GENETYKA ROZWOJU
1. Specjalizacja i totipotencja komórek
2. Muszka owocowa – organizm modelowy genetyki rozwoju
2. Muszka owocowa – organizm modelowy genetyki rozwoju
3. Mechanizmy rozwoju embrionalnego muszki
4. Paralelizm genów homeotycznych
1. Specjalizacja i totipotencja komórek
a) Reguł
ą
jest,
ż
e wszystkie komórki organizmu
wielokomórkowego posiadaj
ą
cały genom, a
ró
ż
ni
ą
si
ę
jedynie ekspresj
ą
poszczególnych
genów.
b) U ro
ś
lin i u wielu zwierz
ą
t ka
ż
da komórka
b) U ro
ś
lin i u wielu zwierz
ą
t ka
ż
da komórka
mo
ż
e rozwin
ąć
si
ę
w cały organizm – mówimy,
ż
e
komórki s
ą
totipotencjalne.
c) U ssaków, komórki maj
ą
silne
zmiany epigenetyczne
Przez dziesi
ą
tki lat uwa
ż
ano,
ż
e
wzorce epigenetyczne komórek
wczesnych embrionów i komórek
somatycznych s
ą
na tyle ró
ż
ne,
ż
e
klonowanie ssaków jest niemo
ż
liwe
… a
ż
do roku 1996, gdy sklonowano
Dolly
Dolly
- Przy klonowaniu Dolly, j
ą
dro z
komórek sutka owcy przeniesiono do
komórki jajowej a tak
ą
komórk
ę
komórki jajowej a tak
ą
komórk
ę
wszczepiono do macicy.
- Sklonowano te
ż
małpy, myszy, konie i inne ssaki. Sklonowna kotka (lewa) była
jednak inna ni
ż
matka. Miała inne wymiary, ubarwienie i inn
ą
‘koci
ą
osobowo
ść
’.
- Powa
ż
niejsze problemy klonowania ssaków to bardzo niska efektywno
ść
procedury
i anormalno
ść
anatomiczna i metaboliczna klonów
- Mniej spektakularne a potencjalnie bardzo wa
ż
ne, jest u
ż
ywanie komórek z
wczesnego embrionu do klonowania całego organizmu.
Czy klonowanie stanie si
ę
form
ą
terapii?
Przez klonowanie rozumiemy tutaj
uzyskanie organizmu z komórki innej ni
ż
zygota.
Takie podej
ś
cie wymaga generowania
zarodków, prawdopodobnie du
ż
ej ich
liczby, z których wiele zostanie
liczby, z których wiele zostanie
zniszczonych, co budzi opory etyczne.
Ostanie lata przyniosły niezwykły post
ę
p
w uzyskiwaniu komórek toti- i
pluripotentnych – niektóre nie wymagaj
ą
zabijania zarodków
(Totipotencja – zdolno
ść
‘do wszystkiego’,
pluripotencja – zdolno
ść
do zró
ż
nicowania
si
ę
w 3 podstawowe listki zarodkowe)
Trzy
ź
ródła pozyskania komórek
pluripotentnych z
ż
ywych
organizmów:
- Z wczesnych embrionów (ES cells)
- Z komórek generatywnych pó
ź
nych
embrionów (EG cells)
-Ze spermatogoniów dorosłych
organizmów (gPS cells)
Trzy
ź
ródła z hodowli
komórkowych:
-Fuzje komórki macierzystej i
somatycznej (Cell fusion)
- J
ą
dro somatyczne do oocytu (NT-
ES fusion)
- Pluripotencja indukowana (iPS
cells)
Czy klonowanie stanie si
ę
form
ą
terapii?
Do zabiegów nie wymagaj
ą
cych manipulowania obcymi (pochodz
ą
cymi z
innego organizmu) komórkami nale
żą
:
- odnajdowanie komórek pluripotentnych w dorosłych organizmach (np. z j
ą
der)
- odnajdowanie komórek pluripotentnych w dorosłych organizmach (np. z j
ą
der)
- przekształcanie komórek somatycznych w pluripotentne (klasyczne iPS)
- przekształcanie jednych komórek somatycznych w innekowe)
Komórki pluripotencjalne
z j
ą
der dorosłych m
ęż
czyzn
(listopad 2008, zespół niemiecki)
POSZUKIWANIE ISTNIEJ
Ą
CYCH KP
- stosuj
ą
c biopsje pobrano pewn
ą
liczb
ę
komórek
- hodowano je na podło
ż
u dla komórek
embrionalnych
- monitorowano by znale
źć
podobne do
embrionalnych
- obiecuj
ą
ce wszczepiono myszom z
immunodepresj
ą
- rozwin
ę
ły si
ę
grupy komórek ludzkich, w
których mo
ż
na było znale
źć
wszystkie
trzy listki zarodkowe
INDUKOWANIE komórek
pluripotencjalnych (iPS)
z komórek somatycznych
2006 – dwójka Japo
ń
czyków
wykazała,
ż
e nadekspresja 4
czynników traskrypcyjnych (białek)
indukuje pluripotencj
ę
fibroblastów
myszy
2007- dwa zespoły dokonały tego dla
komórek ludzkich (
3
-4), czynniki
transkrypcyjne
2008 – nadekspresj
ę
przeprowadzono z nie integruj
ą
cych
si
ę
adenowirusów, a nie jak wcze
ś
niej
z retrowirusów
Kilka białek (c-Myc,
Oct4
,
Sox2
,
Klf4
) ł
ą
czy si
ę
z DNA w
miejscach promotorowych,
prawdopodobnie ka
ż
dy w
wielu, i w ten sposób
zapocz
ą
tkowuje zło
ż
ony proces
przeprogramowania
INDUKOWANIE komórek
pluripotentnych (iPS)
-
co ju
ż
wiadomo
Zmiany metylacji – zag
ę
szczenie
rejonów wa
ż
nych dla komórek
somatycznych
Zmiany metylacji – rozlu
ź
nienie
Zmiany metylacji – rozlu
ź
nienie
rejonów wa
ż
nych dla komórek
pluripotentnych we wczesnych
… i pó
ź
nych fazach przemiany
Aktywacja nieaktywnych
chromosomów X (u samic)
Aktywacja telomerazy
Wzrost długo
ś
ci telomerów
PRZEKSZTAŁCANIE jednych komórek somatycznych w inne
bez etapu po
ś
redniego komórek iPS – rok 2010
Pobrano fibroblasty (góra) i po
hodowli na odpowiednich
podlo
ż
ach z nadekspresj
ą
odpowiednich genów uzyskano
komórki o impulsach błon takich
jak w neuronach (na prawo)
Przekształcanie typów komórek:
1) Somatycznych w iPS (czarna strzałka).
