k biotechnologia id 229589 Nieznany

background image

1

OPIS KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3006w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Ewa Żymańczyk-Duda dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,

Zasady metabolizmu komórkowego,

Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba

godzin

1.

Molekularne podstawy życia

2.

Struktura funkcjonalna komórki

3.

Mitoza i mejoza

4.

Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii

5.

Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny

6.

Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta

-

sterowanie organizmem zwierzęcym

-

podpora i ruch ciała

-

przetwarzanie pożywienia

4

4

4

4

4

2

2

2

background image

2

-

wymiana gazowa

-

system transportu i odporności-komórki krwi

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Literatura uzupełniająca

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Warunki zaliczenia

egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3006w

Course title

Biology I

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Ewa Żymańczyk-Duda, dr inż.

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

exam

Prerequisites

background image

3

Course description

Structural and functional cell anatomy,

Cell metabolism universals,

Cell diversity and cooperation in multicellular systems

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.

Molecular basis of life

2.

Functional structure of cell

3.

Mitosis and meiosis

4.

Universals of cell metabolism. Energy processing

5.

Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants

6.

Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals

-

orchestrating the animal organism

-

movement and support

-

processing food and wastes

-

gas exchange

-

internal transport and defense-blood cells

4

4

4

4

4

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Additional literature

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Conditions of the course acceptance/ credition

exam

background image

4

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3006w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Barbara Lejczak Prof. dr hab.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,

Zasady metabolizmu komórkowego,

Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba

godzin

1.

Molekularne podstawy życia

2.

Struktura funkcjonalna komórki

3.

Mitoza i mejoza

4.

Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii

5.

Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny

6.

Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta

7.

sterowanie organizmem zwierzęcym

8.

podpora i ruch ciała

9.

przetwarzanie pożywienia

4

4

4

4

4

2

2

2

background image

5

10.

wymiana gazowa

11.

system transportu i odporności-komórki krwi

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Literatura uzupełniająca

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Warunki zaliczenia

egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3006w

Course title

Biology I

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Barbara Lejczak, Prof. dr hab.

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

exam

Prerequisites

background image

6

Course description

Structural and functional cell anatomy,

Cell metabolism universals,

Cell diversity and cooperation in multicellular systems

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.

Molecular basis of life

2.

Functional structure of cell

3.

Mitosis and meiosis

4.

Universals of cell metabolism. Energy processing

5.

Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants

6.

Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals

orchestrating the animal organism

movement and support

processing food and wastes

gas exchange

internal transport and defense-blood cells

4

4

4

4

4

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Additional literature

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Conditions of the course acceptance/ credition

exam

background image

7

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3007w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia II

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Barbara Lejczak Prof. dr hab.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Roślina, zwierzę-nowa generacja. Ewolucja prebiotyczna. Pochodzenie i historia życia. Biosfera i ekosystemy.
Elementy ekologii populacji. Chemizm oddziaływań pomiędzy organizmami.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba

godzin

1.

Jak powstaje i rozwija się organizm zwierzęcy ?

2.

Jak powstaje i rozwija się organizm roślinny ?

3.

Ź

ródła zmienności genetycznej.

4.

Jak powstało i ewoluowało życie ?

5.

Czynniki i mechanizmy ewolucji-pochodzenie gatunku.

6.

Przedmiot ekologii, podstawowe pojęcia.

7.

Procesy ekologiczne.

8.

Czynniki środowiska.

9.

Tolerancja ekologiczna.

10.

Ekologia biocenoz.

2

2

4

2

2

2

2

2

2

2

background image

8

11.

Sukcesja ekologiczna.

12.

Relacje pomiędzy organizmami tworzącymi biocenozę, chemia ekologiczna.

13.

Ekologia populacji.

2

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Literatura uzupełniająca

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Warunki zaliczenia

egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3007w

Course title

Biology II

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Barbara Lejczak, Prof. dr hab.

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

exam

Prerequisites

background image

9

Course description

Plant and animal – new generation. Prebiotic evolution. The origin and history of life. Bisphere and ecosystems.
Population ecology. Chemistry of the interaction between organisms.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.

Growth and development of a plant.

2.

Growth and development of an animal

3.

Chromosomes, genes, heredity.

4.

Life history and evolution.

5.

Mechanisms of evolution – the origin of species.

6.

Ecology – what is it about?

7.

Ecological processes.

8.

Environmental factors.

9.

Theory of ecological tolerance.

10.

Ecology of biocenoses.

11.

Succesion: ecosystem change and stability.

12.

Interactions between organisms.

13.

Population ecology.

2

2

4

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987

“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986

Additional literature

„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996

Conditions of the course acceptance/ credition

exam

background image

10

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3008w

Tytuł kursu/przedmiotu

Mikrobiologia

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Barbara Lejczak, Prof. dr hab.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

Zaliczone kursy: Biologia I oraz Biologia II

Krótki opis zawartości całego kursu

Charakterystyka drobnoustrojów. Wirusy i patogeny subwirusowe. Komórka prokariotyczna - anatomia
strukturalna. Zmienność genetyczna. Metabolizm. Grupy fizjologiczne drobnoustrojów. Systematyka i
diagnostyka.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1. Podstawowa charakterystyka drobnoustrojów.

2. Wirusy i patogeny subwirusowe.

3. Hodowla i wzrost mikroorganizmów.

4. Morfologia komórki prokariotycznej, struktury subkomórkowe i ich funkcje. Cykle

życiowe

5. Podział komórki, replikacja DNA i kontrola ekspresji genow.

6. Rodzaje i mechanizmy zmienności genetycznej u bakterii.

7. Metabolizm tlenowy bakterii.

8. Bakterie autotroficzne – fotosynteza bakteryjna

9. Bakterie autotroficzne – chemosynteza. Metanogeny i metylotrofy.

2

4

2

4

4

4

2

2

2

background image

11

10. Metabolizm beztlenowy bakterii – charakterystyka bakterii beztlenowych i

fermentujących.

11. Podstawy systematyki i diagnostyki bakterii.

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993

„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.

Literatura uzupełniająca

“Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie” P. Singleton, PWN 2000

Warunki zaliczenia

Egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3008w

Course title

Microbiology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Barbara Lejczak

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

exam

Prerequisites

background image

12

Passed exam: Biology I and Biology II

Course description

Characteristics of microorganisms. Viruses and subviral patogens. Structural and functional anatomy of
prokaryotic cell. Genetic diversity. Metabolism. Physiological groups of microorganisms. Principles of
systematics and diagnostics.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1. The basic characteristic of microorganisms.

2. Viruses and subviral patogens.

3. Nutrition, cultivation and growth of microorganisms.

4. Procaryotic cell organization, structure and function, life cycles.

5. Cell division, DNA replication, regulation of gene expression.

6. Mechanisms of genetic diversity in bacteria.

7. Bacterial aerobic metabolism.

8. Autotrophic bacteria – bacterial photosynthesis.

9. Autotrophic bacteria – chemolitotrophy. Metanogens, methylotrophs.

10. Bacterial anaerobic metabolism – characteristic of anaerobic bacteria.

Fermentating bacteria.

11. Principles of bacterial systematics and diagnostics.

2

4

2

4

4

4

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993

„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.

Additional literature

Conditions of the course acceptance/ credition

exam

background image

13

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:



Kod kursu/przedmiotu
BTC4034w,s

Tytuł kursu/przedmiotu
Metody biotechnologiczne w ochronie środowiska

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Katarzyna Chojnacka, dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego



Forma zaliczenia kursu
Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Liczba

punktów

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

3+2

Forma
zaliczenia

kolokwium

referat


Wymagania wstępne


Krótki opis zawartości całego kursu
Celem kursu jest przedstawienie metod biotechnologicznych stosowanych w oczyszczaniu wód, powietrza oraz
w unieszkodliwianiu odpadów stałych. Kurs obejmuje dyskusję zagadnień związanych zarówno z tradycyjnymi
metodami oczyszczania ścieków komunalnych pracujących na bazie osadu czynnego jak i metod nowoczesnych
usuwania zanieczyszczeń nieorganicznych (w tym metali ciężkich) oraz organicznych (ksenobiotyków) –
biosorpcji i bioakumulacji. Zostaną przedstawione również możliwości zastosowania organizmów żywych do
uzdatniania powietrza (biofiltry) oraz unieszkodliwiania odpadów stałych (kompostowanie, biodegradacja).

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych

Liczba godzin

1. Procesy biotechnologiczne w ochronie środowiska.
2. Charakterystyka zanieczyszczenia powietrza, wód oraz odpady stałe.
3. Oczyszczanie ścieków metodą osadu czynnego.
4. Mikrobiologia ścieków i osadu czynnego. Statyka i kinetyka wzrostu mikroorganizmów

oraz usuwania węgla (BZT

5

).

5. Nitryfikacja, denitryfikacja usuwanie związków fosforu.
6. Biosorpcja i bioakumulacja jonów metali ciężkich oraz związków organicznych.
7. Zastosowanie mikroorganizmów immobilizowanych do oczyszczania ścieków i

unieszkodliwiania odpadów.

8. Zastosowanie mikroalg i mikrofitów w biotechnologii środowiskowej.
9. Procesy biotechnologiczne w uzdatnianiu wody pitnej.
10. Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym.
11. Stawy i laguny.
12. Dezynfekcja.
13. Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków.
14. Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków.
15. Metody biohydrometalurgiczne.
16. Stabilizacja szlamów - trawienie tlenowe i beztlenowe..
17. Zagospodarowanie odpadów stałych – metody kompostowania.
18. Bioremediacja gruntów i gleb.
19. Uzdatnianie powietrza z zastosowaniem filtrów biologicznych.

