Mikrobiologia Ćwiczenia


MIKROBIOLOGIA

OGÓLNA I ŻYWNOŚCI

ĆWICZENIA

dr M.Synowiec

DIETETYKA

semestr I

ZADANIA I PODZIAŁ MIKROBIOLOGII

Mikrobiologia zajmuje się:

Działy mikrobiologii:

ŚRODOWISKA BYTOWANIA MIKROORGANIZMÓW

GLEBA - główne środowisko bytowania drobnoustrojów. W jej skład wchodzą grzyby, bakterie i pierwotniaki. Mineralizują one substancje organiczne dostarczając roślinom niezbędnych pierwiastków.

BAKTERIE GLEBOWE

(wg Winogradskiego)

0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

Bakterie autochtoniczne

Występują mniej więcej w stałej liczbie dla danego typu gleby

Bakterie zymogenne

Rozwijają się w glebie tylko okresowo, dostają się tam ze szczątkami zwierząt

Drobnoustroje przypadkowe

Np. bakterie chorobotwórcze, dostające się do gleby wraz z odchodami ludzi i zwierząt, padliną oraz chorymi tkankami roślin

WODA - naturalne środowisko bytowania drobnoustrojów. Uboga w mikroflorę jest woda opadowa, natomiast wody podziemne zawierają różne ilości drobnoustrojów w zależności od głębokości występowania.

Drobnoustroje wód powierzchniowych mineralizują związki organiczne i w ten sposób biorą udział w procesie samooczyszczania wody.

Drobnoustroje występujące w wodzie w zależności od pochodzenia dzielimy na cztery grupy:

  1. mikroflorę naturalną wody

  2. mikroflorę dostającą się do wody z gleby i powietrza

  3. mikroflorę przewodu pokarmowego ludzi i zwierząt

  4. mikroflorę pochodzącą ze ścieków przemysłowych

POWIETRZE - środowisko wtórne bytowania drobnoustrojów, do którego dostają się one z cząsteczkami pyłu, kurzu lub pary wodnej i są przenoszone przez wiatr.

ZASADY, TECHNIKA PRACY ORAZ SPRZĘT W LABORATORIUM MIKROBIOLOGICZNYM

Podstawowa aparatura w pracowni:

Podstawowy sprzęt:

Podstawowe szkło laboratoryjne:

MIKROSKOPY

0x08 graphic
0x08 graphic

ŚWIETLNE (OPTYCZNE)

  • Z jasnym polem widzenia

  • Z ciemnym polem widzenia

  • Do oglądania w ultrafiolecie

  • Fluorescencyjny

  • Kontrastowo-fazowy

  • Konfokalny

ELEKTRONOWE

Mikroskop do oglądania w ciemnym polu widzenia - przy jego konstrukcji wykorzystano tzw. Efekt Teyndalla. Specjalnie skonstruowany kondensor kieruje promienie światła ukośnie do powierzchni szkiełka przedmiotowego. Pole widzenia pozostaje ciemne, komórki są jasne.

Mikroskop do oglądania w ultrafiolecie - używając jako źródła światła promieni ultrafioletowych (180-400 nm), możemy oglądać komórki o wielkości 0,1 μm. Soczewki w tym mikroskopie są wykonane z kwarcu, gdyż przepuszcza on promienie ultrafioletowe. Promieniowanie jest niewidoczne. Obrazy otrzymujemy na fotografii, kliszy.

Mikroskop fluorescencyjny - pewne substancje chemiczne absorbują energię fal ultrafioletowych i emitują ją jako fale widzialne większej długości. Takie substancje mogą mieć określone zabarwienie w świetle normalnym i całkowicie inną barwę w świetle ultrafioletowym. Związki te nazywa się związkami fluorescencyjnymi, a zjawisko fluorescencją.

Mikroskop kontrastowo-fazowy - jest szczególnie przydatny do badania żywych komórek. Większość mikroorganizmów jest bezbarwna i prawie przezroczysta, w skutek czego są one słabo widoczne pod mikroskopem. Dlatego też stosuje się różne metody barwienia umożliwiające dostrzeżenie zabarwionych komórek. Metoda kontrastu fazowego umożliwia dokładną obserwację obiektów bez konieczności ich barwienia.

