Zmienność
genetyczna,
mutacje, czynniki
mutagenne
Zmienność to występowanie
dziedzicznych lub niedziedzicznych
różnic:
- pomiędzy komórkami danego
organizmu (zmienność
wewnątrzosobnicza)
-
pomiędzy osobnikami tej samej
populacji (zmienność osobnicza)
-
pomiędzy populacjami (zmienność
grupowa)
Ten sam zespół genów w różnych
warunkach może dać różne efekty
fenotypowe
Rozwój organizmu zależy od:
-
genotypu
-
środowiska
Zmienność
dziedziczna
niedziedziczna
mutacje:
-genowe
-
chromosom
owe
-genomowe
(euploidie)
rekombinacje:
-
wewnątrzchromoso
mowe
-
międzychromosomo
we
Rekombinacja
proces wymiany fragmentów DNA między
chromosomami homologicznymi lub
dwuniciowymi fragmentami DNA
nie prowadzi do wytworzenia nowych
alleli genów lecz do powstania różnych
kombinacji genotypów
Rekombinacja w
organizmach
eukariotycznych
losowa segregacja chromosomów
podczas spermatogenezy i oogenezy
losowy dobór partnerów
losowe łączenie się gamet
rekombinacja homologiczna
rekombinacja zlokalizowana
rekombinacja transpozycyjna
rekombinacja
międzychromosomo
wa
rekombinacja
wewnątrzchromosomo
wa
Rekombinacja
homologiczna
crossing over zachodzi głównie podczas
podziału mejotycznego
wymiana regionów homologicznych
pomiędzy dwiema cząsteczkami DNA
po zakończeniu mejozy haploidalne
gamety zawierają informację
pochodzącą od matczynych i ojcowskich
chromosomów
Rekombinacja
transpozycyjna
zachodzi podczas wbudowywania
transpozonów w nowe miejsca genomu
transpozony- ruchome elementy genomu,
zawierają geny kodujące transpozazę-
enzym o aktywności nukleazy
Mutacje
dziedziczna zmiana materiału genetycznego
początkiem mutacji jest zmiana zapisu informacji
genetycznej (tzw. premutacja) wynikająca z
błędnego parowania zasad lub uszkodzenia
cząsteczki DNA
do utrwalenia mutacji konieczna jest jedna lub
dwie rundy replikacji
tylko niektóre premutacje zostają utrwalone w
mutacje
mutacje zachodzące w komórkach płciowych są
przekazywane potomstwu
Mutacja genowa- zmiana genu w nowy allel
Mutacja chromosomowa strukturalna
Mutacja liczbowa- zmiana liczby
chromosomów
Mutacja genomowa- zwielokrotnienie
haploidalnego zestawu chromosomów
Mutacje genowe
Zmiana sekwencji nukleotydów w obrębie genu
na inną od sekwencji nukleotydów genu
wyjściowego:
-
tranzycja
-
transwersja
-
delecja
-
insercja
Konsekwencją mutacji genowych jest zmiana w
układzie aminokwasów białka syntetyzowanego
na bazie danego genu.
Mutacje genowe zachodzą najczęściej
samorzutnie.
substytucje
Tranzycja- zamiana jednej zasady
purynowej na drugą purynową lub
pirymidynowej na pirymidynową
Transwersja- zamiana zasady
purynowej na pirymidynową lub
pirymidynowej na purynową
Delecja
- utrata pojedynczej lub większej
liczby par nukleotydów z danego genu
Jeśli w genie następuje delecja par zasad, w
ilości nie będącej wielokrotnością trzech
wówczas dochodzi do zmiany ramki odczytu-
zwykle prowadzi to do powstania
nieaktywnego produktu genu
Jeżeli delecja dotyczy trzech (albo
wielokrotności trzech) par zasad, wówczas
nie obserwuje się zmiany ramki odczytu, ale
delecję jednego lub więcej aminokwasów
Insercja
(addycja)- wstawienie pojedynczej lub
większej liczby par nukleotydów do danego
genu
Insercja trójki nukleotydów powoduje powstanie
dodatkowego aminokwasu (insercja kodonu
kodującego dany aminokwas pomiędzy dwa
kodony, lub insercja jednego kodonu w drugi z
wytworzeniem dwóch nowych, np. ATT dodane
pomiędzy C i T kodonu CTG daje CATTTG, czyli
CAT TTG).