1
1
2
2

2
2
2

2
1
2
2
1
1
2
1
1
1
1
1

background image

14

20. Biotechnologia odsiarczania węgla i ropy naftowej.
21. Przyszłość zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.

1
1


Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Celem seminarium jest samodzielne zapoznanie się z aktualnym stanem wiedzy naukowej i praktycznej
zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.. Będą poruszane następujące zagadnienia:

1.

Charakterystyka ścieków

2.

Terminologia w oczyszczaniu ścieków

3.

Konwencjonalne metody oczyszczania ścieków

4.

Osad czynny - mikrobiologia, hodowla, denitryfikacja, nitryfikacja, biologiczne metody usuwania
fosforu.

5.

Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym

6.

Stawy i laguny - procesy tlenowe i beztlenowe

7.

Biotechnologia środowiskowa mikroalg.

8.

Oczyszczanie przez glebę

9.

Bioremediacja i kompostowanie

10.

Stabilizacja szlamów

11.

Dezynfekcja

12.

Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków

13.

Zaawansowane metody oczyszczania ścieków

14.

Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków

15.

Przyszłość oczyszczania i ponownego wykorzystania ścieków

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna



Materiał do samodzielnego opracowania



Literatura podstawowa
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,

1995

5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,

1996

9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000

Literatura uzupełniająca



Warunki zaliczenia
kolokwium







background image

15

DESCRIPTION OF THE COURSES:


Course code
BTC4034w,s

Course title
Methods biotechnological in environmental protection

Supervising course lecturer
Katarzyna Chojnacka, Ph. D.

Other course lecturers



Course structure
Course form

Lecture

Classes

Laboratory

Project

Seminar

Number of

credits

Number of
hours /week

2

2

3+2

Form of the
course
completion

colloquium

lecture


Prerequisites


Course description
The aim of the lecture is to present biotechnological methods of water, air conditioning and solid wastes
treatment. The lecture discusses issues associated with traditional methods of municipal wastes treatment
(activated sludge method), as well as modern methods of inorganic (mainly heavy metals) and organic
(xenobiotics) pollutants removal with the application of processes of biosorption and bioaccumulation. Also the
possibilities of living organisms application in air treatment (biofilters) and solid wastes disposal (composting,
biodegradation) are discussed.

Lecture
Particular lectures contents

Number of hours

1. Biotechnological processes in environmental protection.
2. Characteristics of air and water pollutants and solid wastes.
3. Activated sludge method of wastewater treatment.
4. Microbiology of effluents and activated sludge. Statics and kinetics of microbial growth

and organic carbon removal (BOD).

5. Nitrification, denitrification, and phosphorus removal..
6. Biosorption and bioaccumulation of heavy metal ions and organic compounds.
7. The application of immobilized microorganisms in wastewater treatment and solid wastes

conditioning.

8. The application of microalgae and microphytes in environmental biotechnology.
9. Biotechnological methods of water purification.
10. Aerobic process in biological beds.
11. Ponds and lagoons.
12. Disinfection.
13. Design of unit process in wastewater treatment technologies.
14. Wastewater disposal and reuse.
15. Biohydrometallurgical methods.
16. Sludges conditioning - aerobic and anaerobic processes.
17. Utilization of solid wastes – composting methods.
18. Bioremediation of grounds and soils.
19. Air conditioning with the application of biological filters.

1
1
2
2

2
2
2

2
1
2
2
1
1
2
1
1
1
1
1

background image

16

20. Biotechnological methods of coal and crude oil desulfurization.
21. The future aspects of the application of biotechnological methods in environmental

protection.

1
1


Classes, seminars - the contents
The aim of the seminar is to check the state-of-the-art and know-how in the application of biotechnological
methods in environmental protection. The following problems will be discussed:
1.

Characteristics of effluents

2.

Terminology in wastewater treatment

3.

Conventional methods of wastewater treatment

4.

Activated sludge - microbiology, culture, nitrification, denitrification, biological processes of phosphorus
removal

5.

Aerobic process in biological beds.

6.

Ponds and lagoons - aerobic and anaerobic processes.

7.

Remediation by soil

8.

Bioremediation and composting

9.

Stabilization of sludges

10.

Disinfecting

11.

Wastewater treatment plant design

12.

Advanced methods of wastewater treatment

13.

Environmental microalgal biotechnology

14.

Wastes reuse and disposal

15.

The future trends in environmental biotechnology.


Laboratory, project – the contents


Material for self preparation


Core literature
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,

1995

5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,

1996

9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000
Additional literature


Conditions for course credition
lecture



background image

17

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:



Kod kursu/przedmiotu
TCC4227w,s

Tytuł kursu/przedmiotu
Ochrona środowiska

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Henryk GÓRECKI, prof. zw.

Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Józef Hoffmann, dr hab.; Helena Górecka, dr, Krystyna Hoffmann, dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.

Forma zaliczenia kursu
Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Liczba

punktów

Tygodniowa
liczba godzin

2

1

3+1

Forma
zaliczenia

egzamin

zaliczenie


Wymagania wstępne


Krótki opis zawartości całego kursu
Celem kursu jest przedstawienie podstawowych problemów związanych z ochroną środowiska przed
działalnością gospodarczą człowieka. W kursie uwzględniono przedstawienie problemów związanych z
obiegiem substancji w przyrodzie, ochroną ekosystemów. przedstawiona zostaną główne źródła przemysłowych
skażeń, a także wpływ działalności rolniczej na środowisko. Przedstawione szeroko metody monitorowania
skażeń, a także nowe systemy bezpiecznej dla środowiska budowli nowych obiektów przemysłowych.


Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych

Liczba godzin

1. Krążenie materii w przyrodzie
2. Cyrkulacja atmosfery
3. Rozprzestrzenianie się zanieczyszczeń w atmosferze
4. Obieg wody w przyrodzie
5. Antropogeniczne zagrożenia wód powierzchniowych i podziemnych
6. Składniki gleb i ich przemiany
7. Degradacja i ochrona gleb
8. Główne przyczyny zmian środowiska wywołane działalnością człowieka
9. Zanieczyszczenia wywołane przez produkcję rolną i hodowlaną
10. Główne rodzaje zanieczyszczeń wytwarzanych przez energetykę, przemysł ciężki, rolno-
spożywczy, papierniczy i inne.
11. Odpady komunalne: problemy ich składowania i utylizacji
12. Systemy monitoringu zanieczyszczeń środowiska
13. Międzynarodowe konwencje dotyczące ochrony środowiska
14. Zasady BAT – The Best Available Technology – w proekologicznym projektowaniu
15. Zasady zrównoważonego rolnictwa tzw. Code of the Best Agricultural Practice
16. Główne przepisy prawne i organizacja ochrony środowiska w Polsce.

1
1
2
2
2
2
2
2
2
2

2
2
2
2
2
2



background image

18

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Międzynarodowe programy ekologiczne

Program Odpowiedzialność i Troska

Proekologiczne rozwiązania w krajowym przemyśle

Rekultywacja terenów przemysłowych

Procedura inwestowania w przemyśle biolotechnologicznym i chemicznym

Oceny oddziaływania na środowisko

Bezpieczne dla środowiska systemy dystrybucji chemikaliów

Zasady bezpiecznego transportu i magazynowania

Gospodarka opakowaniami

Systemy zarządzania środowiskiem – ISO – 14 000

Racjonalna gospodarka wodno-ściekowa

Eutrofizacja zbiorników wodnych

Związki fosforu w środowisku

Obieg związków azotu w środowisku przyrodniczym

Gospodarka odpadami i osadami ściekowymi

Racjonalizacja zużycia energii w produkcji biotechnologicznej i chemicznej

Obieg metali w środowisku i łańcuchu pokarmowym

Dopuszczalna emisja

Bezpieczne dla zdrowia i środowiska warunki pracy

Dyrektywy Unii Europejskiej chroniące środowisko

Bezpieczne dla zdrowia i środowiska stosowanie agrochemikaliów

Ś

wiatowe katastrofy ekologiczne.



Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna


Materiał do samodzielnego opracowania


Literatura podstawowa
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego, 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne 2002
P. Kowali – Ochrona środowiska glebowego 2002.

Literatura uzupełniająca
Pr. Zbior. - Zarządzanie środowiskiem 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska 1999

Warunki zaliczenia
egzamin


DESCRIPTION OF THE COURSES:


Course code
TCC4227w,s

Course title

Environmental protection


Supervising course lecturer
Henryk GÓRECKI, prof. zw.

background image

19


Othe course lecturers
Józef Hoffmann dr hab. Helena Górecka dr, Krystyna Hoffmann dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.


Course structure
Course form

Lecture

Classes

Laboratory

Project

Seminar

Number

of credits

Number of
hours /week

2

1

3+1

Form of the
course
completion

examination

test


Prerequisites


Course description
The main contamination of environment caused by energetic system, industry, agricultural – food industry, paper
industry, petroleum industry, fertilizer industry. Municipal wastes, their storage and utilization. Monitoring of
environmental pollution. System of the Best Available Technology. The Best Code of Agricultural Practice.
International convention on environmental protection. Environmental regulations and organization of
environmental protection in Poland.


Lecture
Particular lectures contents

Number of hours

1. Substances circulation in nature
2. Circulation in atmosphere
3.Propagation of impurities in atmosphere
4. Water cycle in nature
5. Antropogenic pollution of surface and underground water
6. The chemistry of soils
7.Soil degradation and soil protection
8. The main of environmental changes caused by human activity
9. Pollution of the environment by agriculture and husbandry
10. The main contamination of environment caused by energetic system, industry,
agricultural-food industry, paper industry, petroleum industry, fertilizer industry
11. Municipal wastes, their storage and utilization
12. Monitoring of environmental pollution
13. System of Best Available Technology
14. The Best Code of Agricultural Practice
15. International conversion of environmental protection
16. Environmental regulations and organization of environmental protection in Poland .

