1
OPIS KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3006w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Ewa Żymańczyk-Duda dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,
Zasady metabolizmu komórkowego,
Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba
godzin
1.
Molekularne podstawy życia
2.
Struktura funkcjonalna komórki
3.
Mitoza i mejoza
4.
Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii
5.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny
6.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta
-
sterowanie organizmem zwierzęcym
-
podpora i ruch ciała
-
przetwarzanie pożywienia
4
4
4
4
4
2
2
2
2
-
wymiana gazowa
-
system transportu i odporności-komórki krwi
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Literatura uzupełniająca
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3006w
Course title
Biology I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Ewa Żymańczyk-Duda, dr inż.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
exam
Prerequisites
3
Course description
Structural and functional cell anatomy,
Cell metabolism universals,
Cell diversity and cooperation in multicellular systems
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
Molecular basis of life
2.
Functional structure of cell
3.
Mitosis and meiosis
4.
Universals of cell metabolism. Energy processing
5.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants
6.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals
-
orchestrating the animal organism
-
movement and support
-
processing food and wastes
-
gas exchange
-
internal transport and defense-blood cells
4
4
4
4
4
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Additional literature
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
4
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3006w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Barbara Lejczak Prof. dr hab.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Anatomia strukturalna i funkcjonalna komórki,
Zasady metabolizmu komórkowego,
Zróżnicowanie i współzależność komórek w układach wielokomórkowych
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba
godzin
1.
Molekularne podstawy życia
2.
Struktura funkcjonalna komórki
3.
Mitoza i mejoza
4.
Prawa i zasady metabolizmu komorkowego. Gromadzenie i przetwarzanie energii
5.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-rośliny
6.
Zróżnicowanie i współzależność komórek w systemie wielokomórkowym-zwierzęta
7.
sterowanie organizmem zwierzęcym
8.
podpora i ruch ciała
9.
przetwarzanie pożywienia
4
4
4
4
4
2
2
2
5
10.
wymiana gazowa
11.
system transportu i odporności-komórki krwi
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Literatura uzupełniająca
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3006w
Course title
Biology I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Barbara Lejczak, Prof. dr hab.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
exam
Prerequisites
6
Course description
Structural and functional cell anatomy,
Cell metabolism universals,
Cell diversity and cooperation in multicellular systems
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
Molecular basis of life
2.
Functional structure of cell
3.
Mitosis and meiosis
4.
Universals of cell metabolism. Energy processing
5.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-plants
6.
Cell diversity and cooperation in multicellular systems-animals
orchestrating the animal organism
movement and support
processing food and wastes
gas exchange
internal transport and defense-blood cells
4
4
4
4
4
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Additional literature
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
7
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3007w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia II
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Barbara Lejczak Prof. dr hab.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Roślina, zwierzę-nowa generacja. Ewolucja prebiotyczna. Pochodzenie i historia życia. Biosfera i ekosystemy.
Elementy ekologii populacji. Chemizm oddziaływań pomiędzy organizmami.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba
godzin
1.
Jak powstaje i rozwija się organizm zwierzęcy ?
2.
Jak powstaje i rozwija się organizm roślinny ?
3.
Ź
ródła zmienności genetycznej.
4.
Jak powstało i ewoluowało życie ?
5.
Czynniki i mechanizmy ewolucji-pochodzenie gatunku.
6.
Przedmiot ekologii, podstawowe pojęcia.
7.
Procesy ekologiczne.
8.
Czynniki środowiska.
9.
Tolerancja ekologiczna.
10.
Ekologia biocenoz.
2
2
4
2
2
2
2
2
2
2
8
11.
Sukcesja ekologiczna.
12.
Relacje pomiędzy organizmami tworzącymi biocenozę, chemia ekologiczna.
13.
Ekologia populacji.
2
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Literatura uzupełniająca
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3007w
Course title
Biology II
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Barbara Lejczak, Prof. dr hab.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
exam
Prerequisites
9
Course description
Plant and animal – new generation. Prebiotic evolution. The origin and history of life. Bisphere and ecosystems.
Population ecology. Chemistry of the interaction between organisms.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
Growth and development of a plant.
2.
Growth and development of an animal
3.
Chromosomes, genes, heredity.
4.
Life history and evolution.
5.
Mechanisms of evolution – the origin of species.
6.
Ecology – what is it about?
7.
Ecological processes.
8.
Environmental factors.
9.
Theory of ecological tolerance.
10.
Ecology of biocenoses.
11.
Succesion: ecosystem change and stability.
12.
Interactions between organisms.
13.
Population ecology.
2
2
4
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
„Cell and molecullar biology”, P. Sheeler, D.E. Bianchi, Willey 1987
“Biology –exploring life”, G.D. Brum , Willey 1986
Additional literature
„Biologia”. Solomon, Berg, Martin Ville, Multico, 1996
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
10
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3008w
Tytuł kursu/przedmiotu
Mikrobiologia
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Barbara Lejczak, Prof. dr hab.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
Zaliczone kursy: Biologia I oraz Biologia II
Krótki opis zawartości całego kursu
Charakterystyka drobnoustrojów. Wirusy i patogeny subwirusowe. Komórka prokariotyczna - anatomia
strukturalna. Zmienność genetyczna. Metabolizm. Grupy fizjologiczne drobnoustrojów. Systematyka i
diagnostyka.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1. Podstawowa charakterystyka drobnoustrojów.
2. Wirusy i patogeny subwirusowe.
3. Hodowla i wzrost mikroorganizmów.
4. Morfologia komórki prokariotycznej, struktury subkomórkowe i ich funkcje. Cykle
życiowe
5. Podział komórki, replikacja DNA i kontrola ekspresji genow.
6. Rodzaje i mechanizmy zmienności genetycznej u bakterii.
7. Metabolizm tlenowy bakterii.
8. Bakterie autotroficzne – fotosynteza bakteryjna
9. Bakterie autotroficzne – chemosynteza. Metanogeny i metylotrofy.
2
4
2
4
4
4
2
2
2
11
10. Metabolizm beztlenowy bakterii – charakterystyka bakterii beztlenowych i
fermentujących.
11. Podstawy systematyki i diagnostyki bakterii.
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993
„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.
Literatura uzupełniająca
“Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie” P. Singleton, PWN 2000
Warunki zaliczenia
Egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3008w
Course title
Microbiology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Barbara Lejczak
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
exam
Prerequisites
12
Passed exam: Biology I and Biology II
Course description
Characteristics of microorganisms. Viruses and subviral patogens. Structural and functional anatomy of
prokaryotic cell. Genetic diversity. Metabolism. Physiological groups of microorganisms. Principles of
systematics and diagnostics.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. The basic characteristic of microorganisms.
2. Viruses and subviral patogens.
3. Nutrition, cultivation and growth of microorganisms.
4. Procaryotic cell organization, structure and function, life cycles.
5. Cell division, DNA replication, regulation of gene expression.
6. Mechanisms of genetic diversity in bacteria.
7. Bacterial aerobic metabolism.
8. Autotrophic bacteria – bacterial photosynthesis.
9. Autotrophic bacteria – chemolitotrophy. Metanogens, methylotrophs.
10. Bacterial anaerobic metabolism – characteristic of anaerobic bacteria.
Fermentating bacteria.
11. Principles of bacterial systematics and diagnostics.
2
4
2
4
4
4
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
„Życie bakterii” W. Kunicki-Goldfinger, PWN 1993
„Microbiology – Concepts and applications”, P.Ketchum, Wiley 1988.
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
13
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4034w,s
Tytuł kursu/przedmiotu
Metody biotechnologiczne w ochronie środowiska
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Katarzyna Chojnacka, dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
3+2
Forma
zaliczenia
kolokwium
referat
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Celem kursu jest przedstawienie metod biotechnologicznych stosowanych w oczyszczaniu wód, powietrza oraz
w unieszkodliwianiu odpadów stałych. Kurs obejmuje dyskusję zagadnień związanych zarówno z tradycyjnymi
metodami oczyszczania ścieków komunalnych pracujących na bazie osadu czynnego jak i metod nowoczesnych
usuwania zanieczyszczeń nieorganicznych (w tym metali ciężkich) oraz organicznych (ksenobiotyków) –
biosorpcji i bioakumulacji. Zostaną przedstawione również możliwości zastosowania organizmów żywych do
uzdatniania powietrza (biofiltry) oraz unieszkodliwiania odpadów stałych (kompostowanie, biodegradacja).
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Procesy biotechnologiczne w ochronie środowiska.
2. Charakterystyka zanieczyszczenia powietrza, wód oraz odpady stałe.
3. Oczyszczanie ścieków metodą osadu czynnego.
4. Mikrobiologia ścieków i osadu czynnego. Statyka i kinetyka wzrostu mikroorganizmów
oraz usuwania węgla (BZT
5
).
5. Nitryfikacja, denitryfikacja usuwanie związków fosforu.
6. Biosorpcja i bioakumulacja jonów metali ciężkich oraz związków organicznych.
7. Zastosowanie mikroorganizmów immobilizowanych do oczyszczania ścieków i
unieszkodliwiania odpadów.
8. Zastosowanie mikroalg i mikrofitów w biotechnologii środowiskowej.
9. Procesy biotechnologiczne w uzdatnianiu wody pitnej.
10. Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym.
11. Stawy i laguny.
12. Dezynfekcja.
13. Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków.
14. Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków.
15. Metody biohydrometalurgiczne.
16. Stabilizacja szlamów - trawienie tlenowe i beztlenowe..
17. Zagospodarowanie odpadów stałych – metody kompostowania.
18. Bioremediacja gruntów i gleb.
19. Uzdatnianie powietrza z zastosowaniem filtrów biologicznych.
1
1
2
2
2
2
2
2
1
2
2
1
1
2
1
1
1
1
1
14
20. Biotechnologia odsiarczania węgla i ropy naftowej.
21. Przyszłość zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.
1
1
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Celem seminarium jest samodzielne zapoznanie się z aktualnym stanem wiedzy naukowej i praktycznej
zastosowania metod biotechnologicznych w ochronie środowiska.. Będą poruszane następujące zagadnienia:
1.