Jeżeli insercja dotyczy liczby nukleotydów nie
będącej wielokrotnością liczby 3 prowadzi do
przesunięcia ramki odczytu i zmiany wszystkich
kodonów, począwszy od miejsca insercji
Następstwa mutacji w
kodujących obszarach
genów
Zmiana synonimiczna- nowy kodon odpowiada
temu samemu aminokwasowi co kodon
niezmutowany, jest to mutacja cicha ponieważ
nie wpływa na kodującą funkcję genomu Wynika
to z własności kodu genetycznego, w którym jeden
aminokwas może być kodowany przez kilka trojek
kodujących. Może zaistnieć sytuacja, gdzie zmiana
jednego nukleotydu spowoduje, że kodon danego
aminokwasu, zmieni się na inny ale kodujący ten
sam aminokwas (np. leucynowy kodon CUC
zostanie zmieniony na CUU, który również koduje
leucynę).
Następstwa mutacji w
kodujących obszarach
genów c.d.
Zmiana niesynonimiczna- mutacja
„missens”(zmiany sensu), następuje
zmiana kodonu na kodon odpowiadający
innemu aminokwasowi; białko kodowane
przez zmutowany gen będzie zawierało
jeden zmieniony aminokwas (często nie
ma znaczącego wpływu na aktywność
biologiczną białka)
Mutacja nonsens- zmiana kodonu kodującego
aminokwas na terminacyjny (STOP); powstaje
skrócone białko- translacja mRNA zatrzymuje
się na nowym kodonie terminacyjnym; wpływ
mutacji na aktywność białka zależy od tego jak
duża część polipeptydu zostanie utracona
Zmiana kodonu terminacyjnego na kodon
kodujący aminokwas- prowadzi do ominięcia
kodonu terminacyjnego; powstaje wydłużone
białko
Następstwa mutacji w
kodujących obszarach
genów c.d.
Przesunięcie ramki odczytu- insercje,
delecje: jeśli liczba wstawionych lub
utraconych nukleotydów nie jest równa
trzem lub wielokrotności trzech
Skutki mutacji
zachodzących poza
obszarami kodującymi
znacznie trudniej określić skutki
każde miejsce wiązania białka jest
narażone na mutacje punktowe, delecje
oraz insercje- może to prowadzić do
zmiany rodzaju lub miejsca położenia
nukleotydów uczestniczących w
interakcjach białko- DNA
potencjalnie mutacje mogą inaktywować
promotory lub sekwencje regulatorowe
Mutacje (aberracje)
chromosomowe
Zmiany liczby oraz struktury
chromosomów
W komórkach somatycznych lub w
gametach
Dziedziczone lub powstające de novo
Aberracje chromosomowe
strukturalne
dotyczą pojedynczej lub obydwu
chromatyd
powstają na skutek przerwania
ciągłości chromatydy lub
chromosomu
Inwersja
Fragment chromosomu ulega
wycięciu (dwa złamania), a
następnie jest wstawiany w
odwrotnej pozycji (odwrócenie
fragmentu chromosomu o 180°)
2 rodzaje inwersji:
•
Paracentryczne- nie dotyczą
centromeru
•
Pericentryczne- dotyczą centromeru
Translokacja
Przemieszczenie fragmentu
chromosomu w obrębie tego
samego lub do innego chromosomu
przynajmniej 1/500 osób jest
nosicielem translokacji
zrównoważonej
- translokacja wzajemna- wymiana
fragmentu pomiędzy
chromosomami niehomologicznymi
Translokacje robertsonowskie-
dwa krótkie ramiona dwóch
niehomologicznych chromosomów zostają
utracone, a ramiona długie łączą się w
centromerze, tworząc pojedynczy
chromosom
Duplikacja
podwojenie tych samych
odcinków chromosomów
podwojenie kopii genów
prawdopodobnie istotne
znaczenie w procesach
ewolucji- nowe rodzaje
łańcuchów hemoglobiny
powstały na skutek duplikacji
pierwotnych genów
Delecja (deficjencja)
utrata odcinka
chromosomu
powstają na skutek
pęknięcia chromosomu
dotyczą zwykle dość dużej