1
1
2
2
2
2
2
2
2
2

2
2
2
2
2
2


Classes, seminars - the contents

International environmental programs

Responisible and Care Program

Safe and environmental solutions in domestic industry

Recultivation of post-industrial land

The investment system in chemical and biotechnological industry

Estimation of environmental impacts

Safe systems of chemical distribution

Application of packing in the environmental protection system

The principles of the safe transport and storage

Environmental Management System ISO 14 000

Management of water in industrial systems

Eutrofisation of rivers, lakes and coastal water

background image

20

Compounds of phosphorus in environment

Waste and sewage waste management system

Optimal energy use in biotechnological and chemical industry

Metals in environment and in food chain

Emission standard in industry

Safe occupational condition of work

Pollution control in directives of EC

Safe for health and environment agrochemical use

Ecological world catastrofes



Laboratory, project – the contents


Material for self preparation


Core literature
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne, 2002
P. Kawali – Ochrona środowiska glebowego, 2002


Additional literature
Pr. Zbior. – Zarządzanie środowiskiem, 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska, 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska, 1999.


Conditions for course credition







background image

21

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:



Kod kursu/przedmiotu
BTC4031w,c

Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria bioprocesowa I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Lucyna Górska, dr inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.


Forma zaliczenia kursu
Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Liczba

punktów

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

3 + 2

Forma
zaliczenia

egzamin

kolokwium


Wymagania wstępne


Krótki opis zawartości całego kursu
Charakterystyka reaktorów i bioreaktorów oraz metody ich obliczania i doboru.


Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych

Liczba godzin

1. Podstawy inżynierii bioreaktorów
2. Bilansowanie przemian biochemicznych
3. Bilans elementarny przemiany i przemiana podstawowa
4. Stopnie redukcji przemiany biochemicznej
5. Podstawy kinetyki reakcji enzymatycznych
6. Modele wzrostu populacji mikroorganizmów
7. Bioreaktory idealne
8. Bioreaktory nieidealne
9. Bilansowanie bioreaktorów
10. Makro - i mikromieszanie
11. Podstawowe typy hodowli wgłębnej
12. Bioreaktory enzymatyczne
13. Bioreaktory z unieruchomionym materiałem biologicznym
14. Obliczanie i projektowanie bioreaktorów

3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3


Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Zasady bilansowania obiektów otwartych i zamkniętych. Bilans masowy przepływu. Obliczenia oporów
przepływu w rurociągach. Praktyczne wykorzystanie równania Bernoulliego. Obliczanie wężownic, wypływ
cieczy ze zbiornika. Obliczenia instalacji pompowych i dobór pomp. Obliczenia dotyczące opadania cząstek
stałych. Rozdzielanie zawiesin: filtracja, płukanie placka filtracyjnego, sedymentacja. Prawa wymiany ciepła:
przewodzenie, wnikanie i przenikanie ciepła. Bilans wymiany ciepła. Obliczanie wymienników ciepła.

background image

22



Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna



Materiał do samodzielnego opracowania



Literatura podstawowa
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971


Literatura uzupełniająca
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986


Warunki zaliczenia
wykład: egzamin
ć

wiczenia: obecności, kolokwium



DESCRIPTION OF THE COURSES:


Course code
BTC4031w,c

Course title
Bioprocess engineering I

Supervising course lecturer
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.

Othe course lecturers
Lucyna Górska, dr inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.


Course structure
Course form

Lecture

Classes

Laboratory

Project

Seminar

Number of

credits

Number of
hours /week

2

2

3 + 2

Form of the
course
completion

examination

colloquium


Prerequisites


Course description
Reactors and bioreactors characteristics - methods of choice and calculation.

background image

23


Lecture
Particular lectures contents

Number of hours

1. Fundamentals of bioreactors engineering
2. Balance of biotechnological systems
3. Balance of basic transformations
4. Reduction degree in biochemical transformation
5. Fundamentals of enzyme reaction kinetics
6. Models of growth of microorganisms
7. Ideal bioreactors
8. Non-ideal bioreactors
9. Balance of bioreactors
10. Micro- and macromixing
11. Basic type of microorganisms growth
12. Enzyme bioreactors
13. Immobilization of biocatalyst
14. Bioreactors design

3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3


Classes, seminars - the contents
The rules of balancing of open and closed systems. Mass balance of flow. Calculation of flow resistances in
pipelines. Practical usage of Bernoulli equation. Pipe coil calculations, liquid out flow a tank. Pump installation
calculations and pump selection. Solid particles settlement calculations. Suspension separation: filtration,
sedimentation. Heat transfer laws: cocduction, individual and overall heat transfer. Heat transfer balance. Heat
exchanger calculations.



Laboratory, project – the contents



Material for self preparation



Core literature
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971



Additional literature
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986


Conditions for course credition
Lecture: examination
Classes: colloquium





background image

24

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:



Kod kursu/przedmiotu
BTC4032w,l

Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria bioprocesowa II

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Kołtuniewicz, prof. dr hab. inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Lucyna Górska, dr inż.



Forma zaliczenia kursu
Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Liczba

punktów

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

3+3

Forma
zaliczenia

egzamin

sprawozdania,

kolokwium


Wymagania wstępne
Inżynieria bioprocesowa I. Chemia fizyczna. Analiza matematyczna.


Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs przygotowuje do zrozumienia i stosowania dyfuzyjno – cieplnych procesów jednostkowych w biotechno-
logii do przygotowania i rozdziału substratów i produktów.


Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych

Liczba godzin

1. Przewodzenie ciepła, konwekcja, promieniowanie, wrzenie i kondensacja par
2. Nieustalony transport ciepła, Przykłady obliczeń cieplnych bioprocesów
3. Transport masy w bioprocesach,
4. Dyfuzja nieustalona i ustalona, Wyznaczanie współczynników dyfuzji
5. Mechanizmy transportu masy, Teorie transportu masy na granicy faz
6. Metody przygotowania surowców (up-stream processing0, dezintegracja komórek
7. Dobór metod oczyszczania i rozdziału bioproduktów
8.. Metody membranowe – odwrócona osmoza, nanofiltracja, ultrafiltracja, elektrodializa
9. Metody sorpcyjne, destylacja, ekstrakcja
10. Metody elektrokinetyczne
11. Suszenie materiałów biologicznych

7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3


Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna




Laboratorium, projekt
- zawartość tematyczna
Profil prędkości płynu w rurociągu. Charakterystyka pompy. Wyznaczanie współczynnika wypływu na
podstawie czasu opróżniania zbiornika. Wymiennik ciepła typu „rura w rurze”. Wnikanie i przenikanie ciepła w

background image

25

mieszalniku cieczy. Wnikanie ciepła przy wrzeniu cieczy. Wyznaczanie WRPT w rektyfikacyjnej kolumnie z
wypełnieniem. Charakterystyka kolumny wypełnionej. Objętościowy współczynnik i wysokość jednostki
przenikania masy. Stopień wyekstrahowania. Kinetyka rozpuszczania ciała stałego. Adsorpcja izotermiczna
okresowa.


Materiał do samodzielnego opracowania



Literatura podstawowa
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980

2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3

3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr


Literatura uzupełniająca
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985

2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji



Warunki zaliczenia
Wykład: egzamin pisemny i ustny
Laboratorium: sprawozdania i kolokwium


DESCRIPTION OF THE COURSES:


Course code
BTC4032w,l

Course title
Bioprocess engineering II

Supervising course lecturer
Andrzej Kołtuniewicz, dr hab. inż., prof.

Othe course lecturers
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Lucyna Górska, dr inż.


Course structure
Course form

Lecture

Classes

Laboratory

Project

Seminar

Number of

credits

Number of
hours /week

2

3

3 + 3

Form of the
course
completion

examination

reports, test


Prerequisites

Bioprocess engineering I. Physical chemistry. Mathematical analysis.


background image

26

Course description
The course prepares to understanding and application thermo-diffusional unit processes in biotechnology for
preparing and separation of substrates and products.




Lecture
Particular lectures contents

Number of hours

1. Conduction, convection, radiation, boiling, vapour condensation
2. Unsteady heat transport
3. Heat transport calculations in bioprocesses
4. Mass transport in bioprocesses
5. Unsteady and steady state diffusion.
6. Determination of diffusion coefficients
7. Mechanism of mass transfer
8. Mechanisms and theories on mass transport in interface
9. Mass transport calculations in bioprocesses
10. Diffusional methods of separation
11. Drying of biological materials

7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3

Classes, seminars - the contents


Laboratory, project – the contents
Distribution of fluid velocity in pipe. Pump characteristics. Determination of outflow coefficient by measuring
time of liquid discharge from a tank. Double pipe heat exchanger. Heat transfer in batch mixer. Heat transfer
during liquid evaporation. Determination of HETP in packed rectification column. Packed column
characteristics. Overall mass transfer coefficient and the height of mass transfer unit. Extraction efficiency.
Kinetics of solids dissolution. Periodic isothermal adsorption.