Charakterystyka ścieków
2.
Terminologia w oczyszczaniu ścieków
3.
Konwencjonalne metody oczyszczania ścieków
4.
Osad czynny - mikrobiologia, hodowla, denitryfikacja, nitryfikacja, biologiczne metody usuwania
fosforu.
5.
Tlenowy proces w nieruchomym złożu biologicznym
6.
Stawy i laguny - procesy tlenowe i beztlenowe
7.
Biotechnologia środowiskowa mikroalg.
8.
Oczyszczanie przez glebę
9.
Bioremediacja i kompostowanie
10.
Stabilizacja szlamów
11.
Dezynfekcja
12.
Projektowanie procesów jednostkowych w technologii oczyszczania ścieków
13.
Zaawansowane metody oczyszczania ścieków
14.
Zagospodarowanie i ponowne wykorzystanie ścieków
15.
Przyszłość oczyszczania i ponownego wykorzystania ścieków
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Materiał do samodzielnego opracowania
Literatura podstawowa
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,
1995
5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,
1996
9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
kolokwium
15
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
BTC4034w,s
Course title
Methods biotechnological in environmental protection
Supervising course lecturer
Katarzyna Chojnacka, Ph. D.
Other course lecturers
Course structure
Course form
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
Number of
credits
Number of
hours /week
2
2
3+2
Form of the
course
completion
colloquium
lecture
Prerequisites
Course description
The aim of the lecture is to present biotechnological methods of water, air conditioning and solid wastes
treatment. The lecture discusses issues associated with traditional methods of municipal wastes treatment
(activated sludge method), as well as modern methods of inorganic (mainly heavy metals) and organic
(xenobiotics) pollutants removal with the application of processes of biosorption and bioaccumulation. Also the
possibilities of living organisms application in air treatment (biofilters) and solid wastes disposal (composting,
biodegradation) are discussed.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Biotechnological processes in environmental protection.
2. Characteristics of air and water pollutants and solid wastes.
3. Activated sludge method of wastewater treatment.
4. Microbiology of effluents and activated sludge. Statics and kinetics of microbial growth
and organic carbon removal (BOD).
5. Nitrification, denitrification, and phosphorus removal..
6. Biosorption and bioaccumulation of heavy metal ions and organic compounds.
7. The application of immobilized microorganisms in wastewater treatment and solid wastes
conditioning.
8. The application of microalgae and microphytes in environmental biotechnology.
9. Biotechnological methods of water purification.
10. Aerobic process in biological beds.
11. Ponds and lagoons.
12. Disinfection.
13. Design of unit process in wastewater treatment technologies.
14. Wastewater disposal and reuse.
15. Biohydrometallurgical methods.
16. Sludges conditioning - aerobic and anaerobic processes.
17. Utilization of solid wastes – composting methods.
18. Bioremediation of grounds and soils.
19. Air conditioning with the application of biological filters.
1
1
2
2
2
2
2
2
1
2
2
1
1
2
1
1
1
1
1
16
20. Biotechnological methods of coal and crude oil desulfurization.
21. The future aspects of the application of biotechnological methods in environmental
protection.
1
1
Classes, seminars - the contents
The aim of the seminar is to check the state-of-the-art and know-how in the application of biotechnological
methods in environmental protection. The following problems will be discussed:
1.
Characteristics of effluents
2.
Terminology in wastewater treatment
3.
Conventional methods of wastewater treatment
4.
Activated sludge - microbiology, culture, nitrification, denitrification, biological processes of phosphorus
removal
5.
Aerobic process in biological beds.
6.
Ponds and lagoons - aerobic and anaerobic processes.
7.
Remediation by soil
8.
Bioremediation and composting
9.
Stabilization of sludges
10.
Disinfecting
11.
Wastewater treatment plant design
12.
Advanced methods of wastewater treatment
13.
Environmental microalgal biotechnology
14.
Wastes reuse and disposal
15.
The future trends in environmental biotechnology.
Laboratory, project – the contents
Material for self preparation
Core literature
1. The Civil Engineering Handbook, CRC Press, 2003 Biological Wastewater Treatment Processes
2. Wastewater Treatment, CRC, 1999
3. The Engineering Handbook, CRC Press, 1998 – Wastewater Treatment and Disposal
4. Klimiuk E., Kinetyka reakcji i modelowanie reaktorów biochemicznych w procesach oczyszczania ścieków,
1995
5. Forster, Christopher F. Environmental biotechnology, 1987
6. Volesky B., Biosorption of heavy metals / 1990
7. Szklarczyk, Mirosław. Biologiczne oczyszczanie gazów odlotowych, 1991
8. Kalisz, Liliana. Wykorzystanie makrofitow do oczyszczania ścieków w tzw. oczyszczalniach korzeniowych,
1996
9. Buraczewski, Gerard. Biotechnologia osadu czynnego, 1994
10. Biotechnologia ścieków :praca zbiorowa, 2000
Additional literature
Conditions for course credition
lecture
17
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
TCC4227w,s
Tytuł kursu/przedmiotu
Ochrona środowiska
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Henryk GÓRECKI, prof. zw.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Józef Hoffmann, dr hab.; Helena Górecka, dr, Krystyna Hoffmann, dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
Tygodniowa
liczba godzin
2
1
3+1
Forma
zaliczenia
egzamin
zaliczenie
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Celem kursu jest przedstawienie podstawowych problemów związanych z ochroną środowiska przed
działalnością gospodarczą człowieka. W kursie uwzględniono przedstawienie problemów związanych z
obiegiem substancji w przyrodzie, ochroną ekosystemów. przedstawiona zostaną główne źródła przemysłowych
skażeń, a także wpływ działalności rolniczej na środowisko. Przedstawione szeroko metody monitorowania
skażeń, a także nowe systemy bezpiecznej dla środowiska budowli nowych obiektów przemysłowych.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Krążenie materii w przyrodzie
2. Cyrkulacja atmosfery
3. Rozprzestrzenianie się zanieczyszczeń w atmosferze
4. Obieg wody w przyrodzie
5. Antropogeniczne zagrożenia wód powierzchniowych i podziemnych
6. Składniki gleb i ich przemiany
7. Degradacja i ochrona gleb
8. Główne przyczyny zmian środowiska wywołane działalnością człowieka
9. Zanieczyszczenia wywołane przez produkcję rolną i hodowlaną
10. Główne rodzaje zanieczyszczeń wytwarzanych przez energetykę, przemysł ciężki, rolno-
spożywczy, papierniczy i inne.
11. Odpady komunalne: problemy ich składowania i utylizacji
12. Systemy monitoringu zanieczyszczeń środowiska
13. Międzynarodowe konwencje dotyczące ochrony środowiska
14. Zasady BAT – The Best Available Technology – w proekologicznym projektowaniu
15. Zasady zrównoważonego rolnictwa tzw. Code of the Best Agricultural Practice
16. Główne przepisy prawne i organizacja ochrony środowiska w Polsce.
1
1
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
18
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
•
Międzynarodowe programy ekologiczne
•
Program Odpowiedzialność i Troska
•
Proekologiczne rozwiązania w krajowym przemyśle
•
Rekultywacja terenów przemysłowych
•
Procedura inwestowania w przemyśle biolotechnologicznym i chemicznym
•
Oceny oddziaływania na środowisko
•
Bezpieczne dla środowiska systemy dystrybucji chemikaliów
•
Zasady bezpiecznego transportu i magazynowania
•
Gospodarka opakowaniami
•
Systemy zarządzania środowiskiem – ISO – 14 000
•
Racjonalna gospodarka wodno-ściekowa
•
Eutrofizacja zbiorników wodnych
•
Związki fosforu w środowisku
•
Obieg związków azotu w środowisku przyrodniczym
•
Gospodarka odpadami i osadami ściekowymi
•
Racjonalizacja zużycia energii w produkcji biotechnologicznej i chemicznej
•
Obieg metali w środowisku i łańcuchu pokarmowym
•
Dopuszczalna emisja
•
Bezpieczne dla zdrowia i środowiska warunki pracy
•
Dyrektywy Unii Europejskiej chroniące środowisko
•
Bezpieczne dla zdrowia i środowiska stosowanie agrochemikaliów
•
Ś
wiatowe katastrofy ekologiczne.
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Materiał do samodzielnego opracowania
Literatura podstawowa
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego, 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne 2002
P. Kowali – Ochrona środowiska glebowego 2002.
Literatura uzupełniająca
Pr. Zbior. - Zarządzanie środowiskiem 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska 1999
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
TCC4227w,s
Course title
Environmental protection
Supervising course lecturer
Henryk GÓRECKI, prof. zw.
19
Othe course lecturers
Józef Hoffmann dr hab. Helena Górecka dr, Krystyna Hoffmann dr inż.
Adam Pawełczyk dr inż.
Course structure
Course form
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
Number
of credits
Number of
hours /week
2
1
3+1
Form of the
course
completion
examination
test
Prerequisites
Course description
The main contamination of environment caused by energetic system, industry, agricultural – food industry, paper
industry, petroleum industry, fertilizer industry. Municipal wastes, their storage and utilization. Monitoring of
environmental pollution. System of the Best Available Technology. The Best Code of Agricultural Practice.
