzęta i ludzi
nie posiadają struktur komórkowych występujących u innych drobnoustrojów
nie mają własnych układów metabolicznych i są uzależnione od procesów syntezy zachodzących w żywej
komórce gospodarza
wykorzystują prawidłowy metabolizm komórek, dostarczając do nich swoją własną informację genetyczną
(kwas nukleinowy). Zakażona komórka przyjmuje kwas nukleinowy wirusa i zaczyna produkować
komponenty nowych cząstek wirusowych
mogą nadawać ważne nowe właściwości komórkom, w których się namnażają
BUDOWA WIRUSA
genom wirusa to DNA lub RNA, zawiera informację o budowie i właściwościach przekazywanych
potomnym generacją wirusów. Koduje wirusowe białka strukturalne i enzymy konieczne do ekspresji
wirusowych genów i replikacji genomu.
7
nukleinowy rdzeń otoczony jest białkowym płaszczem – KAPSYD, strukturalne jednostki kapsydu to
kapsomery
kapsyd i rdzeń nukleinowy - łącznie określane są mianem NUKLEOKAPSYDU
nukleokapsyd może być nagi lub okryty dodatkową osłonką
Cząsteczka wirusa zawierająca kwas nukleinowy otoczony przez białko lub/i inne komponenty makrocząsteczkowe
jest nazywana wirionem.
KAPSYD
chroni kwas nukleinowy (genom)
zbudowany z kapsomerów
uczestniczy w adsorpcji i wnikaniu wirusa do komórki gospodarza przez interakcje z receptorami
znajdującymi się w jej błonie komórkowej
OSŁONKI
złożone głównie ze składników komórki gospodarza
mogą zawierać też składniki kodowane przez genom wirusa
wirus nabywa osłonkę podczas wypączkowywania z błony cytoplazmatycznej (w. grypy) lub błony
jądrowej (w. opryszczki)
osłonka białkowa i osłonka białkowo-lipidowa lub białkowo-cukrowa – posiadają właściwości antygenowe
i pobudzają tworzenie przeciwciał
wspomagają proces absorpcji wirusa na błonie komórki żywiciela (hemaglutynina w. grypy)
u niektórych wirusów zawierają enzymy potrzebne do procesu przenikania przez błonę komórkową,
zarówno podczas infekowania, jak i wydostawania się z komórki po replikacji (neuraminidaza w. grypy)
BIAŁKA WIRUSOWE
strukturalne- składniki kapsydu i osłonek
enzymatyczne- występują wewnątrz wirionu lub pojawiają się w zainfekowanej komórce
np. polimerazy wirusowe, proteazy, endonukleazy, ligazy
KLASYFIKACJA WIRUSÓW- KRYTERIA
typ kwasu nukleinowego (DNA lub RNA)
liczba nici kwasu nukleinowego i ich postać
polarność genomu wirusowego
obecność lub brak osłonki
obecność enzymów
symetria nukleokapsydu
8
FAZY REPLIKACJI WIRUSOWEJ (NAMNAŻANIA WIRUSÓW)
ROZPOZNANIE I ADSORBCJA wirusa do powierzchni wrażliwej komórki
PENETRACJA (WNIKANIE) wirusa do komórki
ODPŁASZCZANIE kwasu nukleinowego wirusa. Po zakończeniu procesu odpłaszczania nie stwierdza
się cząstek zakaźnych wirusa, oznacza to początek fazy eklipsy- cyklu replikacyjnego.
BIOSYNTEZA SKŁADNIKÓW WIRUSA (kwasu nukleinowego oraz białek)
DOJRZEWANIE cząstek wirusowych- oznacza koniec fazy eklipsy. Zreplikowane kwasy nukleinowe i
białka łączą się tworząc nukleokapsydy i wiriony.
UWALNIANIE potomnych wirusów z komórki w wyniku pączkowania, lizy zakażonej komórki. Niektóre
wirusy nie są uwalniane do przestrzeni międzykomórkowej, ale do sąsiednich komórek na skutek fuzji błon
komórkowych lub przez pory łączące błony komórkowe.
FAZA EKLIPSY lub UTAJENIA replikacja genomu, prowadząca do syntezy kwasu nukleinowego i
wirionowych białek. W tej fazie zakażenia maleje liczba zakaźnych cząstek wirusa.
PRIONY
białkowe cząstki zakaźne
są formami patologicznymi białka PrP
C
(izoforma komórkowa, prawidłowa) zwanymi PrP
Sc
(izoforma
infekcyjna) lub produktami zmutowanego genu komórkowego
nie zawierają kwasów nukleinowych
charakteryzują się wysoką opornością na liczne czynniki fizyko-chemiczne
CHOROBY PRIONOWE
występują zarówno u ludzi, jak i zwierząt
charakteryzują się zmianami degeneracyjnymi w obrębie CUN, co jest związane z odkładaniem się w
mózgu płytek amyloidu oraz długotrwałym okresem inkubacji
np. choroba Creutzfeldta-Jacoba, choroba curu, śmiertelna dziedziczna bezsenność
priony są oporne na rutynowo stosowane techniki sterylizacji, zalecane jest stosowanie narzędzi
jednorazowych do zabiegów i do pobierania materiału do badań od chorych. W przypadku konieczności
przeprowadzenia dekontaminacji narzędzi wielorazowego użytku stosuje się moczenie w NaOH przez
godzinę, a następnie autoklawowanie w temperaturze 134°C przy 2-3 atm. przez 60 min.