Material for self preparation


Core literature
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980

2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3

3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr


Additional literature
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985

2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji


Conditions for course credition
Lecture: Examination
Lab.: reports, test

background image

27

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4038w

Tytuł kursu/przedmiotu

Kultury tkankowe

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

biochemia, biologia molekularna, biologia komórki, inżynieria genetyczna

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs rozpoczyna się porównaniem budowy komórek roślinnych i zwierzęcych oraz kaskad regulacji procesów
fizjologicznych na poziomie molekularnym, po czym omawia czynniki determinujące i regulujące cykl
komórkowy. Wprowadza w sposoby prowadzenia hodowli różnych linii komórkowych roślinnych i zwierzęcych
(stałych i suspensyjnych) z uwzględnieniem wpływu czynników zewnętrznych na wzrost i różnicowanie
komórek. W trakcie kursu studenci będą mogli poznać techniki pozwalające na modyfikacje genetyczne
komórek prowadzonych w kulturze oraz metody wykorzystania kultur tkankowych i modyfikacji komórek do
produkcji roślin i zwierząt transgenicznych. Omówione zostanie zastosowanie hodowli komórkowych w
technologii komórkowej do klonowania roślin i zwierząt oraz do produkcji przeciwciał monoklonalnych.
Odrębna część wykładu poświęcona będzie badaniu podłoża molekularnego chorób genetycznych, testowaniu
nowoczesnych technik stosowanych w terapii genowej, poznawaniu molekularnych podstaw procesów
onkogenezy, identyfikacji onkogenów i genów supresorowych.. Kurs wprowadza również w zagadnienia
dotyczące procesów różnicowania i czynników, które indukują różnicowanie organizmów roślinnych i
zwierzęcych.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1.Budowa i fizjologia komórki zwierzęcej i roślinnej

2. Cykl komórkowy i jego regulacja na poziomie molekularnym .

3.Kultury komórkowe roślinne

4. Kultury komórkowe zwierzęce

5. Genetyczne modyfikacje komórek zwierzęcych

2

2

2

2

4

background image

28

6. Genetyczne modyfikacje komórek roślinnych

7. Produkcja przeciwciał monoklonalnych

8.Technologia komórkowa – klonowanie roślin i zwierząt

9. Kultury komórkowe w badaniu procesów onkogenezy i molekularnych podstaw chorób
genetycznych

10. Rożnicowanie i indukcja procesów różnicowania

4

2

4

4

4

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.

Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002

Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.

Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers.

Literatura uzupełniająca

Publikacje w czasopismach naukowych

Warunki zaliczenia

egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4038w

Course title

Plant and animal tissue cultures

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

background image

29

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

egzam

Prerequisites

biochemistry, molecular biology, cell biology, genetic engineering

Course description

The course starts with the comparison of the structure of the plant and animal cells as well as regulatory
cascades of the physiological processes, on the molecular level, and then discusses the factors which determine
and regulate the cell cycle. This course will introduce to the methods of growing tissue cultures of different plant
and animal cell lines (solid and in suspension) with the emphasis to the influence of the environmental factors on
the growth and differentiation of the cell. During this course the students will learn the techniques allowing
genetic transformation of the cells in the culture and the methods utilizing tissue cultures and cell modifications
for production of the transgenic plants and animals. The application of the tissue cultures in cell technology for
plants and animal coloning and in hybridoma technology will be discussed. The separate part of the course will
be devoted to depict the investigation of the molecular basiis of the genetic disorders, testing the modern
techniques being developed for gene therapy, revealing the molecular basis of oncogenesis and identification of
oncogenes and suppressor genes. The course will introduce also to the problems of differentiation processes and
the factors which induce differentiation in plant and animal organisms.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1. The structure and physiology of plant and animal cells

2. Cell cycle and its regulation on the molecular level

3. Plant tissue cultures

4. Animal tissue cultures

5. Genetic modification of animal cells

6. Genetic modifications of plant cells

7. Hybridoma technology

8. Cell technology – plant and animal cloning

9. Tissue cultures in investigation of oncogenesis and molecular basis of genetic disorders

10. Differentiation and induction of differentiation processes

2

2

2

2

4

4

2

4

4

4

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

background image

30

Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.

Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002

Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.

Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers

Additional literature

Publications in scientific journals

Conditions of the course acceptance/ credition

egzam

background image

31

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4036w

Tytuł kursu/przedmiotu

Inżynieria genetyczna

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

3

5

Forma zaliczenia

Egzamin

Wymagania wstępne

Biochemia I

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstaw inżynierii genetycznej. Obejmuje zagadnienia związane z podstawami inżynierii genetycznej.

Kurs omawia problemy zależności między ekspresją genów a ich funkcją, różne aspekty praktyczne i

teoretyczne klonowania genów, analizy sekwencji DNA, podstawowe pojęcia proteomiki i genomiki,

zagadnienia związane z otrzymywaniem rekombinowanych białek, jak również roli klonowania genów w

medycynie i rolnictwie.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1.

Co to jest klonowanie DNA? Wprowadzenie do podstawowych problemów i

technik inżynierii genetycznej.

2.

Plazmidy i bakteriofagi jako narzędzia transferu genów.

3.

Manipulowanie oczyszczonym DNA.

4.

Wektory i metody używane do klonowania w E. coli.

5.

Wektory i metody używane do klonowania w komórkach eukariotycznych.

6.

Poszukiwanie klonu specyficznego genu.

7.

Sekwencjonowanie DNA i mutageneza.

8.

Reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR).

9.

Badanie lokalizacji i struktury genu.

2

2

2

2

2

2

2

background image

32

10.

Badanie ekspresji i funkcji genu.

11.

Analiza genomów i proteomów.

12.

Produkcja białek rekombinowanych.

13.

Klonowanie DNA i jego analiza w medycynie.

14.

Klonowanie DNA i jego analiza w rolnictwie.

2

2

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa


Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4

th

edition, 2001, Blackwell Science Ltd.


Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.

Literatura uzupełniająca


Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6

th

edition, 2001, Blackwell

Science

Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3

rd

edition, 2003, Blackwell

Science

Warunki zaliczenia

Egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4036w

Course title

Genetic Engineering

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of

background image

33

points

Number of hours
/ week

3

5

Form of the
course
completion

Examination

Prerequisites

Biochemistry I

Course description

Course of the basics of genetic engineering. Course consists of the problems of relationships between gene

expression and function, molecular cloning, DNA manipulation, gene exploring, basics of proteomics and

genomics, obtaining of recombinant proteins and the role of cloned DNA in medicine and agriculture.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.

What is this DNA cloning? Introduction to basic problems and techniques of genetic

engineering.

2.

Vehicles for gene cloning: plasmids and bacteriophages.

3.

Manipulation of purified DNA.

4.

Cloning vectors for E. coli.

5.

Cloning vectors for eukaryotes.

6.

How to obtain a clone of a specific gene.

7.

DNA sequencing and mutagensis.

8.

The polymerase chain reaction (PCR).

9.

Studying gene location and structure.

10.

Studying gene expression and function.

11.

Studying genomes and proteomes.

12.

Production of recombinant proteins.

13.

Gene cloning and DNA analysis in medicine.

14.

Gene cloning and DNA analysis in forensic science.

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4

th

edition, 2001, Blackwell Science Ltd.

Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.

background image

34

Additional literature

Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6

th

edition, 2001, Blackwell

Science
Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3

rd

edition, 2003, Blackwell

Science

Conditions of the course acceptance/ credition

Examination

background image

35

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3010w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biochemia II

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Piotr Dobryszycki dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

Egzamin

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Kontynuacja kursu Biochemia I obejmująca zagadnienia związane z uzyskiwaniem energii w procesach
metabolicznych i biosyntezą elementów budulcowych.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1. Glikoliza.

2. Cykl Krebsa.

3.Fosforylacja oksydacyjna.

4.Szlak pentozofosforanowy i glukoneogeneza.

5.Metabolizm glikogenu.

6.Metabolizm kwasów tłuszczowych.

7.Rozkład aminokwasów i cykl mocznikowy.

8.Fotosynteza.

.9.Biosynteza lipidów i steroidów błon komórkowych

10.Biosynteza aminokwasów i hemu.

11.Biosynteza nukleotydów.

12.Integracja metabolizmu.

2

2

3

2

3

2

2

4

2

2

2

background image

36

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)

Literatura uzupełniająca

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Warunki zaliczenia

Egzamin testowy z Biochemią I

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3010w

Course title

Biochemistr II

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Piotr Dobryszycki, dr

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

examination

Prerequisites

Biochemistry I

Course description

Continuation of the Biochemistry I course which contains problems of transducing and storing energy and

background image

37

synthesizing the molecules of life.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1. Glycolisis.

2. The citric acid cycle.

3.Oxidative phosphorylation.

4.The pentose phosphate pathway and gluconeogenesis.

5.Glycogen metabolism.

6.Fatty acid metabolism.

7.Amino acid catabolism and urea cycle.

8.Photosynthesis.

.9.The biosynthesis of membrane lipids and steroids.

10.The biosynthesis of amino acids and heme.

11.Nucleotide biosynthesis.

12.The integration of metabolism

2

2

3

2

3

2

2

4

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)

Additional literature

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Conditions of the course acceptance/ credition

Test examination with Biochemistry I

background image

38

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC 4035w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biotechnologia

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Prof. dr hab. Barbara Lejczak, dr inż. Magdalena Klimek-Ochab

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

4

6

Forma zaliczenia

egzamin

Wymagania wstępne

Zaliczone kursy: Biologia I, II oraz Mikrobiologia

Krótki opis zawartości całego kursu

Praktyczne zastosowania procesów biotransformacji z użyciem mikroorganizmów i enzymów, selekcja i
odpowiednie przygotowanie mikroorganizmu do procesu biotechnologicznego. Biotechnologia w różnych
gałęziach przemysłu.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1.

Techniczne zastosowania biokatalizy, biokataliatory.

4

2.

Selekcja i doskonalenie mikroorganizmów. Produkcuja biomasy.

4

3.

Przechowywanie mikroorganizmów. Metody kontroli przyrostu biomasy.

4

4.

Formy biokatalizatorów i metody ich zastosowania.

4

5.

Dlaczego reakcje enzymatyczne? Mity i prawdy o zastosowaniu technicznym
enzymów.

4

6.

Procesy techniczne wykorzystujące jeden lub więcej etapów biokatalizowanych.

4

7.

Zastosowanie biotechnologii w przemyśle farmaceutycznym.