International convention on environmental protection. Environmental regulations and organization of
environmental protection in Poland.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Substances circulation in nature
2. Circulation in atmosphere
3.Propagation of impurities in atmosphere
4. Water cycle in nature
5. Antropogenic pollution of surface and underground water
6. The chemistry of soils
7.Soil degradation and soil protection
8. The main of environmental changes caused by human activity
9. Pollution of the environment by agriculture and husbandry
10. The main contamination of environment caused by energetic system, industry,
agricultural-food industry, paper industry, petroleum industry, fertilizer industry
11. Municipal wastes, their storage and utilization
12. Monitoring of environmental pollution
13. System of Best Available Technology
14. The Best Code of Agricultural Practice
15. International conversion of environmental protection
16. Environmental regulations and organization of environmental protection in Poland .
1
1
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Classes, seminars - the contents
•
International environmental programs
•
Responisible and Care Program
•
Safe and environmental solutions in domestic industry
•
Recultivation of post-industrial land
•
The investment system in chemical and biotechnological industry
•
Estimation of environmental impacts
•
Safe systems of chemical distribution
•
Application of packing in the environmental protection system
•
The principles of the safe transport and storage
•
Environmental Management System ISO 14 000
•
Management of water in industrial systems
•
Eutrofisation of rivers, lakes and coastal water
20
•
Compounds of phosphorus in environment
•
Waste and sewage waste management system
•
Optimal energy use in biotechnological and chemical industry
•
Metals in environment and in food chain
•
Emission standard in industry
•
Safe occupational condition of work
•
Pollution control in directives of EC
•
Safe for health and environment agrochemical use
•
Ecological world catastrofes
Laboratory, project – the contents
Material for self preparation
Core literature
Z. Chłopek – Ochrona środowiska naturalnego 2002
K. Dudel – Ochrona i kształtowanie środowiska 2002
K. Górski – Ochrona środowiska, problemy społeczne, ekonomiczne i prawne, 2002
P. Kawali – Ochrona środowiska glebowego, 2002
Additional literature
Pr. Zbior. – Zarządzanie środowiskiem, 2001
B.C. Alloway – Chemiczne podstawy zanieczyszczania środowiska, 1999
F. Maciak – Ochrona i rekultywacja środowiska, 1999.
Conditions for course credition
21
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4031w,c
Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria bioprocesowa I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Lucyna Górska, dr inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
3 + 2
Forma
zaliczenia
egzamin
kolokwium
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Charakterystyka reaktorów i bioreaktorów oraz metody ich obliczania i doboru.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Podstawy inżynierii bioreaktorów
2. Bilansowanie przemian biochemicznych
3. Bilans elementarny przemiany i przemiana podstawowa
4. Stopnie redukcji przemiany biochemicznej
5. Podstawy kinetyki reakcji enzymatycznych
6. Modele wzrostu populacji mikroorganizmów
7. Bioreaktory idealne
8. Bioreaktory nieidealne
9. Bilansowanie bioreaktorów
10. Makro - i mikromieszanie
11. Podstawowe typy hodowli wgłębnej
12. Bioreaktory enzymatyczne
13. Bioreaktory z unieruchomionym materiałem biologicznym
14. Obliczanie i projektowanie bioreaktorów
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Zasady bilansowania obiektów otwartych i zamkniętych. Bilans masowy przepływu. Obliczenia oporów
przepływu w rurociągach. Praktyczne wykorzystanie równania Bernoulliego. Obliczanie wężownic, wypływ
cieczy ze zbiornika. Obliczenia instalacji pompowych i dobór pomp. Obliczenia dotyczące opadania cząstek
stałych. Rozdzielanie zawiesin: filtracja, płukanie placka filtracyjnego, sedymentacja. Prawa wymiany ciepła:
przewodzenie, wnikanie i przenikanie ciepła. Bilans wymiany ciepła. Obliczanie wymienników ciepła.
22
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Materiał do samodzielnego opracowania
Literatura podstawowa
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971
Literatura uzupełniająca
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986
Warunki zaliczenia
wykład: egzamin
ć
wiczenia: obecności, kolokwium
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
BTC4031w,c
Course title
Bioprocess engineering I
Supervising course lecturer
Andrzej Noworyta , prof. dr hab. inż.
Othe course lecturers
Lucyna Górska, dr inż.
Anna Trusek – Hołownia, dr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż.
Course structure
Course form
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
Number of
credits
Number of
hours /week
2
2
3 + 2
Form of the
course
completion
examination
colloquium
Prerequisites
Course description
Reactors and bioreactors characteristics - methods of choice and calculation.
23
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Fundamentals of bioreactors engineering
2. Balance of biotechnological systems
3. Balance of basic transformations
4. Reduction degree in biochemical transformation
5. Fundamentals of enzyme reaction kinetics
6. Models of growth of microorganisms
7. Ideal bioreactors
8. Non-ideal bioreactors
9. Balance of bioreactors
10. Micro- and macromixing
11. Basic type of microorganisms growth
12. Enzyme bioreactors
13. Immobilization of biocatalyst
14. Bioreactors design
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
Classes, seminars - the contents
The rules of balancing of open and closed systems. Mass balance of flow. Calculation of flow resistances in
pipelines. Practical usage of Bernoulli equation. Pipe coil calculations, liquid out flow a tank. Pump installation
calculations and pump selection. Solid particles settlement calculations. Suspension separation: filtration,
sedimentation. Heat transfer laws: cocduction, individual and overall heat transfer. Heat transfer balance. Heat
exchanger calculations.
Laboratory, project – the contents
Material for self preparation
Core literature
1. J. Szarawara - Podstawy inżynierii reaktorów, PWN 1991
2. R. Koch, A. Noworyta; Procesy mechaniczne w inżynierii chemicznej, WNT W-wa, 1992, 1995, 1997
3. T. Hobler; Ruch ciepła i wymienniki, WNT Warszawa 1971
Additional literature
J. E. Bailey, D.O.Ollis - Biochemical Eng. Fundamental, Mc Graw - Hill 1986
Conditions for course credition
Lecture: examination
Classes: colloquium
24
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4032w,l
Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria bioprocesowa II
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Kołtuniewicz, prof. dr hab. inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Lucyna Górska, dr inż.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
3+3
Forma
zaliczenia
egzamin
sprawozdania,
kolokwium
Wymagania wstępne
Inżynieria bioprocesowa I. Chemia fizyczna. Analiza matematyczna.
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs przygotowuje do zrozumienia i stosowania dyfuzyjno – cieplnych procesów jednostkowych w biotechno-
logii do przygotowania i rozdziału substratów i produktów.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Przewodzenie ciepła, konwekcja, promieniowanie, wrzenie i kondensacja par
2. Nieustalony transport ciepła, Przykłady obliczeń cieplnych bioprocesów
3. Transport masy w bioprocesach,
4. Dyfuzja nieustalona i ustalona, Wyznaczanie współczynników dyfuzji
5. Mechanizmy transportu masy, Teorie transportu masy na granicy faz
6. Metody przygotowania surowców (up-stream processing0, dezintegracja komórek
7. Dobór metod oczyszczania i rozdziału bioproduktów
8.. Metody membranowe – odwrócona osmoza, nanofiltracja, ultrafiltracja, elektrodializa
9. Metody sorpcyjne, destylacja, ekstrakcja
10. Metody elektrokinetyczne
11. Suszenie materiałów biologicznych
7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Profil prędkości płynu w rurociągu. Charakterystyka pompy. Wyznaczanie współczynnika wypływu na
podstawie czasu opróżniania zbiornika. Wymiennik ciepła typu „rura w rurze”. Wnikanie i przenikanie ciepła w
25
mieszalniku cieczy. Wnikanie ciepła przy wrzeniu cieczy. Wyznaczanie WRPT w rektyfikacyjnej kolumnie z
wypełnieniem. Charakterystyka kolumny wypełnionej. Objętościowy współczynnik i wysokość jednostki
przenikania masy. Stopień wyekstrahowania. Kinetyka rozpuszczania ciała stałego. Adsorpcja izotermiczna
okresowa.
Materiał do samodzielnego opracowania
Literatura podstawowa
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980
2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3
3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr
Literatura uzupełniająca
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985
2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji
Warunki zaliczenia
Wykład: egzamin pisemny i ustny
Laboratorium: sprawozdania i kolokwium
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
BTC4032w,l
Course title
Bioprocess engineering II
Supervising course lecturer
Andrzej Kołtuniewicz, dr hab. inż., prof.
Othe course lecturers
Anna Trusek – Hołownia, dr inż., Monika Kubasiewicz, mgr inż.
Sylwester Mielczarski, dr inż., Anna Niewiadomska, mgr inż.
Lucyna Górska, dr inż.
Course structure
Course form
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
Number of
credits
Number of
hours /week
2
3
3 + 3
Form of the
course
completion
examination
reports, test
Prerequisites
Bioprocess engineering I. Physical chemistry. Mathematical analysis.
26
Course description
The course prepares to understanding and application thermo-diffusional unit processes in biotechnology for
preparing and separation of substrates and products.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Conduction, convection, radiation, boiling, vapour condensation
2. Unsteady heat transport
3. Heat transport calculations in bioprocesses
4. Mass transport in bioprocesses
5. Unsteady and steady state diffusion.
6. Determination of diffusion coefficients
7. Mechanism of mass transfer
8. Mechanisms and theories on mass transport in interface
9. Mass transport calculations in bioprocesses
10. Diffusional methods of separation
11. Drying of biological materials
7
3
2
2
3
2
2
2
2
2
3
Classes, seminars - the contents
Laboratory, project – the contents
Distribution of fluid velocity in pipe. Pump characteristics. Determination of outflow coefficient by measuring
time of liquid discharge from a tank. Double pipe heat exchanger. Heat transfer in batch mixer. Heat transfer
during liquid evaporation. Determination of HETP in packed rectification column. Packed column
characteristics. Overall mass transfer coefficient and the height of mass transfer unit. Extraction efficiency.
Kinetics of solids dissolution. Periodic isothermal adsorption.