Mikroskop konfokalny - użycie światła laserowego wprowadzonego do mikroskopu od strony okularu skanuje pole widzenia. Dzięki temu obraz jest oświetlany punkt po punkcie, wyłącznie w płaszczyźnie ostrości obrazu. Mikroskop ten ma duże zastosowanie w badaniach cytologicznych.

Mikroskop ELEKTRONOWY - tutaj rolę światła odgrywają wiązki elektronów o bardzo małej długości fali biegnących w wysokiej próżni. Rolę soczewek spełniają soczewki elektrostatyczne lub elektromagnetyczne. Obraz przedmiotu może być widoczny na specjalnym ekranie fluorescencyjnym lub fotografowany na płytce fotograficznej przez wmontowany w mikroskop aparat fotograficzny.

METODY NISZCZENIA DROBNOUSTROJÓW

METODY FIZYCZNE

METODY MECHANICZNE

Wyjaławianie cieczy możemy uzyskać poprzez oddzielenie mikroorganizmów przy pomocy specjalnych filtrów bakteriologicznych o drobnych porach.

Rodzaje filtrów (różnią się materiałem i konstrukcją):

  1. filtry Berkefelda - z ziemi okrzemkowej

  2. filtry Chamberlaina - z nieglazurowanej porcelany

  3. filtry azbestowe

  4. filtry Schotta - ze spiekanego szkła

  5. filtry membranowe - z kolodium, żelatyny

METODY CHEMICZNE (DEZYNFEKCJA)

Przy pomocy substancji chemicznych można przeprowadzić różnych przedmiotów, płynów, pomieszczeń.

Można zastosować:

BARWIENIE BAKTERII

Tylko w mikroskopie kontrastowo-fazowym można oglądać żywe bakterie bez barwienia.

Aby zaobserwować bakterie w mikroskopie świetlnym, ocenić właściwie ich wielkość, kształt, niektóre cechy morfologiczne, należy je zabarwić. Bakterie słabo załamują promienie świetlne. Związki stosowane do barwienia to głównie sole. Najczęściej stosowane są barwniki o charakterze zasadowym, w których barwny jest kation; barwniki obojętne lub kwaśne są stosowane znacznie rzadziej.

Najczęściej stosowane barwniki:

Techniki barwienia:

Podział technik barwienia ze względu na rodzaj barwników:

Technika barwienia złożonego polega na pokrywaniu szkiełka podstawowego z naniesionym i utrwalonym badanym preparatem. Potem nanosimy barwnik na określony czas i spłukujemy wodą, przed nalaniem kolejnego barwnika. Do lepszego wypłukania stosuje się alkohol lub płyn Lugola, a także podgrzewanie preparatu nad palnikiem.

Inny podział barwienia:

Przyżyciowe - stosowane w celu odróżnienia komórek żywych od martwych, stwierdzenia substancji zapasowych w komórce, w badaniu przepuszczalności błony cytoplazmatycznej.

Polega ono na wprowadzeniu do żywych komórek nietoksycznego barwnika o dużej kontrastowości, musi być bardzo rozcieńczony. Bakterie barwione w ten sposób przestają się rozmnażać.

Do przygotowania preparatu barwionego na „żywo” na szkiełku podstawowym, obok kropli zawiesiny drobnoustrojów umieszcza się kroplę barwnika. Obie krople miesza się np. ezą, przykrywa szkiełkiem nakrywkowym i po upływie określonego czasu ogląda pod mikroskopem.

*Barwienie przyżyciowe charakteryzuje się tym, że preparat jest mokry. Nie utrwala się preparatu!

Pośmiertne - preparat „utrwalony”. Przed sporządzeniem preparatu należy odtłuścić szkiełko podstawowe (nap płomieniem palnika gazowego).

Sporządzanie rozmazu

Na odtłuszczone szkiełko nanosi się kroplę hodowli lub badanego materiału i sporządza zawiesinę, którą rozprowadza się jałową ezą na powierzchni całego szkiełka i pozostawia do wyschnięcia na wolnym powietrzu. Po wysuszeniu rozmaz powinien być cienki, ledwo widoczny. Wysuszony preparat utrwala się.

