A,a – dwie formy tego samego genu.
Rozkłady zmiennych losowych:
Rozkład dwupunktowy (zero – jedynkowy)
Jeśli zmienna losowa skokowa przyjmuje tylko dwie wartości 1 i 0 z prawdopodobieństwem odpowiednio p i q ( q = 1 − p), to
EX = p
σ2x = p(1-p)=pq
przykład: Wyniki rozrodu 10 klaczy:
8 klaczy urodziło zdrowe źrebięta
2 klacze poroniły
xi | p(q) |
---|---|
1 | p=8/10=0,8 |
0 | q=2/10=0,2 |
Prawo Hardy’ego i Weinberga
Odnosi się, opisuje stałość występowania alleli z danego locus przez pokolenia.
W populacjach występuje z pokolenia na pokolenie stałość frekwencji alleli.
Na podstawie frekwencji alleli możemy ustalić częstość występowania konkretnych form genotypowych.
Częstość genotypów wyznaczana jest z rozwinięrego dwumianu kwadratowego z częstości genów:
(p+q)2=p2+2pq+q2
P Q R
Analiza wpływów rozmaitych czynników powoduje odstępstwa od tego prawa.
Prawo to opisuje równowagę populacji.
Przykład:
W populacji 400 osobników o genotypach:
AA-165
Aa-190
aa-45
Liczba alleli:
A=2*165+190=520
a=190+2*45=280
W sumie 520+280=800 (bo 2*400=800)
Szacowana frekwencja:
pA=520/800=0,65
qa=280/800=0,35
Oczekiwana liczba genotypów będzie wynosić:
P = p2 = 0,652*400 = 169
Q = 2pq =2*0,65*400 =182
R = q2=0,35*400 = 49
Weryfikacja statystyczna hipotez:
przy pomocy testu χ2
gdzie:
χ2 = ∑ (liczebność obserwowana- l. obliczona)2 / liczebność obliczoną
Genotyp | L. obserwowana | L. obliczona | Różnica | Kwadrat różnicy | Dzielenie przez L.obli |
---|---|---|---|---|---|
AA | 165 | 169 | 4 | 16 | 0.0947 |
Aa | 190 | 182 | 8 | 64 | 0.3516 |
aa | 45 | 49 | 4 | 16 | 0,3265 |
∑ = 0,7728 |
---|
Wartość graniczna odczytana z tablic rozkładu:
Przy P<0,05=3,84
Ponieważ 0,7728<3,84
Nie mamy podstaw do odrzucenia hipotezy o zgodności uzyskanego rozkładu częstości genotypów od przewidywanej na podstawie prawa Hardy’ego i Weinberga
Założenia, przy spełnieniu których obowiązuje prawo H-W:
Organizmy są diploidalne
Rozmnażanie płciowe
Pokolenia nie zachodzą na siebie
Rozpatrywane są pojedyncze loci
W locus występują tylko dwie formy alleliczne
Występują kojarzenia losowe (kojarzenie odbywa się niezależnie od zawartości genetycznej gamet)
Populacja jest nieskończenie wielka
Brak wpływu czynników, które mogą zmieniać frekwecnję genów i genotypów
Równowaga opisana prawem H-W jest utrzymywana z pokolenia na pokolenie w przypadku zachowania losowośći kojarzeń, które jest równoznaczne z losowym łączeniem się gamet.
Gamety męskie | ||
---|---|---|
Allel | A | |
Częstość | p | |
Allel | Częstość | |
Gamety | A | p |
żeńskie | a | q |
P=p2 Q=2pg R=q2
Częstość genu można wyrazić przy pomocy częstości genotypów:
p=(2*P+Q)/2=P+Q/2
q=(2R+Q)/2=R+Q/2
Jak postaje następne pokolenie
Wyznaczenie częstopści połączeń przy kojarzeniu:
Samce Samice |
AA | Aa | Aa |
---|---|---|---|
AA | P*P | P*Q | P*R |
Aa | Q*P | Q*Q | Q*R |
aa | R*P | R*Q | R*R |
Pokolenie potomne:
Kojarzenie | Częstość połączeń | Prawdopodonieństwo genotypów potomstwa |
---|---|---|
AA | Aa | |
AA*AA | P*P | 1 |
AA*Aa | 2*P*Q | 1/2 |
AA*aa | 2*P*R | 0 |
Aa*Aa | Q*Q | ¼ |
Aa*aa | 2*Q*R | 0 |
aa*aa | R*R | 0 |
P’=P2+2PQ*1/2+Q2*1/4= (P+Q/2)2=p2
Q=2PQ*1/2+2PR+Q2*1/2+2QR*1/2=2(P+Q
Wykazaliśmy stałość struktury genetycznej przy założeniu losowości kojarzeń.
Stałość frekwencji alleli zpokolenia na pokolenie nosi nazwę równowagi neutralnej tj takiej, gdy zachowana stałość jest niezależna od wyjściowej frekwencji p i q
Więcej niż 2 allele w danym locus
Liczba możliwych genotypów:
M(m+1)/2
Przypadek trzech alleli:
p- frekwencja allelu A
q – frekwencja A’
r – a
Gamety męskie | |||
---|---|---|---|
Allel | A | A’ | |
Częstość | p | q | |
Allel | Częstość | AA | |
Gamety | A | p | p*p |
A’A | |||
Q*p | |||
żeńskie | A’ | q | aA |
A | R | r*p |
Zatem:
Genotyp: AA AA’ Aa A’A’ A’a aa
Częstość p2 2pq 2pr q2 2qr r2
Ogólnie:
Dla allelu o frekwencji p, frekwencji układów homozygotycznych będzie równa p2
Dla dwóch alleli o frekwencji pi i pj – frekwecja układów heterozygotycznych będzie równa 2pipj
Frekwecnja heterozygot:
Największa częstość heterozygot wystąpi gdy frekwecnje obu genów będą równe:
p=q=0,5
Przyjmijmy, że allel a jest genem rzadkim:
q<0,5
W do układu zrównoważonego, maleje częstość układów homozygotycznych aa i częstość heterozygot Aa, lecz ta pierwsza (homozygoty) maleje bardziej.
Jeśli częstość genu a maleje do 0
Częstość homozygot aa maleje do 0 zgodnie z q2
Częstość heterozygot maleje do 0 zgodnie z 2pq
Przykład
qa qa2 2pAqa 2pAqa/qa2
0,5 0,25 0,5 2
0,3 0,09 0,49 4,67
0,01 0,0001 0,0198 198
Im dana forma allelu występuje rzadziej, tym wię,sza jej część występuje w układach heterozygotycznych. Jeśli częstość genu rośnie do 1 wrześnbia liczba układów homozygotycznych z tą formą allelu przy malejącej częstotliwości heterozygot.
pA pA2 2 pAqa 2pAqa/ pA2
0,5 0,25 0,5 2
0,7 0,49 0,42 0,86
0,99 0,9801 0,0198 0,02
Geny sprzężone z płcią:
W przypadku większości loci z chromosomu X nie mają one odpowiednika w chromosomie Y, zatem samce posiadają tylko jedną kopię genu.
Przykład:
Frekwencja genów u obu p-łci jest taka sama czyli p i q
X | Y | ||||
Allel | XA | Xa | |||
Częstość | p | Q | |||
Żeńskie | Częstość | XAXA p*p |
XAXa | XAY | |
XA | p*q | p | |||
Xa | XaXA | aa | XaY | ||
p*q | q*q | q |
U samic częstość genotypów jest zgodna z równaniem HW
XAXA p2
XAXa 2pq
XaXa q2
U samców jest równa częstośći genów
XAY p
XaY q