Material for self preparation
Core literature
1. J. Ciborowski - Inżynieria chemiczna, PWN 1980
2. J. M. Coulson, J. F. Richardson - Chemical Engineering, Pergamon 1983 vol.2 and 3
3. Laboratorium inżynierii procesowej cz. I i II - Skrypty PWr
Additional literature
1. M. M. Young - Comprehensive Biotechnology, vol. Pergamon 1985
2. R. Koch, A. Kozioł - Dyfuzyjno - cieplny rozdział substancji
Conditions for course credition
Lecture: Examination
Lab.: reports, test
27
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4038w
Tytuł kursu/przedmiotu
Kultury tkankowe
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
biochemia, biologia molekularna, biologia komórki, inżynieria genetyczna
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs rozpoczyna się porównaniem budowy komórek roślinnych i zwierzęcych oraz kaskad regulacji procesów
fizjologicznych na poziomie molekularnym, po czym omawia czynniki determinujące i regulujące cykl
komórkowy. Wprowadza w sposoby prowadzenia hodowli różnych linii komórkowych roślinnych i zwierzęcych
(stałych i suspensyjnych) z uwzględnieniem wpływu czynników zewnętrznych na wzrost i różnicowanie
komórek. W trakcie kursu studenci będą mogli poznać techniki pozwalające na modyfikacje genetyczne
komórek prowadzonych w kulturze oraz metody wykorzystania kultur tkankowych i modyfikacji komórek do
produkcji roślin i zwierząt transgenicznych. Omówione zostanie zastosowanie hodowli komórkowych w
technologii komórkowej do klonowania roślin i zwierząt oraz do produkcji przeciwciał monoklonalnych.
Odrębna część wykładu poświęcona będzie badaniu podłoża molekularnego chorób genetycznych, testowaniu
nowoczesnych technik stosowanych w terapii genowej, poznawaniu molekularnych podstaw procesów
onkogenezy, identyfikacji onkogenów i genów supresorowych.. Kurs wprowadza również w zagadnienia
dotyczące procesów różnicowania i czynników, które indukują różnicowanie organizmów roślinnych i
zwierzęcych.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.Budowa i fizjologia komórki zwierzęcej i roślinnej
2. Cykl komórkowy i jego regulacja na poziomie molekularnym .
3.Kultury komórkowe roślinne
4. Kultury komórkowe zwierzęce
5. Genetyczne modyfikacje komórek zwierzęcych
2
2
2
2
4
28
6. Genetyczne modyfikacje komórek roślinnych
7. Produkcja przeciwciał monoklonalnych
8.Technologia komórkowa – klonowanie roślin i zwierząt
9. Kultury komórkowe w badaniu procesów onkogenezy i molekularnych podstaw chorób
genetycznych
10. Rożnicowanie i indukcja procesów różnicowania
4
2
4
4
4
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
•
Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.
•
Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002
•
Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.
•
Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers.
Literatura uzupełniająca
Publikacje w czasopismach naukowych
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4038w
Course title
Plant and animal tissue cultures
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Elżbieta Wieczorek, adiunkt / PhD
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
29
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
egzam
Prerequisites
biochemistry, molecular biology, cell biology, genetic engineering
Course description
The course starts with the comparison of the structure of the plant and animal cells as well as regulatory
cascades of the physiological processes, on the molecular level, and then discusses the factors which determine
and regulate the cell cycle. This course will introduce to the methods of growing tissue cultures of different plant
and animal cell lines (solid and in suspension) with the emphasis to the influence of the environmental factors on
the growth and differentiation of the cell. During this course the students will learn the techniques allowing
genetic transformation of the cells in the culture and the methods utilizing tissue cultures and cell modifications
for production of the transgenic plants and animals. The application of the tissue cultures in cell technology for
plants and animal coloning and in hybridoma technology will be discussed. The separate part of the course will
be devoted to depict the investigation of the molecular basiis of the genetic disorders, testing the modern
techniques being developed for gene therapy, revealing the molecular basis of oncogenesis and identification of
oncogenes and suppressor genes. The course will introduce also to the problems of differentiation processes and
the factors which induce differentiation in plant and animal organisms.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. The structure and physiology of plant and animal cells
2. Cell cycle and its regulation on the molecular level
3. Plant tissue cultures
4. Animal tissue cultures
5. Genetic modification of animal cells
6. Genetic modifications of plant cells
7. Hybridoma technology
8. Cell technology – plant and animal cloning
9. Tissue cultures in investigation of oncogenesis and molecular basis of genetic disorders
10. Differentiation and induction of differentiation processes
2
2
2
2
4
4
2
4
4
4
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
30
•
Freshney, R. Ian. Culture of Animal Cells (4th ed.) Wiley-Liss Publisher.
•
Molecular biology of the cell /Bruce Alberts [et al.]. New York : Garland Science, 2002
•
Podstawy molekularne biologii komórki :aspekty medyczne /Gerald M. Fuller, Dennis Shields ; z jęz.
ang. tł. Hanna Kozłowska. Warszawa : Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2000.
•
Crispeels, M.J. and D. E. Sadava. 2003. Plants, genes and agriculture. Jones and Bartlett Publishers
Additional literature
Publications in scientific journals
Conditions of the course acceptance/ credition
egzam
31
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4036w
Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria genetyczna
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
3
5
Forma zaliczenia
Egzamin
Wymagania wstępne
Biochemia I
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstaw inżynierii genetycznej. Obejmuje zagadnienia związane z podstawami inżynierii genetycznej.
Kurs omawia problemy zależności między ekspresją genów a ich funkcją, różne aspekty praktyczne i
teoretyczne klonowania genów, analizy sekwencji DNA, podstawowe pojęcia proteomiki i genomiki,
zagadnienia związane z otrzymywaniem rekombinowanych białek, jak również roli klonowania genów w
medycynie i rolnictwie.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.
Co to jest klonowanie DNA? Wprowadzenie do podstawowych problemów i
technik inżynierii genetycznej.
2.
Plazmidy i bakteriofagi jako narzędzia transferu genów.
3.
Manipulowanie oczyszczonym DNA.
4.
Wektory i metody używane do klonowania w E. coli.
5.
Wektory i metody używane do klonowania w komórkach eukariotycznych.
6.
Poszukiwanie klonu specyficznego genu.
7.
Sekwencjonowanie DNA i mutageneza.
8.
Reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR).
9.
Badanie lokalizacji i struktury genu.
2
2
2
2
2
2
2
32
10.
Badanie ekspresji i funkcji genu.
11.
Analiza genomów i proteomów.
12.
Produkcja białek rekombinowanych.
13.
Klonowanie DNA i jego analiza w medycynie.
14.
Klonowanie DNA i jego analiza w rolnictwie.
2
2
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4
th
edition, 2001, Blackwell Science Ltd.
Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.
Literatura uzupełniająca
Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6
th
edition, 2001, Blackwell
Science
Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3
rd
edition, 2003, Blackwell
Science
Warunki zaliczenia
Egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4036w
Course title
Genetic Engineering
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Andrzej Ożyhar, dr hab., prof.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
33
points
Number of hours
/ week
3
5
Form of the
course
completion
Examination
Prerequisites
Biochemistry I
Course description
Course of the basics of genetic engineering. Course consists of the problems of relationships between gene
expression and function, molecular cloning, DNA manipulation, gene exploring, basics of proteomics and
genomics, obtaining of recombinant proteins and the role of cloned DNA in medicine and agriculture.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
What is this DNA cloning? Introduction to basic problems and techniques of genetic
engineering.
2.
Vehicles for gene cloning: plasmids and bacteriophages.
3.
Manipulation of purified DNA.
4.
Cloning vectors for E. coli.
5.
Cloning vectors for eukaryotes.
6.
How to obtain a clone of a specific gene.
7.
DNA sequencing and mutagensis.
8.
The polymerase chain reaction (PCR).
9.
Studying gene location and structure.
10.
Studying gene expression and function.
11.
Studying genomes and proteomes.
12.
Production of recombinant proteins.
13.
Gene cloning and DNA analysis in medicine.
14.
Gene cloning and DNA analysis in forensic science.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Brown, T.A. “Gene cloning and DNA analysis”, 4
th
edition, 2001, Blackwell Science Ltd.
Brown, T.A. “Genomy”, 2001, Wydawnictwo Naukowe PWN.
34
Additional literature
Primrose, S.B., Twyman, R.M., Old, R.W. “Principles of gene manipulation”, 6
th
edition, 2001, Blackwell
Science
Primrose, S.B., Twyman, R.M. “ Principles of genome analysis and genomics”, 3
rd
edition, 2003, Blackwell
Science
Conditions of the course acceptance/ credition
Examination
35
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3010w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biochemia II
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Piotr Dobryszycki dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
Egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Kontynuacja kursu Biochemia I obejmująca zagadnienia związane z uzyskiwaniem energii w procesach
metabolicznych i biosyntezą elementów budulcowych.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1. Glikoliza.
2. Cykl Krebsa.
3.Fosforylacja oksydacyjna.
4.Szlak pentozofosforanowy i glukoneogeneza.
5.Metabolizm glikogenu.
6.Metabolizm kwasów tłuszczowych.
7.Rozkład aminokwasów i cykl mocznikowy.
8.Fotosynteza.
.9.Biosynteza lipidów i steroidów błon komórkowych
10.Biosynteza aminokwasów i hemu.
11.Biosynteza nukleotydów.
12.Integracja metabolizmu.
2
2
3
2
3
2
2
4
2
2
2
36
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)
Literatura uzupełniająca
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Warunki zaliczenia
Egzamin testowy z Biochemią I
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3010w
Course title
Biochemistr II
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Piotr Dobryszycki, dr
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
examination
Prerequisites
Biochemistry I
Course description
Continuation of the Biochemistry I course which contains problems of transducing and storing energy and
37
synthesizing the molecules of life.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Glycolisis.
2. The citric acid cycle.
3.Oxidative phosphorylation.
4.The pentose phosphate pathway and gluconeogenesis.
5.Glycogen metabolism.
6.Fatty acid metabolism.
7.Amino acid catabolism and urea cycle.
8.Photosynthesis.
.9.The biosynthesis of membrane lipids and steroids.
10.The biosynthesis of amino acids and heme.
11.Nucleotide biosynthesis.
12.The integration of metabolism
2
2
3
2
3
2
2
4
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)
Additional literature
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Conditions of the course acceptance/ credition
Test examination with Biochemistry I
38
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC 4035w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biotechnologia
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Prof. dr hab. Barbara Lejczak, dr inż. Magdalena Klimek-Ochab
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
4
6
Forma zaliczenia
egzamin
Wymagania wstępne
Zaliczone kursy: Biologia I, II oraz Mikrobiologia
Krótki opis zawartości całego kursu
Praktyczne zastosowania procesów biotransformacji z użyciem mikroorganizmów i enzymów, selekcja i
odpowiednie przygotowanie mikroorganizmu do procesu biotechnologicznego. Biotechnologia w różnych
gałęziach przemysłu.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.