4

8.

Nowoczesna biotechnologia w medycynie.

4

9.

Technologiczne zastosowanie procesów fermentacji w przemyśle spożywczym.

4

10.

Biokatalityczne usprawnianie w produkcji żywności.

4

11.

Preparaty enzymatyczne w różnych dziedzinach przemysłu.

4

12.

Biotechnologia w przemyśle chemicznym.

4

13.

Biotechnologia w rolnictwie.

4

14.

Biotechnologia dla ochrony środowiska

4

15.

Biokopalnictwo.

4

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

background image

39

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993.

Literatura uzupełniająca

Warunki zaliczenia

egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC 4035w

Course title

Biotechnology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Numbr of
points

Number of hours
/ week

4

6

Form of the
course
completion

exam

Prerequisites

Passed exam from Biology I, II, Microbiology

Course description

Practical application of biotransformation, using microorganisms or enzymes, selection and preparation of
microorganisms for biotechnological process. Biotechnology in various branches of industry

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

background image

40

Technical application of biocatalysis, biocatalysts.

4

Selection and modyfication of microorganisms, biomass production.

4

Storage of microorganisms. Methods of biomass production control.

4

Forms of biocatalysts and application methods.

4

Why enzymatic reactions? Myth and facts on technical use of enzymes.
Technical processes using one or more biocatalysed steps.

4
4

Biotechnology in pharmaceutical industry.

4

Modern biotechnology in medicine.

4

Technological use of fermentation process in food industry.

4

Biocatalytic rationalization in food production.

4

Enzyme preparations in various branches of industry.

4

Biotechnology in chemical industry.

4

Biotechnology in agriculture.

4

Biotechnology fo environment protection.

4

Biomining.

4

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993

Additional literature

Conditions of the course acceptance/ credition

exam

background image

41

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3006l

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

Forma zaliczenia

kolokwium

Wymagania wstępne

Zaliczony kurs Biologia I.

Krótki opis zawartości całego kursu

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Technika pracy z mikroskopem. Anatomia i morfologia komórki. Tkanki roślinne i zwierzęce. Podziały
komórkowe. Utlenianie biologiczne. Wpływ czynników środowiska na komórki. Chemiczne składniki komórki.
Enzymy, oznaczanie aktywności enzymatycznej w materiale biologicznym.

Literatura podstawowa

C. Ville „Biologia”

Literatura uzupełniająca

G. Brum “Biology exploring life”

Warunki zaliczenia

background image

42

kolokwium

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC 3006l

Course title

Biology I

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

2

Form of the
course
completion

coloqium

Prerequisites

Course description

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Work with microscope. Cell anatomy and morphology. Plants and animal issues. Cell divisions. Biological
respiration. The influenze of environmental factors on cells. Chemical molecules of the cell. Enzymes. Assay of
enzymes activity in biological samples.

Basic literature

background image

43

C. Ville “Biologia”

Additional literature

G. Brum “Biology exploring life”.

Conditions of the course acceptance/ credition

coloqium

background image

44

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3008l

Tytuł kursu/przedmiotu

Mikrobiologia

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

Forma zaliczenia

kolokwium

Wymagania wstępne

Zaliczony kurs Biologia I i II.

Krótki opis zawartości całego kursu

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Praca w laboratorium mikrobiologicznym. Metody sterylizacji. Techniki posiewów. Oznaczanie liczby
komórek bakterii. Izolacja czystych kultur. Morfologia komórki bakteryjnej-barwienie. Wzrost bakterii.
Wymagania odżywcze mikroorganizmów. Oddychanie beztlenowe. Stosunki między drobnoustrojami.Wpływ
czynników fizycznych i chemicznych na drobnoustroje.

Literatura podstawowa

W.J.H. Kunicki-Goldfinger „Życie bakterii”

Literatura uzupełniająca

P.A. Ketchum „Microbiology”

Warunki zaliczenia

background image

45

kolokwium

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC 3008l

Course title

Microbiology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

2

Form of the
course
completion

coloqium

Prerequisites

Course description

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Principles of work in microbiological laboratory. Methods of sterilization. Techniques for growing cultures of
microorganisms. Isolation of pure cultures of microorganisms. Growth rates – bacterial growth curve.
Morphology of the bacterial cell – simple and differential staining. Nutrition requirements – bacterial growth.
Anaerobic respiration. Realationship between different bacterial species. The influenze of phisical and chemical
factors on microorganisms.

Basic literature

background image

46

W.J.H. Kunicki-Goldfinger “Życie bakterii”

Additional literature

P.A. Ketchum “Microbiology”

Conditions of the course acceptance/ credition

coloqium

background image

47

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4036l

Tytuł kursu/przedmiotu

Inżynieria genetyczna.

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Grzegorz Rymarczyk, mgr inż., Agnieszka Rusek mgr inż., Elżbieta Wieczorek dr inż., Iwona Grad dr inż.,
doktoranci Zakładu Biochemii

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

3

3

Forma zaliczenia

kolokwium

Wymagania wstępne

Biochemia I, Biochemia II, Biologia molekularna, Inżynieria genetyczna

Krótki opis zawartości całego kursu

Przygotowanie rekombinowanego genu i jego ekspresja w komórkach E.coli, jako przykład zastosowania
technik manipulacji DNA. Przygotowanie wektora ekspresyjnego pGEX-2T do klonowania w celu
przedstawienia postawowych technik laboratoryjnych inżynierii genetycznej.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin



Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

1. Amplifikacja fragmentu genu metodą PCR. 2. Elektroforeza analityczna produktów reakcji PCR. 3. Izolacja
DNA insertu z żelu agarozowego. 4. Ligacja insertu z wektorem ekspresyjnym. 5. transformacja komórek E.coli
produktem ligacji. 6. selekcja docelowego klonu insertu. 7. Ekspresja sklonowanego genu w E.coli. 8.
Elektroforeza SDS-PAGE jako metoda detekcji docelowego peptydu. 9. Przygotowanie komórek
kompetentnych. 10. Transformacja komórek plazmidem testowym. 11. Przygotowanie markera wagowego
DNA. 12. trawieniewektora ekspresyjnego enzymem restrykcyjnym. 13. Defosforylacja DNA wektorowego. 14.

background image

48

Elektroforeza preparatywna DNA wektorowego.

Literatura podstawowa

Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001

Literatura uzupełniająca

Warunki zaliczenia

Prawidłowe wykonanie doświadczenia. Nabycie umiejętności zaplanowania amplifikacji i ekspresji genu w
systemie bakteryjnym. Nabycie umiejętności zaplanowania i interpretacji eksperymentów manipulacji DNA.

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4036l

Course title

Genetic engineering.

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Ożyhar Andrzej, dr hab., prof

Names, first names and degrees of the team’s members

Grzegorz Rymarczyk, M.Sc.., Agnieszka Rusek M.Sc.., Elżbieta Wieczorek PhD., Iwona Grad PhD., doctoral
students of the Division of Biochemistry

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

3

3

Form of the
course
completion

test

Prerequisites

Biochemistry I, Biochemistry II, Molecular biology, Genetic engineering.

Course description

Preparation of a recombinant procaryotic expression vector as an example of basic DNA manipulation
techniques. Preparation of a cloned gene in a recombinant plasmid vector and its expression in E.coli host cells.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

background image

49

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

1. Preparation of competent E.coli host cells. 2. transformation of competent cells with a test pasmid. 3. DNA-
ladder preparation. 4. Restriction digestion of an expression vector. 5. Dephosphorylation of an expression
vector. 6. Preparative electrophoresis of vector DNA in agarose gel.. 7. Amplification of a desired gene fragment
using the PCR products. 8. Isolation of the insert DNA from an agarose gel. 9. Ligation of the insert into the
expression vector. 10. Transformation of E.coli cells with the ligation products. 11. selection of the desired
clone. 12. Expression of a cloned gene in E.coli host cells. 13. Detection of the target polypeptide using SDS-
PAGE analysis.

Basic literature

Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001

Additional literature

Conditions of the course acceptance/ credition

Students should perform the experiment correctly and acquire the ability to plan and interpret the results of basic
DNA manipulation techniques and plan the amplification and expression of a gene in a bacterial system.

background image

50

OPIS KURSÓW/PRZEDMIOTÓW


Kod kursu/przedmiotu
BTC 4044w

Tytuł kursu/przedmiotu
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne

Imię nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Prof. dr hab. inż. Paweł Kafarski


Imiona i nazwiska oraz tytuły/ stopnie członków zespołu dydaktycznego



Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Tygodniowa

liczba godzin

2

Forma
zaliczenia

kolokwium


Wymagania wstępne

Chemia organiczna, mikrobiologia, biochemia

Krótki opis zawartości całego kursu
Zastosowanie mikroorganizmów, enzymów i katalitycznych przeciwciał w syntezie organicznej

Wykład ( podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1

Definicje. Biotransformacje jako jeden ze sposobów unieczynniania
ksenobiotyków. Enzymy faz: pierwszej, drugiej i trzeciej biotransformacji.