Rodzaje utrwalania:

  1. Utrwalanie termiczne - polega na kilkakrotnym przesunięciu szkiełka przedmiotowego z rozmazem nad płomieniem palnika od spodu preparatu, przerywając, kiedy szkło zacznie lekko parzyć.

  2. Utrwalanie chemiczne - stosuje się przy badaniu struktur komórkowych. Do tego utrwalania używa się związków odwadniających (alkohol etylowy, metylowy, mieszanina alkoholu i eteru w stosunku 1:1, 10-procentowy roztwór formaliny, sublimatu itp.

Utrwalanie chemiczne polega na zalaniu wysuszonego rozmazu na określony czas utrwalaczem. Następnie utrwalacz się zlewa i preparat suszy na powietrzu. Używając formaliny lub sublimatu, preparat należy dobrze przemyć woda i wysuszyć.

Metoda Grama

Pozwala na zróżnicowanie organizmów na dwie grupy (Gram-dodatnie i Gram-ujemne inaczej się barwią), ze względu na różnice w budowie ściany komórkowej - różnice w fizjologii i podatności na leki. (Barwienie pośmiertne, złożone, utrwalone)

Odczynniki: Fiolet krystaliczny i roztwór fuksyny zasadowej, płyn Lugola, alkohol etylowy

  1. Nanieść bakterie na szkiełko podstawowe (kropla hodowli)

  2. Nanieść na preparat kroplę fioletu krystalicznego. Po dwóch minutach zmyć wodą destylowaną

  3. Nanieść płyn Lugola na 1 minutę. Spłukać obficie alkoholem etylowym, a później woda destylowaną.

  4. Nanieść Na preparat roztwór fuksyny zasadowej na 40 sek. Spłukać szkiełko wodą destylowaną i wysuszyć. Przed umieszczeniem na stoliku mikroskopu nanieść na szkiełko krople lejku immersyjnego. Oglądać używając obiektywu dającego stukrotne powiększenie.

Barwienie metodą Grama należy przeprowadzać na hodowlach 18-24 godzinnych. Starsze komórki maja mniejszą zdolność do tworzenia trwałego kompleksu z fioletem.

Bakterie po barwieniu metodą Grama:

Barwienie przetrwalników

Budowa przetrwalników, a szczególnie obecność wielowarstwowych błon powoduje, że przetrwalniki należą do słabo barwiących się i konwencjonalne metody nie dają efektu. W zabarwionych komórkach są widoczne jako bezbarwne obszary. Barwniki mogą przenikać do wnętrza po podgrzaniu preparatu. Nieprzepuszczalność ściany przetrwalnika zapobiega ich odbarwianiu podczas płukania woda lub alkoholem. Dlatego stosuje się barwienie kontrastowe przetrwalników i komórek wegetatywnych (dwoma kontrastowymi barwnikami).

Metoda Schaeffera-Fultona

  1. Utrwalony preparat zalać 5-procentowym wodnym roztworem zieleni malachitowej na 5 minut, po czym nie zlewając barwnika, delikatnie podgrzać palnikiem od spodu preparatu do momentu ukazania się obłoczka pary. Podgrzewanie powtarza się 3-krotnie, nie dopuszczając do odparowania barwnika

  2. Po skończonym ogrzewaniu preparat spłukać delikatnym strumieniem wody destylowanej w czasie 30 sekund

  3. Preparat dobarwić 0,5-procentowym roztworem safraniny w czasie 30 sekund

  4. Po zakończeniu barwienia, preparat spłukać wodą destylowaną i osuszyć.

Przetrwalniki barwią się na zielono, a komórki wegetatywne na czerwono.

Bakterie alkoholo-kwaso-oporne

Do znanych metod barwienia złożonego należą metody barwienia bakterii zawierających w swych ścianach duże ilości tłuszczu i wosków.

Bakterie te zabarwione na gorąco barwnikiem, nie odbarwiają się pod działaniem alkoholu i innych silnych kwasów mineralnych

Dla tej grupy najczęściej jest polecana metoda barwienia prątków Ziehl-Neelsena, w której podstawowym barwnikiem jest fuksyna karbonowa.

Barwienie otoczek

Polega na barwieniu otoczek bakterii w celu ułatwienia obserwacji.

