1950083542

Rozdział 4 dotyczy zagadnienia znajdowania zbioru genów znaczących. Zawiera propozycję ogólnego podejścia do problemu wyłonienia zestawu atrybutów istotnych dla dalszej analizy oraz omawia powszechnie stosowane w praktyce metody statystyczne dla atrybutów ciągłych i dyskretnych. Ograniczenie zbioru genów jest ważnym etapem poprzedzającym zastosowanie metod bardziej zaawansowanych, gdyż są one zwykle mało efektywne dla problemów o dużej wymiarowości.

Dane dotyczące ekspresji genów mają charakter ciągły. Rozdział 5 szczegółowo omawia popularne algorytmy dyskretyzacji. Ich zastosowanie umożliwia analizę z wykorzystaniem metod odkrywania wiedzy.

W rozdziale 6 rozważane jest zagadnienie znajdowania grup genów o dużej zdolności rozróżniania obiektów. Do tego celu wykorzystane zostały elementy teorii zbiorów przybliżonych. Dużo miejsca poświęcone jest wyznaczaniu reduktów względnych tablicy decyzyjnej. Dla tego problemu przytoczone zostały podejścia spotykane w literaturze, a także zaproponowany algorytm przybliżony oparty o dekompozycję przestrzeni możliwych podzbiorów atrybutów.

Rozdział 7 opisuje ideę wzorców wyłaniających. Szczegółowo omówione jest wyznaczanie przestrzeni wzorców wyskakujących i jej zastosowanie do wyznaczania charakterystycznych profili ekspresji genów.

W rozdziale 8 zajmujemy się porównaniem pojęcia reduktu i wzorca wyskakującego. Przedstawione są podstawowe przesłanki teoretyczne przemawiające za powiązaniem tych pojęć oraz eksperymentalne metody służące odniesieniu właściwości zbioru reduktów do przestrzeni wzorców wyskakujących. W tym celu zdefiniowane zostały odpowiednie funkcje oceny istotności atrybutów.

Rozdział 9 zawiera opis analizy danych oraz jej rezultaty dla dwóch rzeczywistych zbiorów danych uzyskanych za pomocą techniki mikromacierzy. Dla badanych zestawów przeprowadzono porównanie wyznaczonych reduktów i wzorców wyskakujących za pomocą metod zaproponowanych w rozdziale 8. Otrzymane wyniki empiryczne zostały podsumowane omówieniem i odniesieniem do analiz prowadzonych przez inne zespoły.

Rozdział 10 obejmuje ogólny opis aplikacji wykorzystywanej do wykonania testów. Omówiony został przede wszystkim format plików wejściowych oraz sposób prowadzenia analizy.

Rozdział 11 zawiera podsumowanie całej pracy. Podkreślone zostały podstawowe elementy pracy, osobisty wkład oraz płynące z badań wnioski.

Rozdział 12 zawiera wykaz publikacji i zasobów internetowych wykorzystanych w pracy.

10