Techniczne zastosowania biokatalizy, biokataliatory.
4
2.
Selekcja i doskonalenie mikroorganizmów. Produkcuja biomasy.
4
3.
Przechowywanie mikroorganizmów. Metody kontroli przyrostu biomasy.
4
4.
Formy biokatalizatorów i metody ich zastosowania.
4
5.
Dlaczego reakcje enzymatyczne? Mity i prawdy o zastosowaniu technicznym
enzymów.
4
6.
Procesy techniczne wykorzystujące jeden lub więcej etapów biokatalizowanych.
4
7.
Zastosowanie biotechnologii w przemyśle farmaceutycznym.
4
8.
Nowoczesna biotechnologia w medycynie.
4
9.
Technologiczne zastosowanie procesów fermentacji w przemyśle spożywczym.
4
10.
Biokatalityczne usprawnianie w produkcji żywności.
4
11.
Preparaty enzymatyczne w różnych dziedzinach przemysłu.
4
12.
Biotechnologia w przemyśle chemicznym.
4
13.
Biotechnologia w rolnictwie.
4
14.
Biotechnologia dla ochrony środowiska
4
15.
Biokopalnictwo.
4
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
39
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993.
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC 4035w
Course title
Biotechnology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Numbr of
points
Number of hours
/ week
4
6
Form of the
course
completion
exam
Prerequisites
Passed exam from Biology I, II, Microbiology
Course description
Practical application of biotransformation, using microorganisms or enzymes, selection and preparation of
microorganisms for biotechnological process. Biotechnology in various branches of industry
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
40
Technical application of biocatalysis, biocatalysts.
4
Selection and modyfication of microorganisms, biomass production.
4
Storage of microorganisms. Methods of biomass production control.
4
Forms of biocatalysts and application methods.
4
Why enzymatic reactions? Myth and facts on technical use of enzymes.
Technical processes using one or more biocatalysed steps.
4
4
Biotechnology in pharmaceutical industry.
4
Modern biotechnology in medicine.
4
Technological use of fermentation process in food industry.
4
Biocatalytic rationalization in food production.
4
Enzyme preparations in various branches of industry.
4
Biotechnology in chemical industry.
4
Biotechnology in agriculture.
4
Biotechnology fo environment protection.
4
Biomining.
4
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Biotechnology – A Multi-Volume Comprehensive Treatise, VCH Verlagsgesellsehaft mbH, Weinheim,
Germany, 1993
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
exam
41
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3006l
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs Biologia I.
Krótki opis zawartości całego kursu
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Technika pracy z mikroskopem. Anatomia i morfologia komórki. Tkanki roślinne i zwierzęce. Podziały
komórkowe. Utlenianie biologiczne. Wpływ czynników środowiska na komórki. Chemiczne składniki komórki.
Enzymy, oznaczanie aktywności enzymatycznej w materiale biologicznym.
Literatura podstawowa
C. Ville „Biologia”
Literatura uzupełniająca
G. Brum “Biology exploring life”
Warunki zaliczenia
42
kolokwium
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC 3006l
Course title
Biology I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
2
Form of the
course
completion
coloqium
Prerequisites
Course description
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Work with microscope. Cell anatomy and morphology. Plants and animal issues. Cell divisions. Biological
respiration. The influenze of environmental factors on cells. Chemical molecules of the cell. Enzymes. Assay of
enzymes activity in biological samples.
Basic literature
43
C. Ville “Biologia”
Additional literature
G. Brum “Biology exploring life”.
Conditions of the course acceptance/ credition
coloqium
44
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3008l
Tytuł kursu/przedmiotu
Mikrobiologia
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs Biologia I i II.
Krótki opis zawartości całego kursu
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Praca w laboratorium mikrobiologicznym. Metody sterylizacji. Techniki posiewów. Oznaczanie liczby
komórek bakterii. Izolacja czystych kultur. Morfologia komórki bakteryjnej-barwienie. Wzrost bakterii.
Wymagania odżywcze mikroorganizmów. Oddychanie beztlenowe. Stosunki między drobnoustrojami.Wpływ
czynników fizycznych i chemicznych na drobnoustroje.
Literatura podstawowa
W.J.H. Kunicki-Goldfinger „Życie bakterii”
Literatura uzupełniająca
P.A. Ketchum „Microbiology”
Warunki zaliczenia
45
kolokwium
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC 3008l
Course title
Microbiology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
2
Form of the
course
completion
coloqium
Prerequisites
Course description
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Principles of work in microbiological laboratory. Methods of sterilization. Techniques for growing cultures of
microorganisms. Isolation of pure cultures of microorganisms. Growth rates – bacterial growth curve.
Morphology of the bacterial cell – simple and differential staining. Nutrition requirements – bacterial growth.
Anaerobic respiration. Realationship between different bacterial species. The influenze of phisical and chemical
factors on microorganisms.
Basic literature
46
W.J.H. Kunicki-Goldfinger “Życie bakterii”
Additional literature
P.A. Ketchum “Microbiology”
Conditions of the course acceptance/ credition
coloqium
47
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4036l
Tytuł kursu/przedmiotu
Inżynieria genetyczna.
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Grzegorz Rymarczyk, mgr inż., Agnieszka Rusek mgr inż., Elżbieta Wieczorek dr inż., Iwona Grad dr inż.,
doktoranci Zakładu Biochemii
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
3
3
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Biochemia I, Biochemia II, Biologia molekularna, Inżynieria genetyczna
Krótki opis zawartości całego kursu
Przygotowanie rekombinowanego genu i jego ekspresja w komórkach E.coli, jako przykład zastosowania
technik manipulacji DNA. Przygotowanie wektora ekspresyjnego pGEX-2T do klonowania w celu
przedstawienia postawowych technik laboratoryjnych inżynierii genetycznej.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
1. Amplifikacja fragmentu genu metodą PCR. 2. Elektroforeza analityczna produktów reakcji PCR. 3. Izolacja
DNA insertu z żelu agarozowego. 4. Ligacja insertu z wektorem ekspresyjnym. 5. transformacja komórek E.coli
produktem ligacji. 6. selekcja docelowego klonu insertu. 7. Ekspresja sklonowanego genu w E.coli. 8.
Elektroforeza SDS-PAGE jako metoda detekcji docelowego peptydu. 9. Przygotowanie komórek
kompetentnych. 10. Transformacja komórek plazmidem testowym. 11. Przygotowanie markera wagowego
DNA. 12. trawieniewektora ekspresyjnego enzymem restrykcyjnym. 13. Defosforylacja DNA wektorowego. 14.
48
Elektroforeza preparatywna DNA wektorowego.
Literatura podstawowa
Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
Prawidłowe wykonanie doświadczenia. Nabycie umiejętności zaplanowania amplifikacji i ekspresji genu w
systemie bakteryjnym. Nabycie umiejętności zaplanowania i interpretacji eksperymentów manipulacji DNA.
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4036l
Course title
Genetic engineering.
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Ożyhar Andrzej, dr hab., prof
Names, first names and degrees of the team’s members
Grzegorz Rymarczyk, M.Sc.., Agnieszka Rusek M.Sc.., Elżbieta Wieczorek PhD., Iwona Grad PhD., doctoral
students of the Division of Biochemistry
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
3
3
Form of the
course
completion
test
Prerequisites
Biochemistry I, Biochemistry II, Molecular biology, Genetic engineering.
Course description
Preparation of a recombinant procaryotic expression vector as an example of basic DNA manipulation
techniques. Preparation of a cloned gene in a recombinant plasmid vector and its expression in E.coli host cells.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
49
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
1. Preparation of competent E.coli host cells. 2. transformation of competent cells with a test pasmid. 3. DNA-
ladder preparation. 4. Restriction digestion of an expression vector. 5. Dephosphorylation of an expression
vector. 6. Preparative electrophoresis of vector DNA in agarose gel.. 7. Amplification of a desired gene fragment
using the PCR products. 8. Isolation of the insert DNA from an agarose gel. 9. Ligation of the insert into the
expression vector. 10. Transformation of E.coli cells with the ligation products. 11. selection of the desired
clone. 12. Expression of a cloned gene in E.coli host cells. 13. Detection of the target polypeptide using SDS-
PAGE analysis.
Basic literature
Sambrook, J., Russel, D.W., „Molecular cloning” CSHL Press, New York, 2001
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
Students should perform the experiment correctly and acquire the ability to plan and interpret the results of basic
DNA manipulation techniques and plan the amplification and expression of a gene in a bacterial system.
50
OPIS KURSÓW/PRZEDMIOTÓW
Kod kursu/przedmiotu
BTC 4044w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne
Imię nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Prof. dr hab. inż. Paweł Kafarski
Imiona i nazwiska oraz tytuły/ stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Tygodniowa
liczba godzin
2
Forma
zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Chemia organiczna, mikrobiologia, biochemia
Krótki opis zawartości całego kursu
Zastosowanie mikroorganizmów, enzymów i katalitycznych przeciwciał w syntezie organicznej
Wykład ( podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1
Definicje. Biotransformacje jako jeden ze sposobów unieczynniania
ksenobiotyków. Enzymy faz: pierwszej, drugiej i trzeciej biotransformacji.
