Wykład II

A,a – dwie formy tego samego genu.

Rozkłady zmiennych losowych:

  1. Rozkład dwupunktowy (zero – jedynkowy)

Jeśli zmienna losowa skokowa przyjmuje tylko dwie wartości 1 i 0 z prawdopodobieństwem odpowiednio p i q ( q = 1 − p), to

EX = p

σ2x = p(1-p)=pq

przykład: Wyniki rozrodu 10 klaczy:

8 klaczy urodziło zdrowe źrebięta

2 klacze poroniły

xi p(q)
1 p=8/10=0,8
0 q=2/10=0,2

Prawo Hardy’ego i Weinberga

Odnosi się, opisuje stałość występowania alleli z danego locus przez pokolenia.

W populacjach występuje z pokolenia na pokolenie stałość frekwencji alleli.

Na podstawie frekwencji alleli możemy ustalić częstość występowania konkretnych form genotypowych.

Częstość genotypów wyznaczana jest z rozwinięrego dwumianu kwadratowego z częstości genów:

(p+q)2=p2+2pq+q2

P Q R

Analiza wpływów rozmaitych czynników powoduje odstępstwa od tego prawa.

Prawo to opisuje równowagę populacji.

Przykład:
W populacji 400 osobników o genotypach:

AA-165

Aa-190
aa-45

Liczba alleli:

A=2*165+190=520

a=190+2*45=280

W sumie 520+280=800 (bo 2*400=800)

Szacowana frekwencja:

pA=520/800=0,65

qa=280/800=0,35

Oczekiwana liczba genotypów będzie wynosić:

P = p2 = 0,652*400 = 169

Q = 2pq =2*0,65*400 =182

R = q2=0,35*400 = 49

Weryfikacja statystyczna hipotez:

przy pomocy testu χ2

gdzie:

χ2 = ∑ (liczebność obserwowana- l. obliczona)2 / liczebność obliczoną

Genotyp L. obserwowana L. obliczona Różnica Kwadrat różnicy Dzielenie przez L.obli
AA 165 169 4 16 0.0947
Aa 190 182 8 64 0.3516
aa 45 49 4 16 0,3265
∑ = 0,7728

Wartość graniczna odczytana z tablic rozkładu:

Przy P<0,05=3,84

Ponieważ 0,7728<3,84

Nie mamy podstaw do odrzucenia hipotezy o zgodności uzyskanego rozkładu częstości genotypów od przewidywanej na podstawie prawa Hardy’ego i Weinberga

Założenia, przy spełnieniu których obowiązuje prawo H-W:

  1. Organizmy są diploidalne

  2. Rozmnażanie płciowe

  3. Pokolenia nie zachodzą na siebie

  4. Rozpatrywane są pojedyncze loci

  5. W locus występują tylko dwie formy alleliczne

  6. Występują kojarzenia losowe (kojarzenie odbywa się niezależnie od zawartości genetycznej gamet)

  7. Populacja jest nieskończenie wielka

  8. Brak wpływu czynników, które mogą zmieniać frekwecnję genów i genotypów

Równowaga opisana prawem H-W jest utrzymywana z pokolenia na pokolenie w przypadku zachowania losowośći kojarzeń, które jest równoznaczne z losowym łączeniem się gamet.

Gamety męskie
Allel A
Częstość p
Allel Częstość
Gamety A p
żeńskie a q

P=p2 Q=2pg R=q2

Częstość genu można wyrazić przy pomocy częstości genotypów:

p=(2*P+Q)/2=P+Q/2

q=(2R+Q)/2=R+Q/2

Jak postaje następne pokolenie

Wyznaczenie częstopści połączeń przy kojarzeniu:

Samce

Samice

AA Aa Aa
AA P*P P*Q P*R
Aa Q*P Q*Q Q*R
aa R*P R*Q R*R

Pokolenie potomne:

Kojarzenie Częstość połączeń Prawdopodonieństwo genotypów potomstwa
AA Aa
AA*AA P*P 1
AA*Aa 2*P*Q 1/2
AA*aa 2*P*R 0
Aa*Aa Q*Q ¼
Aa*aa 2*Q*R 0
aa*aa R*R 0

P’=P2+2PQ*1/2+Q2*1/4= (P+Q/2)2=p2

Q=2PQ*1/2+2PR+Q2*1/2+2QR*1/2=2(P+Q

Wykazaliśmy stałość struktury genetycznej przy założeniu losowości kojarzeń.