liczby genów i wywołują
charakterystyczne
zespoły chorobowe;
są możliwe do zobaczenia
pod mikroskopem
Delecja terminalna- utrata odcinka
dystalnego chromosomu
Delecja interstycjalna- utrata fragmentu
środkowego
kruche miejsca chromosomów- odcinki
wykazujące szczególną łamliwość
delecje długich fragmentów są zazwyczaj
letalne
Mikrodelecje
podtypy delecji, które można
zaobserwować tylko w barwionych
chromosomach lub przy zastosowaniu
metod genetyki molekularnej
obejmują delecje całej serii sąsiadujących
genów
Chromosom kolisty
powstaje w wyniku pęknięcia a następnie
połączenia chromosomu
często ulegają utracie, co powoduje
monosomię chromosomową w niektórych
komórkach
Izochromosom
powstaje w wyniku
nieprawidłowego,
poprzecznego
podziału centromeru
chromosomu
metafazowego
składa się tylko z
połączonych ramion
krótkich lub długich
Aberracje liczbowe
Aneuploidie- zwiększenie lub zmniejszenie
diploidalnej liczby chromosomów o
pojedyncze chromosomy
- nondysjunkcja- nierozdzielenie się
chromosomów podczas podziału
mitotycznego lub mejotycznego
-utrata chromosomu podczas anafazy
Euploidie (poliploidie)- zwielokrotniony
cały haploidalny zestaw chromosomów
Uszkodzenie DNA
Źródła endogenne:
np. wolne rodniki, błędy replikacji
Źródła egzogenne
czynniki:
fizyczne
chemiczne
biologiczne
Mutageny to czynniki indukujące powstanie mutacji
(znacznie ponad poziom mutacji spontanicznych)
Czynniki fizyczne
Promieniowanie jonizujące:
promieniowanie X
promieniowanie α, β, γ
promieniowanie kosmiczne
protony i neutrony- podczas
promieniotwórczego rozpadu
pierwiastków
Na promieniowanie jonizujące
szczególnie wrażliwe są
komórki szybko dzielące się
np. komórki szpiku kostnego
W wyniku wybuchu bomby
atomowej w Hiroszimie
wzrost zachorowalności na
białaczki
Po awarii elektrowni
atomowej w Czarnobylu
liczba zachorowań na raka
tarczycy u dzieci wzrosła
pięciokrotnie
Promieniowanie niejonizujące:
promieniowanie UVA, UVB, UVC
- najczęściej powoduje mutacje typu
tranzycji i transwersji
Ciepło
Cięcie wiązania β-N-glikozydowego,
łączącego zasadę azotową z cukrowym
składnikiem nukleotydu, powstają miejsca
AP (apurynowe/ apirymidynowe)
pozbawione zasady utrata nukleotydu,
luka w dwuniciowej cząsteczce DNA
W każdej ludzkiej komórce powstaje ok. 10
000 miejsc AP dziennie
Czynniki chemiczne
Analogi zasad:
włączane do nukleotydów podczas syntezy DNA
5- bromouracyl- analog tyminy
2- aminopuryna- analog adeniny
Czynniki deaminujące- usunięcie grupy aminowej:
kwas azotowy (III)
dwusiarczan sodowy
Czynniki alkilujące- dodają grupy alkilowe do
nukleotydów
sulfonian dietylowy
sulfonian etylometylowy
Czynniki interkalujące- powodują
rozwinięcie helisy zwiększenie
odległości pomiędzy sąsiednimi parami
zasad
bromek etydyny
Czynniki chemiczne c.d.
wolne rodniki tlenowe
nadtlenki np. H
2
O
2
węglowodory aromatyczne-
benzopiren w dymie tytoniowym
pestycydy
iperyt- gaz bojowy
sole metali ciężkich
Leki:
cytostatyki
cyklofosfamid
aminopteryna
ametopteryna
(Methotrexat)
winkrystyna
(Oncovir)
antybiotyki
aktynomycyna C i D
daunomycyna
Związki
chemiczne
występujące w
żywności:
mykotoksyny
środki
konserwujące np.
azotyn sodowy
Czynniki biologiczne
Wirusy:
Herpes virus- wirus opryszczki
Papilloma virus- wirus brodawczaka
ludzkiego (HPV) – nowotwór szyjki
macicy
Hepatitis C virus- wirus zapalenia
wątroby typu C (HCV)