Otoczki bakteryjne bardzo trudno zaobserwować w mikroskopie świetlnym, bez zastosowania specjalnych metod barwienia. Jest to związane z tym, jak otoczki załamują światło. Stosuje się barwienie negatywne (negatywowe) z pewnymi modyfikacjami.

Na szkiełko podstawowe nanosi się kroplę zawiesiny drobnoustrojów i kroplę nigrozyny lub tuszu. Używając drugiego szkiełka podstawowego wykonuje się rozmaz i suszy na powietrzu; preparat po wyschnięciu jest gotowy do obserwowania.

Na ciemnym tle są widoczne jasne komórki z otoczkami.

Inna metodą jest barwienie różnicujące Anthony'ego w modyfikacji Tylera. Rozmaz komórek, po wysuszeniu na powietrzu i utrwaleniu, barwi się 4-7 minut fioletem krystalicznym według metody Anthony'ego-Tylera. Barwnik zlewa się i preparat zmywa roztworem siarczanu miedzi. Otoczki przyjmują barwę niebieskofioletowa, a komórki są ciemnoniebieskie.

Barwienie substancji zapasowych

Przy wykrywaniu wolutyny, rozmaz komórek po wysuszeniu i utrwaleniu barwi się przez kilka sekund błękitem wg Tofflera, spłukuje wodą destylowaną, suszy. Ziarnistości metachromatyczne barwią się na fioletowo, a komórki na niebiesko.

Do barwienia glikogenu i granulozy stosuje się płyn Lugola. Glikogen barwi się na czerwonobrunatno, a granuloza na ciemnoniebiesko.

HODOWLA DROBNOUSTROJÓW W WARUNKACH LABORATORYJNYCH

Pożywki hodowlane - nazywane też podłożami mikrobiologicznymi, są to mieszaniny odpowiednio dobranych składników. Służą do hodowli mikroorganizmów w warunkach laboratoryjnych, w naczyniach (hodowle in vitro - w szkle).

Wzrost i rozwój drobnoustrojów na pożywkach pozwala na wyodrębnienie czystych kultur, na prowadzenie badań morfologicznych, fizjologicznych, diagnostycznych o raz wszelkiego rodzaju hodowli doświadczalnych.

Pożywka powinna spełniać następujące warunki:

Nie ma uniwersalnych pożywek dla wszystkich drobnoustrojów (jest to spowodowane zróżnicowaniem wymagań pokarmowym)

Wyróżniamy:

SKŁADNIKI POŻYWEK

Źródło węgla

Najłatwiej przyswajalne źródło węgla to: cukry (glukoza, maltoza, laktoza, skrobia, celuloza). Dodatek cukru do pożywki może służyć celom diagnostycznym lub wybiórczym, gdyż dany gatunek wykorzystuje określony rodzaj cukru. Zawartość cukru w pożywce waha się od 0,5 do 2%. Oprócz cukrów, jako źródło węgla drobnoustroje mogą wykorzystywać glicerol i mannitol oraz niektóre kwasy organiczne.

Źródła azotu

Większość drobnoustrojów wykorzystuje azot z połączeń nieorganicznych (sole amonowe, wodorotlenek amonu, azotany). Jon amonowy stanowi podstawowy związek w przemianach azotowych.

Niektóre drobnoustroje mogę pobierać wolny azot atmosferyczny. Poza tym, drobnoustroje czerpią azot również ze związków organicznych, niekiedy bardzo skomplikowanych. Należy tu wymieć przede wszystkim ekstrakty (wyciągi) z tkanek roślinnych i zwierzęcych oraz różnego typu hydrolizaty białek zwierzęcych i roślinnych. Wszystkie te składniki są dostępne już jako preparatu handlowe, w postaci proszków lub past. Dodatek związków białkowych do pożywek wynosi 0,5-2%.