2

2

Transformacje mikrobiologiczne jako narzędzie „Zielonej Chemii”. Dobór
mikroorganizmów, w tym kombinatoryjne projektowanie biokatalizatorów i
ukierunkowana ewolucja

2

3

Przykłady biokatalitycznych procesów utleniania-redukcji, manipulacja
stereoselektywnością reakcji

2

4

Reakcje hydroksylacji, transformacje mikrobiologiczne steroidów

2

5

Lipazy i mikroorganizmy lipolityczne, dobór biokatalizatorów, modelowanie
molekularne jako technika wspomagająca

2

6

Oksynitrylazy – od cyjanogenezy do syntezy asymetrycznej, procesy
chemoenzymatyczne

2

7

Biokatalityczna synteza epoksydów i dioli jako przykład transformacji
prowadzących do produktów z kilkoma centrami asymetrii

2

8

Glikotransferazy najpowszechniejszy przykład zastosowania transferaz

2

9

Biokataliza za pomocą immobilizowanych mikroorganizmów

2

10

Biokataliza w środowiskach niewodnych, micelarnych i w układach
dwufazowych

2

11

Biokataliza w mediach niekonwencjonalnych (gazy w stanie nadkrytycznym,
ciecze jonowe)

2

12

Transformacje enzymatyczne w przemysłach farmaceutycznym,

2

background image

51

kosmetycznym i chemicznym

13

Katalityczne przeciwciała i „sztuczne enzymy” jako biokatalizatory

2

14


Ć

wiczenia , seminarium – zawartość merytoryczna




Laboratorium, projekt – zawartość merytoryczna



Literatura podstawowa

P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995

Literatura dodatkowa

K. Drauz & H. Waldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002

Warunki zaliczenia

Egzamin wspólny z egzaminem z biotechnologii (w postaci dodatkowych pytań)


DESCRIPTION OF THE COURSES


Course code
BTC 4044w

Course title
Biotechnology – microbial transformations

Names, first name and degree of the lecturer/supervisor
Prof. Paweł Kafarski

Names, first names and degrees of the team’s members



Form in witch the courses should be completed
Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Numbers of
hours/week

2

Form of the
course
completion

test


background image

52


Prerequisites

Organic chemistry, microbiology, biochemistry

Course description
The use of microorganisms, enzymes and catalytic antibodies in organic synthesis

Lecture
Particular lectures contents

Number
of hours

1

Definitions. Biotransformations as a mean of degradation of xenobiotics. Enzymes
of first, second and third phase of biotransformation

2

2

Microbial transformations as a tool of “Green Chemistry”. The choice of
microorganisms including combinatorial design and directed evolution

2

3

Examples of biocatalytic red-ox processes, manipulations with stereoselectivity of
reaction

2

4

Hydroxylations, microbial transformations of steroids

5

Lipases and lypolitic microorganisms, choice of biocatalysts, molecular modelling
as helper technique

6

Oxynitrilases – from cyanogenesis to asymmetric synthesis, chemoenzymatic
processes

7

Biocatalytic synthesis of epoxides and diols as an example of transformations
leading to products with multiple asymmetric centers

8

Glycotransferases, the most popular example of transferases

9

Biocatalysis by means of immobilized microorganisms

10

Biocatalysis in non-aqueous, micellar and biphasic media

11

Biocatalysis in non-conventional media (supercritical gases, ionic liquids)

12

Enzymatic transformations in pharmaceutical, cosmetic and chemical industry

13

Catalytic antibodies and artificial enzymes as biocatalysts

14


Exercises, seminar –the contents



Laboratory, project –the contents



Basic literature

P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995

Additional literature

K. Drauz & H. WAldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002

Conditions of the course acceptance/credition

Exam written alongside with biotechnology test

background image

53

OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:



Kod kursu/przedmiotu
BTC 4044w

Tytuł kursu/przedmiotu
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Wanda Peczyńska – Czoch, dr hab.

Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego



Forma zaliczenia kursu
Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Liczba

punktów

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma
zaliczenia

kolokwium


Wymagania wstępne
Chemia organiczna, biochemia, mikrobiologia


Krótki opis zawartości całego kursu
Zastosowanie drobnoustrojów i izolowanych z nich enzymów do prowadzenia reakcji biotransformacji
związków organicznych


Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych

Liczba godzin

1. Metody prowadzenia reakcji transformacji mikrobiologicznych (biotransformacji)
2. Zasady doboru drobnoustrojów
3. Udział oksydoreduktaz w reakcjach biokonwersji
4. Reakcje biokonwersji katalizowane przez transferazy
5. Procesy hydrolityczne
6. Transformacje mikrobiologiczne w przemyśle farmaceutycznym
7. Kontrolowane procesy biodegradacyjne

2
2
6
2
8
6
4


Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna




Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna



Materiał do samodzielnego opracowania


background image

54

Literatura podstawowa



Literatura uzupełniająca



Warunki zaliczenia




DESCRIPTION OF THE COURSES:


Course code
BTC 4044w

Course title
Biotechnology – microbial transformations

Supervising course lecturer
Wanda Peczyńska – Czoch , dr hab.

Othe course lecturers




Course structure
Course form

Lecture

Classes

Laboratory

Project

Seminar

Number of

credits

Number of hours
/week

2

3

Form of the
course completion

test


Prerequisites
Organic chemistry, biochemistry, microbiology


Course description
Application of whole microbial cells and isolated enzymes to biotransformation of organic compounds


Lecture
Particular lectures contents

Number of hours

1.Methods of microbial transformations (biotransformations)
2. Selection of microrganisms
3.Oxidoreductases in bioconversion reactions
4.Transferases in bioconversion processes
5.Hydrolytic processes
6.Microbial transformations in pharmaceutical industry
7.Controlled biodegradative processes


Classes, seminars - the contents

background image

55




Laboratory, project – the contents



Material for self preparation



Core literature



Additional literature



Conditions for course credition







background image

56

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4037w,l

Tytuł kursu/przedmiotu

Mikrobiologia przemysłowa

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Magdalena Rucka, dr

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr inż.

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

3+2

Forma zaliczenia

egzamin

sprawozdania

Wymagania wstępne

Zaliczony kurs: Mikrobiologia ogólna

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs ma wprowadzić słuchaczy w zagadnienia związane z przemysłowymi metodami fermentacyjnymi.
Poruszane będą problemy przygotowywania podłóż, kultur starterowych, izolacji i ulepszania szczepów.
Omawiane będą typy hodowli, możliwości sterowania metabolizmem drobnoustrojów oraz wykorzystanie
komórek immobilizowanych.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1.Mikroorganizmy o znaczeniu przemysłowym

2.Selekcja mikroorganizmów, dobór kryteriów

3.Selekcja mutantów indukowanych syntezujących metabolity pierwotne, wtórne, enzymy o
znaczeniu przemysłowym.

4.Ulepszanie mikroorganizmów – metody

5.Przygotowanie kultur starterowych dla potrzeb przemysłowych

6.Metody przechowywania szczepów produkcyjnych

7.Podłoża przemysłowe

8.Typy hodowli drobnoustrojów, wykorzystanie przemysłowe, zalety i wady

9.Sterowanie metabolizmem. Indukcja, metody obejścia sprzężenia zwrotnego

2

2

2

2

2

2

2

4

2

background image

57

10.Fermentacja beztlenowa – wykorzystanie przemysłowe

11.Biosynteza związków biologicznie czynnych, szlaki metaboliczne, przykłady

12.Hodowla mikroorganizmów zrekombinowanych

13. Nośniki i metody unieruchamiania komórek mikroorganizmów

14. Przykłady zastosowań przemysłowych komórek unieruchomionych

2

2

2

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Izolacja drobnoustrojów o pożądanych właściwościach.

Przechowywanie i zabezpieczanie szczepów.

Typy hodowli.

Produkcja substancji biologicznie czynnych.

Ulepszanie szczepów

Immobilizacja komórek.

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

P. Stanbury , A.Whiteker :Principles of Fermentation Technology, Pergamon Press

Z.Libudzisz, K. Kowal: Mikrobiologia Techniczna, Politechnika Łódzka,2000

Literatura uzupełniająca

Warunki zaliczenia

Zdanie pozytywnie egzaminu

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4037w

Course title

Industrial Microbiology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Magdalena Rucka, dr

background image

58

Names, first names and degrees of the team’s members

Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr eng.,

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours /
week

2

2

3+2

Form of the course
completion

Exam

reports

Prerequisites

Microbiology

Course description

The course shall introduce listeners to industrial fermentation processes, isolation, preservation and
improvement of industrial important microorganisms. The development of inocula, types of cultures, control of
microbial metabolism are also discussed.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1. Microorganisms of industrial importance

2. Selection of microorganisms, criteria

3. Selection of induced mutants synthesizing primary, secondary metabolites and enzymes of
industrial importance

4. Improvement of industrially important microorganisms

5. Development of inocula for industrial purposes

6. Preservation of microorganisms

7. Media for industrial fermentation

8, Types of cultures, industrial application

9. Metabolism control

10.Anaerobic fermentation – industrial application

11.Biosynthesis of biologically active compounds

12.Culture of recombinant microorganisms

13.Carriers and methods of cell immobilization

14.Industrial application of immobilized cells

2

2

2

2

2

2

2

4

2

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Selection of microorganisms of desired characteristics

Preservation of microorganisms

background image

59

Types of culture

Production of biologically active substances

Improvement of strains

Immobilization of cells

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Additional literature

Conditions of the course acceptance/ credition

Exam

background image

60

OPISY KURSU/ PRZEDMIOTU

Kod kursu/przedmiotu

BTC3011w
Tytuł kursu/przedmiotu

Biofizyka

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Marek Langner dr hab.


Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

ć

wiczenia

laboratorium

Projekt

seminarium

Punkty

Tygodniowa liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia

Egzamin

Wymagania wstępne

Fizyka, analiza matematyczna, chemia fizyczna, biochemia

Krótki opis zawartości całego kursu

Celem wykładu jest przedstawienie metodologii i przedmiotu biofizyki. Prezentowany materiał został dobrany w
taki sposób aby student zapoznał się z kompleksowym podejściem do nauk biologicznych. Omawiane
zagadnienia łączą w sobie szereg dyscyplin naukowych, w tym fizykę, biochemię, biologię, chemii fizyczną
wraz z wybranymi zastosowaniami formalizmu matematycznego. Tematem wiodącym wykładu jest transmisja
sygnału nerwowego. Przykład ten pozwala przedstawić złożoność zjawisk na różnych poziomach organizacji
materii. Poczynając od oddziaływań na poziomie molekularnym, poprzez formowanie się struktur
supramolekularnych a kończąc na funkcjonowaniu organelli oraz całych komórek. W trakcie prezentowania tych
zagadnień omawiane są wybrane zagadnienia z termodynamiki, transportu masy, bioenergetyki oraz ich
znaczenie dla funkcjonowania komórki. Po wysłuchaniu wykładu student powinien posiadać zarówno wiedzę
szczegółową z zakresu prezentowanych zagadnień oraz ogólne rozeznanie w metodologii współczesnych nauk
biologicznych.