Stałość frekwencji alleli zpokolenia na pokolenie nosi nazwę równowagi neutralnej tj takiej, gdy zachowana stałość jest niezależna od wyjściowej frekwencji p i q

Więcej niż 2 allele w danym locus

Liczba możliwych genotypów:

M(m+1)/2

Przypadek trzech alleli:

p- frekwencja allelu A

q – frekwencja A’

r – a

Gamety męskie
Allel A A’
Częstość p q
Allel Częstość AA
Gamety A p p*p
A’A
Q*p
żeńskie A’ q aA
A R r*p

Zatem:

Genotyp: AA AA’ Aa A’A’ A’a aa

Częstość p2 2pq 2pr q2 2qr r2

Ogólnie:

Dla allelu o frekwencji p, frekwencji układów homozygotycznych będzie równa p2

Dla dwóch alleli o frekwencji pi i pj – frekwecja układów heterozygotycznych będzie równa 2pipj

Frekwecnja heterozygot:

Największa częstość heterozygot wystąpi gdy frekwecnje obu genów będą równe:

p=q=0,5

Przyjmijmy, że allel a jest genem rzadkim:

q<0,5

W do układu zrównoważonego, maleje częstość układów homozygotycznych aa i częstość heterozygot Aa, lecz ta pierwsza (homozygoty) maleje bardziej.

Jeśli częstość genu a maleje do 0

Częstość homozygot aa maleje do 0 zgodnie z q2

Częstość heterozygot maleje do 0 zgodnie z 2pq

Przykład

qa qa2 2p­Aqa 2p­Aqa/qa2

0,5 0,25 0,5 2

0,3 0,09 0,49 4,67

0,01 0,0001 0,0198 198

Im dana forma allelu występuje rzadziej, tym wię,sza jej część występuje w układach heterozygotycznych. Jeśli częstość genu rośnie do 1 wrześnbia liczba układów homozygotycznych z tą formą allelu przy malejącej częstotliwości heterozygot.

pA pA2 2 pAqa 2pAqa/ pA2

0,5 0,25 0,5 2

0,7 0,49 0,42 0,86

0,99 0,9801 0,0198 0,02

Geny sprzężone z płcią:

W przypadku większości loci z chromosomu X nie mają one odpowiednika w chromosomie Y, zatem samce posiadają tylko jedną kopię genu.

Przykład:

Frekwencja genów u obu p-łci jest taka sama czyli p i q

X Y
Allel XA Xa
Częstość p Q
Żeńskie Częstość

XAXA

p*p

XAXa XAY
XA p*q p
Xa XaXA aa XaY
p*q q*q q

U samic częstość genotypów jest zgodna z równaniem HW

XAXA p2

XAXa 2pq

XaXa q2

U samców jest równa częstośći genów

XAY p

XaY q


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
WYKŁAD II
Podstawy finansów 2008, Wykład II
Wyklad II uklad nerwowy
rehabilitacja kardologiczna wyklad II
Chemia wyklad I i II (konfiguracja wiÄ…zania Pauling hybrydyzacja wiazania pi i sigma)
Wykład II Analiza podstawowych pojęć eksploatacyjnych i użytkowanie obiektów ED
2012 test wykladowka(II)
23 materiały wykład II
Informatyka - wykład II, Inne materiały
Logika wykład II - 20.10.2013, Sem. 1, Logika
urządzanie i pielęgnacja krajobrazu - wykład II - 23.10.2006, szkoła, KTZ, urządzanie
przewlekła niewydolność oddechowa, wykład I, wykład II
Wykład II RYNEK
HISTORIA SZTUKI WSPÓŁCZESNEJ POLSKIEJ, WYKŁAD II, 10 10
Wykład II pediatria
Zintegrowane wykład II
Wykład II 10 2013

więcej podobnych podstron