Do źródeł azotu zaliczamy:

Ekstrakty mięsne - wodne wyciągi z tkanki mięsnej, ale także ekstrakty z serc i wątroby, zawierają one substancje azotowe oraz węglowodany i witaminy rozpuszczalne w wodzie

Ekstrakty drożdżowe - obok związków azotu i węgla organicznego są bogatym źródłem witamin z gr. B

Peptony - specyficzne produkty częściowej, enzymatycznej hydrolizy białka, są głównym źródłem azotu w pożywce, zawierają liczne wolne aminokwasy i krótkie łańcuchy peptydowe, pewne witaminy, czasami węglowodany

Hydrolizaty enzymatyczne lub kwasowe białek mięsa, kazeiny, jaj, nasion soi - bogate źródło aminokwasów, jedno z najczęściej wykorzystywanych źródeł azotu organicznego w pożywce

Czyste białka -(żelatyna, kazeina) oraz białka rodzime (np. białka jaja, surowicy krwi) - opcjonalne źródło azoty wykorzystywane przez bakterie proteolityczne

Wolne aminokwasy - czasami dodawane do podłoża (jest to droga metoda).

Sole mineralne

Dodawane do pożywek w niewielkich ilościach, są źródłem składników nieorganicznych (fosforu, siarki, potasu, sodu, magnezu, manganu, żelaza i in.

Drobnoustroje pobierają je w postaci odpowiednich soli, najczęściej KH2PO4, K2HPO4, Na2HPO4, NaH2PO4, NaCl, siarczany i chlorki żelaza, magnezu.

Niektóre z tych soli regulują ciśnienie osmotyczne, np. NaCl, dodawane w ilościach 3-5 g/l pożywki, Inne, np. fosforany potasu, działają buforująco i utrzymują właściwy odczyn pożywki.

Czynniki wzrostowe

Wprowadza się je do podłoża w postaci roztworów syntetycznych witamin (jest to kosztowne) lub w formie wyciągów (mięsnego wątrobowego i drożdżowego, a także wyciągów roślinnych (sok pomidorowy, brzeczka słodowa, ekstrakt glebowy lub ziemniaczany).

Związki korygujące

Większość bakterii rośnie w pH obojętnym lub lekko alkalicznym (6,8-7,4).

Grzyby preferują środowisko lekko kwaśne (pH 5-6,0).

Korektę pH pożywek przeprowadza się najczęściej za pomocą 1-5 moli roztworów NaOH i HCl.

Substancje różnicujące i wybiórcze

Wprowadzone do podłoża czynniki różnicujące ulegają pod wpływem mikroorganizmów modyfikacji bądź rozkładowi. Uwidocznia się to np. w zmianie barwy kolonii lub podłoża lub powstaniu strefy przejaśnienia.

Czynniki wybiórcze (sole kwasów żółciowych, niektóre barwniki np. zieleń brylantowa, fiolet krystaliczny, związki chemiczne np. azydek sodu) hamują rozwój pewnych grup bakterii umożliwiając rozwój tylko określonej grupie drobnoustrojów.

CZYNNIKI ZESTALAJĄCE

Pozwalają na uzyskanie pożywek w formie stałej.

Agar

Jest to dostępny handlowo w formie proszku lub włókien, wielocukier otrzymywany z glonów morskich. Odznacza się właściwościami żelującymi, silnie chłonie wodę i w zależności od stopnia oczyszczenia upłynnia się w temperaturze 90-100°C, a zestala w 45-48°C.

Chemicznie agar jest polisacharydem - galaktonem (zawiera m.in. galaktozę), który nie jest wykorzystywany przez drobnoustroje jako składnik odżywczy, a tylko przez niektóre drobnoustroje może być rozkładana. W celu zestalenia podłoża wystarczy 1,5-3% agaru.

Żelatyna

jest to substancja białkowa, która występuje w wyniku hydrolizy kolagenu, może być zużywana przez drobnoustroje zawierające enzymy proteolityczne, następuje wówczas upłynnienie pożywki (nie należy przechowywać płytek z takimi hodowlami do góry dnem)

żelatyna upłynnia się w temperaturze 25-27^C a zestala w 18-20^C, przy czym ogrzewana kilkukrotnie do 100^C traci właściwości żelujące.

Jako czynnik zestalający pożywkę dodaje się w ilości 12-15%.

Inne czynniki zstalające są stosowane rzadko, mależa tu m.in. żel krzemionkowy (do pożywek mineralnych dla autotrofów), jaja i surowice krwi (w badaniach specjalnych).

RODZAJE POŻYWEK

Kryteria podziału pożywek:

Podłoża w zależności od składu:

Podłoża ze względu na zawartość składników:

Podłoża zależnie od funkcji jaką ma pełnić pożywka