Wykład

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

L.godz.

1.

Wprowadzenie – poziomy organizacji materii ożywionej – skale czasowe, energetyczne i
przestrzenne.

2.

Przedmiot i podstawowe pojęcia termodynamiki.

3.

Energia swobodna – stany konformacyjne makromolekuł, enzym oraz znaczenie energii
swobodnej w procesach metabolicznych.

4.

Reakcje sprzężone oraz znaczenie nośników energii.

5.

Woda – właściwości, napięcie powierzchniowe, wiązanie wodorowe i efekt hydrofobowy.

6.

Elektrostatyka w układach wielofazowych.

7.

Oddziaływania van der Waalsa – teoria oraz znaczenie w układach biologicznych.

8.

Stałe wiązania oraz adsorpcja na granicy faz.

9.

Budowa błony biologicznej oraz transport bierny.

10.

Transport ułatwiony.

11.

Elektrostatyka błon biologicznych – potencjał błonowy, potencjał powierzchniowy i dipolowy.

12.

Transport aktywny oraz wybrane przykłady kanałów jonowych.

13.

Transport sprzężony – symport, antyport oraz pojęcie pompy głównej.

14.

Impuls nerwowy – potencjał spoczynkowy, aktywacja oraz transmisja sygnału nerwowego.

15.

Transformacja energii w układach biologicznych na przykładzie F

0

F

1

-ATPazy.

2

2
2
2
2

2
2
2
2
2


2

2

background image

61

2
2

2

Literatura podstawowa i dodatkowa

Klasyczne podręczniki z biochemii i chemii fizycznej. Artykuły naukowe i wybrane strony internetowe.
Materiały znajdujące się na stronie internetowej wykładu.

Warunki zaliczenia
Egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3011w

Course title

Biophysics

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

dr hab. Marek Langner

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Number of points

Number of hours / week

2

3

Form of the course completion

Exam

Prerequisites

Physics, biochemistry, physical chemistry, calculus.

Course description

The main aim of the lecture is to present the subject and methodology of biophysics. Presented material was
selected in such a way that student can acquire knowledge on the modern approaches to biological sciences.
Discussed problems are designed to show the synthesis of various sciences, including physics, biochemistry,
biology, physical chemistry along with selected application of mathematical formalisms. Leading theme of the
lecture is the transmission of nervous signal. This example allows to present the complexity of biological
processes occurring simultaneously on various organizational levels. Ranging from interactions between
molecules and macromolecules and supramolecular aggregates formation to the functioning of organelles and
whole cells. In the course of this presentation selected topic on thermodynamics, mass transport, bioenergetics as
well as their role for cell functioning are discuss. After completion of the lecture student should acquire the detail
knowledge on presented subject and general overview of methodology employed in studies on biological
material.

Lectures

Particular lectures contents

No. of hours

1. Introduction – the organization of biological material – time, distance and energy scale.
2. Basic concepts of thermodynamics
3. Free energy – conformational states of macromolecules, enzymes and meaning of free energy

2

2

background image

62

in metabolic processes.
4. Coupled reactions and the role of energy caring molecules.
5. Water – properties, surface tension, hydrogen bonds and hydrophobic effect.
6. Electrostatics in multiphase systems.
7. van der Waals interactions – theory and their role in biological systems.
8. Biding constant and adsorption on interfaces.
9. Structure of the biological membranes and passive transport.
10. Mediated transport.
11. Electrostatics of membranes – membrane, surface and dipole potentials.
12. Active transport and selected examples of ionic channels.
13. Coupled transport – symport, antiport and the concept of master pump.
14. Nerve signal – resting potential, activation and propagation of neuronal impulse.
15. Energy conversion in biological systems - F

0

F

1

-ATPze example.

2

2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2

2

Core and additional literature

Textbooks in Biochemistry and Physical Chemistry, scientific articles and selected web seats. Materials from the
lecture web-sit.

Conditions for course credition

Exam

background image

63

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4033l

Tytuł kursu/przedmiotu

Enzymologia

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Piotr Dobryszycki, adiunkt/dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Elżbieta Wieczorek, adiunkt/dr inż., Rusek Agnieszka, asystent/mgr inż., doktoranci Zakładu Biochemii I-4

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

3

3

Forma zaliczenia

cząstkowe

kolokwia

Wymagania wstępne

Rozpoczęcie kursu Biochemii I

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs obejmuje naukę metod otrzymywania, oczyszczania i wstępnego opisu enzymów. Studenci poznają m.in.
spektrofotometryczne metody wyznaczania stężenia enzymów, różne sposoby wyrażania aktywności
enzymatycznej, oznaczanie N-końcowego aminokwasu, badanie stabilności białek w oparciu o krzywe
denaturacyjne. Ponadto poznają wykorzystanie widm różnicowych i spektroskopii fluorescencyjnej w badaniach
enzymów.

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Kurs obejmuje: 1. Oznaczanie aktywności enzymatycznej króliczej aldolazy mięśniowej – aktywność
specyficzna, aktywność aldolazowa, aktywność całkowita. 2. Preparacja aldolazy z mięśni królika. 3.
Krystalizacja aldolazy, określenie wydajności preparacji 4. Trawienie aldolazy karboksypeptydazą A. 5.
Dansylowanie peptydu. 6. Chromatograficzne oznaczanie N-końcowej reszty peptydu. 7. Oznaczanie
fosforanów – metodą Amesa, Dubina. 8. Wyznaczanie stabilności enzymów w oparciu o zmiany przebiegu
krzywych denaturacyjnych 9. Wyznaczanie wydajności kwantowej fluoroforów – zastosowania spektroskopii
fluorescencyjnej w biochemii. 10. Metoda Bradford oznaczania białek,

background image

64

Literatura podstawowa

1.

Instrukcje do ćwiczeń.

2.

Oryginalne publikacje (dostarczone wraz z instrukcjami)

Literatura uzupełniająca

Podręcznik L. Stryera „Biochemia”

Warunki zaliczenia

Zaliczenie wszystkich kolokwiów cząstkowych i wszystkich sprawozdań z poszczególnych ćwiczeń.

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4033l

Course title

Enzymology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Piotr Dobryszycki, adjunct/dr

Names, first names and degrees of the team’s members

Elżbieta Wieczorek, adjunct/dr., Rusek Agnieszka, assistent/MS, PhD students of the Dept. of Biochemistry
Institute of Organic Chemistry Biochemistry and Biotechnology

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

3

3

Form of the
course
completion

colloquia

Prerequisites

Beginning of the Biochemistry I course

Course description

Course consists of the methods of isolation, purification and indroductory description of the enzymes such as
spectrophotometric methods of the determination of enzyme concentration, different ways of enzymatic activity
presentation, determination of peptide N-terminal residue, protein digestion, obtaining of difference spectra and
their application in the investigation of the enzyme stability, obtaining of the unfolding curves and their analysis
and the biochemical applications of the fluorescence spectroscopy.

Exercises, seminars – the contents

background image

65

Laboratory, project – the contents

Course consists of: 1. Determination of the enzymatic activity of rabbit muscle aldolase. – specific activity,
aldolase activity, total activity. 2. Preparation of aldolase from rabbit muscle. 3. Aldolase crystallization,
calculation of the preparation yield. 4. Aldolase digestion with carboxypeptidase A 5. Peptide N-terminus
labeling with dansyl chloride. 6. Chromatographic identification of N-terminal residue. 7. Method of Ames and
Dubin – organic phosphor determination. 8. Determination of protein stability basing on the changes of
denaturation curves. 9. Determination of protein fluorophores quantum yield – biochemical applications of
fluorescence spectroscopy. 10. Bradford method – determination of protein concentration.

Basic literature

1.

The inctructions to excercises.

2.

Original papers .

Additional literature

L. Stryer „Biochemistry” textbook.

Conditions of the course acceptance/ credition

Passing all the colloquia and preparation of all the excercises’ reports.

background image

66

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BLC5005w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia molekularna

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

3

5

Forma zaliczenia

Wymagania wstępne

Zaliczenie kursu Biochemii

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.


2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.


3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.

4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.

5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.

6.

Mechanizmy naprawy DNA.


7.

Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i

eukariontów.

8.

Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.

9.

Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.

2

2

2

2

2

2

2

2

2

background image

67


10.

Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.


11.

Kontrola ekspresji genów u prokariontów.


12.

Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.


13.

Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.


14.

Terapia genowa.

2

2

2

2

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna2

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Stryer „Biochemia”, PWN 2002

Bruce Alberts

,

Dennis Bray

,

Julian Lewis

,

Martin Raff

,

Keith Roberts

,

James D. Watson

"Molecular Biology of

the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002

Literatura uzupełniająca

Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002

Warunki zaliczenia

Egzamin

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BLC5005w

Course title

Molecular biology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Andrzej Ożyhar dr hab., prof.

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Punkty

background image

68

Number of hours
/ week

3

5

Form of the
course
completion

examination

Prerequisites

Course description

Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours


1. DNA and RNA – chemical composition and structure

2.

Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.


3.

DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.


4.

Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.


5.

DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.


6.

Mechanisms of DNA repair.


7.

Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.


8.

Prokaryotic DNA replication.

9.

Eukaryotic DNA replication.


10.

Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.

11.

Control of prokaryotic gene expression.

12.

Control of gene expression in eukaryotic cells

13.

Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational

modifications.

14.

Gene therapy.

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

aboratory, project – the contents

background image

69

Basic literature

Stryer „Biochemia”, PWN 2002

Bruce Alberts

,

Dennis Bray

, Julian Lewis,

Martin Raff

,

Keith Roberts

,

James D. Watson

"Molecular Biology of

the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002

Additional literature

Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002

Conditions of the course acceptance/ credition

Passing an examination.

background image

70

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BLC5005s

Tytuł kursu/przedmiotu

Biologia molekularna

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

2

Forma zaliczenia


kolokwium

Wymagania wstępne

Kurs towarzyszący Biologii Molekularnej (BLC5005w)

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.


2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.


3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.

4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.

5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.

15.

Mechanizmy naprawy DNA.


16.

Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i

eukariontów.

background image

71

17.

Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.

18.

Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.

19.

Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.


20.

Kontrola ekspresji genów u prokariontów.


21.

Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.


22.

Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.


23.

Terapia genowa.

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Stryer „Biochemia”, PWN 2002

Bruce Alberts

,

Dennis Bray

,

Julian Lewis

,

Martin Raff

,

Keith Roberts

,

James D. Watson

"Molecular Biology of

the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002

Literatura uzupełniająca

Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002

Warunki zaliczenia

kolokwium zaliczeniowe

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BLC5005s

Course title

Molecular biology

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Ożyhar Andrzej, dr hab., prof

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

background image

72

Number of hours
/ week

2

2

Form of the
course
completion


colloqium

Prerequisites

Course description

Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

Exercises, seminars – the contents


1. DNA and RNA – chemical composition and structure

15.

Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.


16.

DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.


17.

Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.


18.

DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.


19.

Mechanisms of DNA repair.


20.

Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.


21.

Prokaryotic DNA replication.

22.

Eukaryotic DNA replication.


23.

Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.

24.

Control of prokaryotic gene expression.

25.

Control of gene expression in eukaryotic cells

26.

Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational modifications.

27.

Gene therapy.

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Stryer „Biochemistry”, W.H. Freeman ed. , 1997

Bruce Alberts

,

Dennis Bray

,

Julian Lewis

,

Martin Raff

,

Keith Roberts

,

James D. Watson

"Molecular Biology of

background image

73

the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002

Additional literature

Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002

Conditions of the course acceptance/ credition

Colloqium

background image

74

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3009w

Tytuł kursu/przedmiotu

Biochemia I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Piotr Dobryszycki dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia kolokwium

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstaw biochemii obejmujący zagadnienia związane z budową i funkcją białek i kwasów nukleinowych,
podstawy enzymologii, metabolizm, funkcjonowanie błon biologicznych, przekazywanie sygnałów
biologicznych, podstawowe pojęcia immunologii.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

1.Struktura i funkcja białek.

2. Poznawanie białek.

3.DNA i RNA : cząsteczki dziedziczności.

4.Hemoglobina: przykład białka allosterycznego.

5.Enzymy: podstawowe pojęcia i kinetyka.

6.Strategie katalityczne.

7.Strategie regulacyjne.

8.Budowa i dynamika błony.

.9.Kanały i pompy błonowe

10.Przeciwciała i receptory limfocytów T.

11.Motory molekularne.

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

background image

75

12.Fałdowanie się i projektowanie białek.

13.Metabolizm: podstawowe pojęcia i organizacja.

14.Węglowodany.

2

2

2

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)

Literatura uzupełniająca

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Warunki zaliczenia

Egzamin testowy łącznie z Biochemia II

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3009w

Course title

Biochemistry I

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Piotr Dobryszycki dr

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

background image

76

Prerequisites

Course description

Course of the basics of biochemistry. Course consists of the problems of protein and nucleic acids structure and
function, enzymology, intoduction to metabolism, biological membranes, biological signals transduction, basics
of immunology.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.Protein structure and function.

2. Exploring proteins.

3.DNA and RNA : molecules of heredity.

4.Hemoglobin : example of allosteric protein.

5.Enzymes: basic concepts and kinetics.

6.Catalytic strategies.

7.Regulatory strategies.

8.Membranes structure and dynamics.

.9.Membrane channels and pumps.

10.Antibodies and lymphocyte T receptors.

11.Molecular motors.

12.Protein folding and design.

13.Metabolism: basic concepts and organization.

14.Carbohydrates.

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

2

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)

Additional literature

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Conditions of the course acceptance/ credition

Test examination with Biochemistry II

background image

77

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC4030w

Tytuł kursu/przedmiotu

Genetyka

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

2

3

Forma zaliczenia Egzamin

Wymagania wstępne

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstaw genetyki z odniesieniami do problemów medycznych. Opis genów i ich funkcji, analiza genomu,
regulacja ekspresji genów, genetyka populacyjna,

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin


1.

Genetyka Mendlowska.

2.

Dziedziczenie cech sprzężonych i uwarunkowanych przez płeć.

3.

Dziedziczenie cytoplazmatyczne.

4.

Ź

ródła zmienności genetycznej.

5.

Mapowanie genów.

6.

Analiza genomów.

7.

Choroby metaboliczne o podłożu genetycznym.

8.

Genetyka nowotworów.

9.

Genetyka populacyjna.

10.

Genetyka rozwoju.

3

3

3

3

3

3

3

3

background image

78

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002

Korf B.R. “ Genetyka człowieka” PWN 2003

Literatura uzupełniająca

Warunki zaliczenia

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC4030w

Course title

Genetics

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Ożyhar Andrzej, dr hab., prof

Names, first names and degrees of the team’s members

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

2

3

Form of the
course
completion

Examination

Prerequisites

background image

79

Course description

Course of genetics principles with medical problems approach. Description of the genes, their function, genome
analysis, gene expression regulation, genetics of population.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

1.

Mendelian genetics.

2.

Sex-linked genetic transmission.

3.

Cytoplasmatic inheritance.

4.

Origins of genetic changes.

5.

Gene mapping.

6.

Genom analysis.

7.

Inborn errors of metabolism.

8.

Genetics of cancer.

9.

Population genetics.

10.

Developmental genetics.

3

3

3

3

3

3

3

3

Exercises, seminars – the contents

Laboratory, project – the contents

Basic literature

Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002

Korf B.R. “ Human Genetics. A Problem Based Approach”

Additional literature

Conditions of the course acceptance/ credition

Examination

background image

80

OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:

Kod kursu/przedmiotu

BTC3009l

Tytuł kursu/przedmiotu

Biochemia I

Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego

Piotr Dobryszycki dr inż.

Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego

Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doktoranci Zakładu Biochemii i Laboratorium
Biochemii Medycznej P.Wr.

Forma zaliczenia kursu

Forma kursu

Wykład

Ć

wiczenia

Laboratorium

Projekt

Seminarium

Punkty

Tygodniowa
liczba godzin

4

4

Forma zaliczenia

kolokwium

Wymagania wstępne

Kurs równoległy z wykładem Biochemia I

Krótki opis zawartości całego kursu

Kurs podstawowych metod biochemii białek i kwasów nukleinowych.

Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)

Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów

Liczba godzin

Ć

wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna

Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna

Literatura podstawowa

Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)

Instrukcje do ćwiczeń

background image

81

Literatura uzupełniająca

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Warunki zaliczenia

Kolokwium

DESCRIPTION OF THE COURSES

Course code

BTC3009l

Course title

Biochemistry I

Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor

Piotr Dobryszycki dr

Names, first names and degrees of the team’s members

Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doctoral students of the Division of Biochemistry and
Laboratory of Medical Biochemistry Inst. Of Org. Chem., Biochemistry and Biotechnology.

Form in which the courses should be completed

Course form

Lecture

Exercises

Laboratory

Project

Seminar

Number of
points

Number of hours
/ week

4

4

Form of the
course
completion

colloqium

Prerequisites

Course parallel to Biochemistry I - lecture

Course description

Course of the basic methods of biochemistry of proteins and nucleic acids.

Lecture

Particular lectures contents

Number of hours

Exercises, seminars – the contents

background image

82

Laboratory, project – the contents

Excersises : 1. Enzymatic kinetics, 2. Protein’s thiol groups and disulphide bridges. 3. Effect of temperature and
pH on enzymatic activity. 4. Gel filtration. 5. Enzymatic hydrolysis. 6. Amphoteric character of amino acids and
proteins. 7.DNA isolation from calf thymus. 8.Analysis of DNA melting curve. 9. Analysis of mechanismis of
the enzymatic reaction. 10. Protein electrophoresis.

Basic literature

Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)

Instructions for excercises.

Additional literature

Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001

Conditions of the course acceptance/ credition

test


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
PODSTAWY BIOTECHNOLOGII id 3668 Nieznany
Biotechnologia id 89023 Nieznany
edema biotech materialy id 1501 Nieznany
Biotechnologia egzamin id 89038 Nieznany
biotech opracowanie 1 id 89010 Nieznany
biotechnologia zad 01 id 89134 Nieznany (2)
biotechnologia 160 id 89058 Nieznany
bol biotech materialy id 74968 Nieznany (2)
biotech pytania id 89008 Nieznany (2)
biotechnologia roslin1 id 89111 Nieznany (2)
Biotechnologia Wyklady id 89130 Nieznany (2)
edema biotech materialy id 1501 Nieznany
Biotechnologia egzamin id 89038 Nieznany
Abolicja podatkowa id 50334 Nieznany (2)
4 LIDER MENEDZER id 37733 Nieznany (2)
katechezy MB id 233498 Nieznany
metro sciaga id 296943 Nieznany
perf id 354744 Nieznany

więcej podobnych podstron