2
2
Transformacje mikrobiologiczne jako narzędzie „Zielonej Chemii”. Dobór
mikroorganizmów, w tym kombinatoryjne projektowanie biokatalizatorów i
ukierunkowana ewolucja
2
3
Przykłady biokatalitycznych procesów utleniania-redukcji, manipulacja
stereoselektywnością reakcji
2
4
Reakcje hydroksylacji, transformacje mikrobiologiczne steroidów
2
5
Lipazy i mikroorganizmy lipolityczne, dobór biokatalizatorów, modelowanie
molekularne jako technika wspomagająca
2
6
Oksynitrylazy – od cyjanogenezy do syntezy asymetrycznej, procesy
chemoenzymatyczne
2
7
Biokatalityczna synteza epoksydów i dioli jako przykład transformacji
prowadzących do produktów z kilkoma centrami asymetrii
2
8
Glikotransferazy najpowszechniejszy przykład zastosowania transferaz
2
9
Biokataliza za pomocą immobilizowanych mikroorganizmów
2
10
Biokataliza w środowiskach niewodnych, micelarnych i w układach
dwufazowych
2
11
Biokataliza w mediach niekonwencjonalnych (gazy w stanie nadkrytycznym,
ciecze jonowe)
2
12
Transformacje enzymatyczne w przemysłach farmaceutycznym,
2
51
kosmetycznym i chemicznym
13
Katalityczne przeciwciała i „sztuczne enzymy” jako biokatalizatory
2
14
Ć
wiczenia , seminarium – zawartość merytoryczna
Laboratorium, projekt – zawartość merytoryczna
Literatura podstawowa
P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995
Literatura dodatkowa
K. Drauz & H. Waldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002
Warunki zaliczenia
Egzamin wspólny z egzaminem z biotechnologii (w postaci dodatkowych pytań)
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC 4044w
Course title
Biotechnology – microbial transformations
Names, first name and degree of the lecturer/supervisor
Prof. Paweł Kafarski
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in witch the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Numbers of
hours/week
2
Form of the
course
completion
test
52
Prerequisites
Organic chemistry, microbiology, biochemistry
Course description
The use of microorganisms, enzymes and catalytic antibodies in organic synthesis
Lecture
Particular lectures contents
Number
of hours
1
Definitions. Biotransformations as a mean of degradation of xenobiotics. Enzymes
of first, second and third phase of biotransformation
2
2
Microbial transformations as a tool of “Green Chemistry”. The choice of
microorganisms including combinatorial design and directed evolution
2
3
Examples of biocatalytic red-ox processes, manipulations with stereoselectivity of
reaction
2
4
Hydroxylations, microbial transformations of steroids
5
Lipases and lypolitic microorganisms, choice of biocatalysts, molecular modelling
as helper technique
6
Oxynitrilases – from cyanogenesis to asymmetric synthesis, chemoenzymatic
processes
7
Biocatalytic synthesis of epoxides and diols as an example of transformations
leading to products with multiple asymmetric centers
8
Glycotransferases, the most popular example of transferases
9
Biocatalysis by means of immobilized microorganisms
10
Biocatalysis in non-aqueous, micellar and biphasic media
11
Biocatalysis in non-conventional media (supercritical gases, ionic liquids)
12
Enzymatic transformations in pharmaceutical, cosmetic and chemical industry
13
Catalytic antibodies and artificial enzymes as biocatalysts
14
Exercises, seminar –the contents
Laboratory, project –the contents
Basic literature
P. Kafarski; B. Lejczak, Chemia bioorganiczna , PWN 1994
H. Griengl, Biocatalysis, Sprinter-Verlag Viena 2000
K. Faber, Biotransformations In Organic Chemistry, Berlin-Heidelberg 1995
Additional literature
K. Drauz & H. WAldmann Eds, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, Weinheim 2002
Conditions of the course acceptance/credition
Exam written alongside with biotechnology test
53
OPISY KURSÓW/PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC 4044w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biotechnologia – transformacje mikrobiologiczne
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Wanda Peczyńska – Czoch, dr hab.
Imiona, nazwiska oraz tytuły członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Liczba
punktów
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma
zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Chemia organiczna, biochemia, mikrobiologia
Krótki opis zawartości całego kursu
Zastosowanie drobnoustrojów i izolowanych z nich enzymów do prowadzenia reakcji biotransformacji
związków organicznych
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych godzin wykładowych
Liczba godzin
1. Metody prowadzenia reakcji transformacji mikrobiologicznych (biotransformacji)
2. Zasady doboru drobnoustrojów
3. Udział oksydoreduktaz w reakcjach biokonwersji
4. Reakcje biokonwersji katalizowane przez transferazy
5. Procesy hydrolityczne
6. Transformacje mikrobiologiczne w przemyśle farmaceutycznym
7. Kontrolowane procesy biodegradacyjne
2
2
6
2
8
6
4
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Materiał do samodzielnego opracowania
54
Literatura podstawowa
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
DESCRIPTION OF THE COURSES:
Course code
BTC 4044w
Course title
Biotechnology – microbial transformations
Supervising course lecturer
Wanda Peczyńska – Czoch , dr hab.
Othe course lecturers
Course structure
Course form
Lecture
Classes
Laboratory
Project
Seminar
Number of
credits
Number of hours
/week
2
3
Form of the
course completion
test
Prerequisites
Organic chemistry, biochemistry, microbiology
Course description
Application of whole microbial cells and isolated enzymes to biotransformation of organic compounds
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.Methods of microbial transformations (biotransformations)
2. Selection of microrganisms
3.Oxidoreductases in bioconversion reactions
4.Transferases in bioconversion processes
5.Hydrolytic processes
6.Microbial transformations in pharmaceutical industry
7.Controlled biodegradative processes
Classes, seminars - the contents
55
Laboratory, project – the contents
Material for self preparation
Core literature
Additional literature
Conditions for course credition
56
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4037w,l
Tytuł kursu/przedmiotu
Mikrobiologia przemysłowa
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Magdalena Rucka, dr
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr inż.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
3+2
Forma zaliczenia
egzamin
sprawozdania
Wymagania wstępne
Zaliczony kurs: Mikrobiologia ogólna
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs ma wprowadzić słuchaczy w zagadnienia związane z przemysłowymi metodami fermentacyjnymi.
Poruszane będą problemy przygotowywania podłóż, kultur starterowych, izolacji i ulepszania szczepów.
Omawiane będą typy hodowli, możliwości sterowania metabolizmem drobnoustrojów oraz wykorzystanie
komórek immobilizowanych.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.Mikroorganizmy o znaczeniu przemysłowym
2.Selekcja mikroorganizmów, dobór kryteriów
3.Selekcja mutantów indukowanych syntezujących metabolity pierwotne, wtórne, enzymy o
znaczeniu przemysłowym.
4.Ulepszanie mikroorganizmów – metody
5.Przygotowanie kultur starterowych dla potrzeb przemysłowych
6.Metody przechowywania szczepów produkcyjnych
7.Podłoża przemysłowe
8.Typy hodowli drobnoustrojów, wykorzystanie przemysłowe, zalety i wady
9.Sterowanie metabolizmem. Indukcja, metody obejścia sprzężenia zwrotnego
2
2
2
2
2
2
2
4
2
57
10.Fermentacja beztlenowa – wykorzystanie przemysłowe
11.Biosynteza związków biologicznie czynnych, szlaki metaboliczne, przykłady
12.Hodowla mikroorganizmów zrekombinowanych
13. Nośniki i metody unieruchamiania komórek mikroorganizmów
14. Przykłady zastosowań przemysłowych komórek unieruchomionych
2
2
2
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Izolacja drobnoustrojów o pożądanych właściwościach.
Przechowywanie i zabezpieczanie szczepów.
Typy hodowli.
Produkcja substancji biologicznie czynnych.
Ulepszanie szczepów
Immobilizacja komórek.
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
P. Stanbury , A.Whiteker :Principles of Fermentation Technology, Pergamon Press
Z.Libudzisz, K. Kowal: Mikrobiologia Techniczna, Politechnika Łódzka,2000
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
Zdanie pozytywnie egzaminu
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4037w
Course title
Industrial Microbiology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Magdalena Rucka, dr
58
Names, first names and degrees of the team’s members
Irena Maliszewska dr, Magdalena Rucka dr, Ewa Zboińska dr eng.,
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours /
week
2
2
3+2
Form of the course
completion
Exam
reports
Prerequisites
Microbiology
Course description
The course shall introduce listeners to industrial fermentation processes, isolation, preservation and
improvement of industrial important microorganisms. The development of inocula, types of cultures, control of
microbial metabolism are also discussed.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. Microorganisms of industrial importance
2. Selection of microorganisms, criteria
3. Selection of induced mutants synthesizing primary, secondary metabolites and enzymes of
industrial importance
4. Improvement of industrially important microorganisms
5. Development of inocula for industrial purposes
6. Preservation of microorganisms
7. Media for industrial fermentation
8, Types of cultures, industrial application
9. Metabolism control
10.Anaerobic fermentation – industrial application
11.Biosynthesis of biologically active compounds
12.Culture of recombinant microorganisms
13.Carriers and methods of cell immobilization
14.Industrial application of immobilized cells
2
2
2
2
2
2
2
4
2
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Selection of microorganisms of desired characteristics
Preservation of microorganisms
59
Types of culture
Production of biologically active substances
Improvement of strains
Immobilization of cells
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
Exam
60
OPISY KURSU/ PRZEDMIOTU
Kod kursu/przedmiotu
BTC3011w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biofizyka
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Marek Langner dr hab.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
ć
wiczenia
laboratorium
Projekt
seminarium
Punkty
Tygodniowa liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia
Egzamin
Wymagania wstępne
Fizyka, analiza matematyczna, chemia fizyczna, biochemia
Krótki opis zawartości całego kursu
Celem wykładu jest przedstawienie metodologii i przedmiotu biofizyki. Prezentowany materiał został dobrany w
taki sposób aby student zapoznał się z kompleksowym podejściem do nauk biologicznych. Omawiane
zagadnienia łączą w sobie szereg dyscyplin naukowych, w tym fizykę, biochemię, biologię, chemii fizyczną
wraz z wybranymi zastosowaniami formalizmu matematycznego. Tematem wiodącym wykładu jest transmisja
sygnału nerwowego. Przykład ten pozwala przedstawić złożoność zjawisk na różnych poziomach organizacji
materii. Poczynając od oddziaływań na poziomie molekularnym, poprzez formowanie się struktur
supramolekularnych a kończąc na funkcjonowaniu organelli oraz całych komórek. W trakcie prezentowania tych
zagadnień omawiane są wybrane zagadnienia z termodynamiki, transportu masy, bioenergetyki oraz ich
znaczenie dla funkcjonowania komórki. Po wysłuchaniu wykładu student powinien posiadać zarówno wiedzę
szczegółową z zakresu prezentowanych zagadnień oraz ogólne rozeznanie w metodologii współczesnych nauk
biologicznych.
