Aminokwasy
Aminokwasy alifatyczne
Aminokwasy zawierające grupę hydroksylową lub siarkę w
podstawniku
Aminokwasy cykliczne
Aminokwasy aromatyczne
Aminokwasy zasadowe
Aminokwasy kwasowe i ich amidy
Selenocysteina
Selenocysteina jest stosunkowo rzadko występującym aminokwasem naturalnym, który jest
wbudowywany do niektórych białek (białka selenowe) przy wykorzystaniu
kodonu UGA
.
Zazwyczaj kodon UGA pełni funkcję
kodonu stop
, lecz w przypadku syntezy białek, które
wykorzystują kodon UGA do wbudowywania selenocysteiny, w pobliżu kodonu UGA
drugorzędowa struktura
mRNA
jest bardziej zlożona co powoduje, że rybosom nie
rozpoznaje kodonu UGA jako kodonu stop, a to z kolei umożliwia dostarczenie tego
aminokwasu przez
selenocysteinylo-tRNA
do budowanego w tym miejscu łańcucha
polipeptydowego.
Aminokwasy egzogenne i
endogenne
Aminokwasy egzogenne
są to aminokwasy, które nie są
syntezowane w organizmie ludzkim, a ich obecność w białkach
spożywanych decyduje o wartości odżywczej.
Histydyna
jest
niezbędna dla dzieci do 12 roku życia, ale nie jest niezbędna dla
dorosłych. Aminokwasy
endogenne
są to aminokwasy, które są
syntezowane w organizmie ludzkim.
Aminokwasy egzogenne
Aminokwasy endogenne
Lizyna
Metionina
Leucyna
Izoleucyna
Histydyna
Fenyloalanina
Treonina
Tryptofan
Walina
Alanina
Glicyna
Asparagina
Asparaginian
Glutamina
Glutaminian
Seryna
Cysteina
Prolina
Arginina
Tyrozyna
WŁAŚCIWOŚCI FIZYCZNE AMINOKWASÓW
Rozpuszczalność
Z kilkoma wyjątkami aminokwasy są dobrze rozpuszczalne w wodzie, amoniaku i
innych rozpuszczalnikach polarnych, ale są źle rozpuszczalne w niepolarnych i mniej
polarnych rozpuszczalnikach takich jak: etanol, metanol, aceton itp. Spowodowane to jest
tym, że w obojętnych roztworze wodnym występują w postaci jonów obojnaczych.
Punkt izoelektryczny
(pI)
Punkt izoelektryczny (pI) jest to takie
pH
środowiska, przy którym cząsteczka aminokwasu w
danych warunkach jest
obojętna
, bez względu na to czy jednakowa ilość ładunków dodatnich
i ujemnych w cząsteczce wynika z dysocjacji grup polarnych, czy obecności związanych
jonów. W punkcie izoelektrycznym cząsteczka nie ma zdolności wędrowania w polu
elektrycznym (np. podczas elektroforezy).
W roztworze o pH większym od punktu
izoelektrycznego cząsteczka występuje w formie anionu
(posiada ładunek ujemny)
, a poniżej
punktu izoelektrycznego w formie kationu
(posiada ładunek dodatni)
.
W punkcie
izoelektrycznym aminokwas tworzy sól wewnętrzną tzw.
jon obojnaczy
(sumaryczny
ładunek równy 0), wtedy cząsteczka jest najsłabiej rozpuszczalna. Wykorzystuje się to do
wytrącenia aminokwasów z roztworu.
pH 1 pI (pH 6) pH11
całkowity ładunek:
+
1 całkowity ładunek: 0 całkowity ładunek:
-
1
WŁAŚCIWOŚCI CHEMICZNE AMINOKWASÓW
Tworzenie wiązań peptydowych
Najważniejszą reakcją aminokwasów jest tworzenie grupy amidowej -NHCO-
określanej jako wiązanie peptydowe (amidowe). Wiązanie peptydowe tworzy się przez
wydzielenie jednej cząsteczki wody z grupy α-aminowej jednego aminokwasu i α-
karboksylowej grupy drugiego aminokwasu.
Alanina (Ala) Seryna (Ser) Alanyloseryna (Ala-Ser)
Struktura wiązania peptydowego
Przykładowa struktura heptapeptydu
Struktura drugorzędowa białek:
α
-helisa i struktura
β
(pofałdowanej kartki)