2) Komórki iPS mo
ż
na skierowa
ć
do rozwoju trzech listków
zarodkowych (
ż
ółte strzałki)
3) Komórki somatyczne mo
ż
na przekształca
ć
w inne somatyczne
wewn
ą
trz listka zarodkowego (zielone strzalki) lub mi
ę
dzy listkami
(niebieska)
2. Muszka owocowa – organizm
modelowy genetyki rozwoju
- znakomicie rozpoznana genetyka
(sekwencja DNA i technologia)
- łatwe rozchodzenie sie morfogenów:
najpierw zachodzi zwielokrotnienie
najpierw zachodzi zwielokrotnienie
liczby j
ą
der (do 6 tys.) a dopiero potem
powstaj
ą ś
ciany
2. Muszka owocowa – organizm
modelowy genetyki rozwoju
- cały rozwój trwa kilka dni
3. Mechanizmy rozwoju
embrionalnego muszki
a) Podstaw
ą
ró
ż
nicowania s
ą
gradienty morfogentyczne
Przykład - powstawanie osi długiej -
gdzie najwa
ż
niejsze s
ą
dwa gradienty:
- mRNA bicoid zło
ż
one przez komórki
matki w ko
ń
cu przednim ulega translacji
do białka Bicoid, które w
ę
druje po
do białka Bicoid, które w
ę
druje po
cytoszkielecie w kierunku tyłu jaja
- zdj
ę
cia i rycina pokazuj
ą
gradient
BICOID
- inne gradienty: od strony tylnej jaja
odkładane jest mRNA nanos, jako sygnał
do wykształcania struktur tylnych larwy
do wykształcania struktur tylnych larwy
(nie pokazane)
Wniosek: pocz
ą
tkiem spolaryzowania
jaja s
ą
sygnały ciała matki
b) Ró
ż
nicowanie morfologiczne jest
zaprogramowane jako kaskada
oddziaływa
ń
gradientów
morfogenetycznych, przykład:
Z ciała matki pochodz
ą
sygnały mRNA
⇓
Sygnały mRNA prowadz
ą
do gradientu
długiej osi ciała ju
ż
w jaju
⇓
Te gradienty aktywuj
ą
w ró
ż
nych cz
ęś
ciach
embrionu ró
ż
ne geny “kardynalne” (u
muszki s
ą
to tzw. gap genes) okre
ś
laj
ą
ce
cztery główne strefy ciała larwy; z kolei
geny kardynalne aktywuj
ą
⇓
⇓
geny determinuj
ą
ce
geny homeotyczne
liczb
ę
segmentów
determinuj
ą
ce
to
ż
samo
ść
segmentu
(w co si
ę
rozwinie)
⇓
geny determinuj
ą
ce
polarno
ść
pojedynczego
segmentu
mucha
mysz
4. Paralelizm genów
homeotycznych
Uderzaj
ą
ce jest równoległe uło
ż
enie
kompleksu genów homeotycznych
(homoebox): najpierw geny
odpowiedzialne za odcinki głowowe,
potem tułowiowe, odwłokowe
4. Paralelizm genów
homeotycznych
Uło
ż
eniu genów odpowiada
przestrzenny rozkład gradientów, a
rozkładowi gradientów odpowiada
rozkład form anatomicznych.
Kompleksy homeotyczne myszy,
muchy, robaków i innych zwierz
ą
t s
ą
muchy, robaków i innych zwierz
ą
t s
ą
w oczywisty sposób homologiczne,
powstały około 600 mln lat temu
4. Paralelizm genów
homeotycznych
Warto zauwa
ż
y
ć
,
ż
e owady
przechodz
ą
przeobra
ż
enie zupełne
(odmiennie ni
ż
ssaki), a mimo tak
wielkiej ró
ż
nicy, paralelizm rozwoju
jest zachowany.
IV słupki
II płatki
III pr
ę
ciki
Podobie
ń
stwo programu
rozwojowego ro
ś
lin
U ro
ś
lin wyst
ę
puj
ą
cztery okółki i trzy
grupy genów homeotycznych: A, B, C
I – rozwoj zale
ż
ny od genów A, np.
apetala1 i apetala2
II – zale
ż
y od genów A i B, te drugie to
II płatki
I kielich
II – zale
ż
y od genów A i B, te drugie to
np. apetala3 i pistillata
III – zale
ż
y od genów B i genu C –
agamous
IV – zale
ż
y tylko od genu C
Wymienione geny s
ą
, podobnie jak u
muchy, aktywatorami trakskrypcji