Wykład
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
L.godz.
1.
Wprowadzenie – poziomy organizacji materii ożywionej – skale czasowe, energetyczne i
przestrzenne.
2.
Przedmiot i podstawowe pojęcia termodynamiki.
3.
Energia swobodna – stany konformacyjne makromolekuł, enzym oraz znaczenie energii
swobodnej w procesach metabolicznych.
4.
Reakcje sprzężone oraz znaczenie nośników energii.
5.
Woda – właściwości, napięcie powierzchniowe, wiązanie wodorowe i efekt hydrofobowy.
6.
Elektrostatyka w układach wielofazowych.
7.
Oddziaływania van der Waalsa – teoria oraz znaczenie w układach biologicznych.
8.
Stałe wiązania oraz adsorpcja na granicy faz.
9.
Budowa błony biologicznej oraz transport bierny.
10.
Transport ułatwiony.
11.
Elektrostatyka błon biologicznych – potencjał błonowy, potencjał powierzchniowy i dipolowy.
12.
Transport aktywny oraz wybrane przykłady kanałów jonowych.
13.
Transport sprzężony – symport, antyport oraz pojęcie pompy głównej.
14.
Impuls nerwowy – potencjał spoczynkowy, aktywacja oraz transmisja sygnału nerwowego.
15.
Transformacja energii w układach biologicznych na przykładzie F
0
F
1
-ATPazy.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
61
2
2
2
Literatura podstawowa i dodatkowa
Klasyczne podręczniki z biochemii i chemii fizycznej. Artykuły naukowe i wybrane strony internetowe.
Materiały znajdujące się na stronie internetowej wykładu.
Warunki zaliczenia
Egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3011w
Course title
Biophysics
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
dr hab. Marek Langner
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Number of points
Number of hours / week
2
3
Form of the course completion
Exam
Prerequisites
Physics, biochemistry, physical chemistry, calculus.
Course description
The main aim of the lecture is to present the subject and methodology of biophysics. Presented material was
selected in such a way that student can acquire knowledge on the modern approaches to biological sciences.
Discussed problems are designed to show the synthesis of various sciences, including physics, biochemistry,
biology, physical chemistry along with selected application of mathematical formalisms. Leading theme of the
lecture is the transmission of nervous signal. This example allows to present the complexity of biological
processes occurring simultaneously on various organizational levels. Ranging from interactions between
molecules and macromolecules and supramolecular aggregates formation to the functioning of organelles and
whole cells. In the course of this presentation selected topic on thermodynamics, mass transport, bioenergetics as
well as their role for cell functioning are discuss. After completion of the lecture student should acquire the detail
knowledge on presented subject and general overview of methodology employed in studies on biological
material.
Lectures
Particular lectures contents
No. of hours
1. Introduction – the organization of biological material – time, distance and energy scale.
2. Basic concepts of thermodynamics
3. Free energy – conformational states of macromolecules, enzymes and meaning of free energy
2
2
62
in metabolic processes.
4. Coupled reactions and the role of energy caring molecules.
5. Water – properties, surface tension, hydrogen bonds and hydrophobic effect.
6. Electrostatics in multiphase systems.
7. van der Waals interactions – theory and their role in biological systems.
8. Biding constant and adsorption on interfaces.
9. Structure of the biological membranes and passive transport.
10. Mediated transport.
11. Electrostatics of membranes – membrane, surface and dipole potentials.
12. Active transport and selected examples of ionic channels.
13. Coupled transport – symport, antiport and the concept of master pump.
14. Nerve signal – resting potential, activation and propagation of neuronal impulse.
15. Energy conversion in biological systems - F
0
F
1
-ATPze example.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Core and additional literature
Textbooks in Biochemistry and Physical Chemistry, scientific articles and selected web seats. Materials from the
lecture web-sit.
Conditions for course credition
Exam
63
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4033l
Tytuł kursu/przedmiotu
Enzymologia
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Piotr Dobryszycki, adiunkt/dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Elżbieta Wieczorek, adiunkt/dr inż., Rusek Agnieszka, asystent/mgr inż., doktoranci Zakładu Biochemii I-4
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
3
3
Forma zaliczenia
cząstkowe
kolokwia
Wymagania wstępne
Rozpoczęcie kursu Biochemii I
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs obejmuje naukę metod otrzymywania, oczyszczania i wstępnego opisu enzymów. Studenci poznają m.in.
spektrofotometryczne metody wyznaczania stężenia enzymów, różne sposoby wyrażania aktywności
enzymatycznej, oznaczanie N-końcowego aminokwasu, badanie stabilności białek w oparciu o krzywe
denaturacyjne. Ponadto poznają wykorzystanie widm różnicowych i spektroskopii fluorescencyjnej w badaniach
enzymów.
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Kurs obejmuje: 1. Oznaczanie aktywności enzymatycznej króliczej aldolazy mięśniowej – aktywność
specyficzna, aktywność aldolazowa, aktywność całkowita. 2. Preparacja aldolazy z mięśni królika. 3.
Krystalizacja aldolazy, określenie wydajności preparacji 4. Trawienie aldolazy karboksypeptydazą A. 5.
Dansylowanie peptydu. 6. Chromatograficzne oznaczanie N-końcowej reszty peptydu. 7. Oznaczanie
fosforanów – metodą Amesa, Dubina. 8. Wyznaczanie stabilności enzymów w oparciu o zmiany przebiegu
krzywych denaturacyjnych 9. Wyznaczanie wydajności kwantowej fluoroforów – zastosowania spektroskopii
fluorescencyjnej w biochemii. 10. Metoda Bradford oznaczania białek,
64
Literatura podstawowa
1.
Instrukcje do ćwiczeń.
2.
Oryginalne publikacje (dostarczone wraz z instrukcjami)
Literatura uzupełniająca
Podręcznik L. Stryera „Biochemia”
Warunki zaliczenia
Zaliczenie wszystkich kolokwiów cząstkowych i wszystkich sprawozdań z poszczególnych ćwiczeń.
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4033l
Course title
Enzymology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Piotr Dobryszycki, adjunct/dr
Names, first names and degrees of the team’s members
Elżbieta Wieczorek, adjunct/dr., Rusek Agnieszka, assistent/MS, PhD students of the Dept. of Biochemistry
Institute of Organic Chemistry Biochemistry and Biotechnology
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
3
3
Form of the
course
completion
colloquia
Prerequisites
Beginning of the Biochemistry I course
Course description
Course consists of the methods of isolation, purification and indroductory description of the enzymes such as
spectrophotometric methods of the determination of enzyme concentration, different ways of enzymatic activity
presentation, determination of peptide N-terminal residue, protein digestion, obtaining of difference spectra and
their application in the investigation of the enzyme stability, obtaining of the unfolding curves and their analysis
and the biochemical applications of the fluorescence spectroscopy.
Exercises, seminars – the contents
65
Laboratory, project – the contents
Course consists of: 1. Determination of the enzymatic activity of rabbit muscle aldolase. – specific activity,
aldolase activity, total activity. 2. Preparation of aldolase from rabbit muscle. 3. Aldolase crystallization,
calculation of the preparation yield. 4. Aldolase digestion with carboxypeptidase A 5. Peptide N-terminus
labeling with dansyl chloride. 6. Chromatographic identification of N-terminal residue. 7. Method of Ames and
Dubin – organic phosphor determination. 8. Determination of protein stability basing on the changes of
denaturation curves. 9. Determination of protein fluorophores quantum yield – biochemical applications of
fluorescence spectroscopy. 10. Bradford method – determination of protein concentration.
Basic literature
1.
The inctructions to excercises.
2.
Original papers .
Additional literature
L. Stryer „Biochemistry” textbook.
Conditions of the course acceptance/ credition
Passing all the colloquia and preparation of all the excercises’ reports.
66
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BLC5005w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia molekularna
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
3
5
Forma zaliczenia
Wymagania wstępne
Zaliczenie kursu Biochemii
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.
2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.
3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.
4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.
5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.
6.
Mechanizmy naprawy DNA.
7.
Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i
eukariontów.
8.
Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.
9.
Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
67
10.
Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.
11.
Kontrola ekspresji genów u prokariontów.
12.
Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.
13.
Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.
14.
Terapia genowa.
2
2
2
2
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna2
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Stryer „Biochemia”, PWN 2002
Bruce Alberts
,
Dennis Bray
,
Julian Lewis
,
Martin Raff
,
Keith Roberts
,
James D. Watson
"Molecular Biology of
the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002
Literatura uzupełniająca
Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002
Warunki zaliczenia
Egzamin
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BLC5005w
Course title
Molecular biology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Andrzej Ożyhar dr hab., prof.
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Punkty
68
Number of hours
/ week
3
5
Form of the
course
completion
examination
Prerequisites
Course description
Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1. DNA and RNA – chemical composition and structure
2.
Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.
3.
DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.
4.
Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.
5.
DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.
6.
Mechanisms of DNA repair.
7.
Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.
8.
Prokaryotic DNA replication.
9.
Eukaryotic DNA replication.
10.
Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.
11.
Control of prokaryotic gene expression.
12.
Control of gene expression in eukaryotic cells
13.
Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational
modifications.
14.
Gene therapy.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
aboratory, project – the contents
69
Basic literature
Stryer „Biochemia”, PWN 2002
Bruce Alberts
,
Dennis Bray
, Julian Lewis,
Martin Raff
,
Keith Roberts
,
James D. Watson
"Molecular Biology of
the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002
Additional literature
Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002
Conditions of the course acceptance/ credition
Passing an examination.
70
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BLC5005s
Tytuł kursu/przedmiotu
Biologia molekularna
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
2
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Kurs towarzyszący Biologii Molekularnej (BLC5005w)
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstaw biologii molekularnej, zawierający informacje związane z budową i funkcją kwasów
nukleinowych, metodami badań, genów, a także różnicami biologicznymi między organizmami
prokariotycznymi i eukariotycznymi. Omawiane sa mechanizmy replikcji DNA, transkrypcji, translacji i
regulacji ekspresji genów.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
1. Skład chemiczny i struktura DNA i RNA.
2. Poznawanie genów – podstawowe metody badania kwasów nukleinowych.
3. Organizacja DNA w komórce eukariotycznej i prokariotycznej.
4. Mechanizmy rearanżacji genów, ruchome elementy genetyczne.
5. Mutageneza DNA – mutacje spontaniczne i indukowane.
15.
Mechanizmy naprawy DNA.
16.
Organizacja i znaczenie pozachromosomalnego DNA u prokariontów i
eukariontów.
71
17.
Mechanizm replikacji DNA u prokariontów.
18.
Mechanizm replikacji DNA u eukariontów.
19.
Zróżnicowanie budowy i funkcji RNA. Synteza i splicing RNA.
20.
Kontrola ekspresji genów u prokariontów.
21.
Kontrola eskpersji genów w komórkach eukariotycznych.
22.
Translacja – przebieg, regulacja i modyfikacje posttranslacyjne.
23.
Terapia genowa.
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Stryer „Biochemia”, PWN 2002
Bruce Alberts
,
Dennis Bray
,
Julian Lewis
,
Martin Raff
,
Keith Roberts
,
James D. Watson
"Molecular Biology of
the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002
Literatura uzupełniająca
Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002
Warunki zaliczenia
kolokwium zaliczeniowe
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BLC5005s
Course title
Molecular biology
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Ożyhar Andrzej, dr hab., prof
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
72
Number of hours
/ week
2
2
Form of the
course
completion
colloqium
Prerequisites
Course description
Course contains informations concerning nucleic acids structure and function, methods of DNA exploring, as
well as with differences between Procaryota and Eucaryota, mechanisms of DNA replication,
transcription,,translation and gene expression regulation.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
Exercises, seminars – the contents
1. DNA and RNA – chemical composition and structure
15.
Exploring genes – the basic tools of nucleic acids exploration.
16.
DNA organization in prokaryotic and eukaryotic cells.
17.
Mechanisms of genes recombination, mobile genetic elements.
18.
DNA mutagenesis – spontanous and induced mutations.
19.
Mechanisms of DNA repair.
20.
Organization and role of non-chrosomal prokaryotic and eukaryotic DNA.
21.
Prokaryotic DNA replication.
22.
Eukaryotic DNA replication.
23.
Different forms and function of RNA. RNA synthesis and splicing.
24.
Control of prokaryotic gene expression.
25.
Control of gene expression in eukaryotic cells
26.
Translation – course of protein synthesis, regulation and posttranslational modifications.
27.
Gene therapy.
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Stryer „Biochemistry”, W.H. Freeman ed. , 1997
Bruce Alberts
,
Dennis Bray
,
Julian Lewis
,
Martin Raff
,
Keith Roberts
,
James D. Watson
"Molecular Biology of
73
the Cell” Fourth Edition, Garland Sci. Publishing, 2002
Additional literature
Berg, Tymoczko, Stryer „Biochemistry” W.H.Freeman 2002
Conditions of the course acceptance/ credition
Colloqium
74
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3009w
Tytuł kursu/przedmiotu
Biochemia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Piotr Dobryszycki dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia kolokwium
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstaw biochemii obejmujący zagadnienia związane z budową i funkcją białek i kwasów nukleinowych,
podstawy enzymologii, metabolizm, funkcjonowanie błon biologicznych, przekazywanie sygnałów
biologicznych, podstawowe pojęcia immunologii.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.Struktura i funkcja białek.
2. Poznawanie białek.
3.DNA i RNA : cząsteczki dziedziczności.
4.Hemoglobina: przykład białka allosterycznego.
5.Enzymy: podstawowe pojęcia i kinetyka.
6.Strategie katalityczne.
7.Strategie regulacyjne.
8.Budowa i dynamika błony.
.9.Kanały i pompy błonowe
10.Przeciwciała i receptory limfocytów T.
11.Motory molekularne.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
75
12.Fałdowanie się i projektowanie białek.
13.Metabolizm: podstawowe pojęcia i organizacja.
14.Węglowodany.
2
2
2
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)
Literatura uzupełniająca
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Warunki zaliczenia
Egzamin testowy łącznie z Biochemia II
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3009w
Course title
Biochemistry I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Piotr Dobryszycki dr
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
76
Prerequisites
Course description
Course of the basics of biochemistry. Course consists of the problems of protein and nucleic acids structure and
function, enzymology, intoduction to metabolism, biological membranes, biological signals transduction, basics
of immunology.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.Protein structure and function.
2. Exploring proteins.
3.DNA and RNA : molecules of heredity.
4.Hemoglobin : example of allosteric protein.
5.Enzymes: basic concepts and kinetics.
6.Catalytic strategies.
7.Regulatory strategies.
8.Membranes structure and dynamics.
.9.Membrane channels and pumps.
10.Antibodies and lymphocyte T receptors.
11.Molecular motors.
12.Protein folding and design.
13.Metabolism: basic concepts and organization.
14.Carbohydrates.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)
Additional literature
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Conditions of the course acceptance/ credition
Test examination with Biochemistry II
77
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC4030w
Tytuł kursu/przedmiotu
Genetyka
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Andrzej Ożyhar dr hab. inż., prof.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
2
3
Forma zaliczenia Egzamin
Wymagania wstępne
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstaw genetyki z odniesieniami do problemów medycznych. Opis genów i ich funkcji, analiza genomu,
regulacja ekspresji genów, genetyka populacyjna,
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
1.
Genetyka Mendlowska.
2.
Dziedziczenie cech sprzężonych i uwarunkowanych przez płeć.
3.
Dziedziczenie cytoplazmatyczne.
4.
Ź
ródła zmienności genetycznej.
5.
Mapowanie genów.
6.
Analiza genomów.
7.
Choroby metaboliczne o podłożu genetycznym.
8.
Genetyka nowotworów.
9.
Genetyka populacyjna.
10.
Genetyka rozwoju.
3
3
3
3
3
3
3
3
78
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002
Korf B.R. “ Genetyka człowieka” PWN 2003
Literatura uzupełniająca
Warunki zaliczenia
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC4030w
Course title
Genetics
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Ożyhar Andrzej, dr hab., prof
Names, first names and degrees of the team’s members
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
2
3
Form of the
course
completion
Examination
Prerequisites
79
Course description
Course of genetics principles with medical problems approach. Description of the genes, their function, genome
analysis, gene expression regulation, genetics of population.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
1.
Mendelian genetics.
2.
Sex-linked genetic transmission.
3.
Cytoplasmatic inheritance.
4.
Origins of genetic changes.
5.
Gene mapping.
6.
Genom analysis.
7.
Inborn errors of metabolism.
8.
Genetics of cancer.
9.
Population genetics.
10.
Developmental genetics.
3
3
3
3
3
3
3
3
Exercises, seminars – the contents
Laboratory, project – the contents
Basic literature
Russel P.J. „iGenetics” Benjamin Cummings ed. 2002
Korf B.R. “ Human Genetics. A Problem Based Approach”
Additional literature
Conditions of the course acceptance/ credition
Examination
80
OPISY KURSÓW/ PRZEDMIOTÓW:
Kod kursu/przedmiotu
BTC3009l
Tytuł kursu/przedmiotu
Biochemia I
Imię, nazwisko i tytuł/stopień prowadzącego
Piotr Dobryszycki dr inż.
Imiona, nazwiska oraz tytuły/stopnie członków zespołu dydaktycznego
Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doktoranci Zakładu Biochemii i Laboratorium
Biochemii Medycznej P.Wr.
Forma zaliczenia kursu
Forma kursu
Wykład
Ć
wiczenia
Laboratorium
Projekt
Seminarium
Punkty
Tygodniowa
liczba godzin
4
4
Forma zaliczenia
kolokwium
Wymagania wstępne
Kurs równoległy z wykładem Biochemia I
Krótki opis zawartości całego kursu
Kurs podstawowych metod biochemii białek i kwasów nukleinowych.
Wykład (podać z dokładnością do 2 godzin)
Zawartość tematyczna poszczególnych wykładów
Liczba godzin
Ć
wiczenia, seminarium - zawartość tematyczna
Laboratorium, projekt - zawartość tematyczna
Literatura podstawowa
Lubert Stryer Biochemia (PWN 1997, 2002)
Instrukcje do ćwiczeń
81
Literatura uzupełniająca
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Warunki zaliczenia
Kolokwium
DESCRIPTION OF THE COURSES
Course code
BTC3009l
Course title
Biochemistry I
Name, first name and degree of the lecturer/ supervisor
Piotr Dobryszycki dr
Names, first names and degrees of the team’s members
Dr inż. Elżbieta Wieczorek, mgr inż. Agnieszka Rusek, doctoral students of the Division of Biochemistry and
Laboratory of Medical Biochemistry Inst. Of Org. Chem., Biochemistry and Biotechnology.
Form in which the courses should be completed
Course form
Lecture
Exercises
Laboratory
Project
Seminar
Number of
points
Number of hours
/ week
4
4
Form of the
course
completion
colloqium
Prerequisites
Course parallel to Biochemistry I - lecture
Course description
Course of the basic methods of biochemistry of proteins and nucleic acids.
Lecture
Particular lectures contents
Number of hours
Exercises, seminars – the contents
82
Laboratory, project – the contents
Excersises : 1. Enzymatic kinetics, 2. Protein’s thiol groups and disulphide bridges. 3. Effect of temperature and
pH on enzymatic activity. 4. Gel filtration. 5. Enzymatic hydrolysis. 6. Amphoteric character of amino acids and
proteins. 7.DNA isolation from calf thymus. 8.Analysis of DNA melting curve. 9. Analysis of mechanismis of
the enzymatic reaction. 10. Protein electrophoresis.
Basic literature
Lubert Stryer’s Biochemistry (polsh ed. 2002)
Instructions for excercises.
Additional literature
Berg J.M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry (fifth ed.) Freeman and Co. 2001
Conditions of the course acceptance/ credition
test