Genom - określa sumę wszystkich kodujących i niekodujących sekwencji DNA zawartych w haploidalnej liczbie chromosomów.
Genom człowieka tworzą:
• genom jądrowy składa się z 3 200 000 000 nukleotydów i jest podzielony na części - chromosomy ( 22 autosomy i 2 chromosomy płci X i Y. Ludzki genom zawiera 20-25 tys. genów.
• genom mitochondrialny - kolista cząsteczka DNA o długości 16569 nukleotydów. Zawiera 37 genów.
Każda z około 10n, gdzie n=13 komórek ma swoją własną kopię genomu ( z wyj. dojrzałych erytrocytów). Większość komórek jest diploidalna 2n ( somatyczne ), czyli ma po dwie kopie każdego autosomu + dwa chromosomy płci kobiety XX, mężczyzny XY, łącznie 46 chromosomów. Gamety są haploidalne (n), 23 chromosomy.
Genom mitochondrialny
- Małe ( 16,5 kb ) koliste DNA.
- Geny kodują białka oraz rRNA, tRNA ( 37 )
- Mitochondria mają własne rybosomy przypominające rybosomy bakterii.
- 1 gen/0,45kb
- Niewiele powtórzeń
- Brak intronów
- 93% to część kodująca
- Dziedziczenie tylko po matce.
Gen – podstawowa jednostka genetyczna.
Geny leżą w chromosomach. Jest ich około 20-25 tys. Nierównomiernie są rozłożone np. 17 i 19 chromosom zawiera bardzo dużo genów a 18 jest prawie pusty.
Każdy osobnik jest unikatowy o właściwym tylko jemu genotypie.
23 pary chromosomów 223 = 8 388 608 kombinacji czyli około 8 mln. kombinacji dla k.jajowej x 8 mln. kombinacji dla plemnika = 64 x 10 12.
Genotyp – jest to sparowany układ alleli ( często myli się to z genomem, czyli składem genetycznym danego organizmu ). Można go wyrazić symbolicznie za pomocą znaczeń aa, AA lub Aa, gdzie aa i AA oznaczają homozygotę pod względem tego genu, a Aa oznacza heterozygotę.
Locus – miejsce zajmowane przez gen w chromosomie.
Allel – alternatywna forma genu w danym locus.
Chromosomy człowieka ( z wyjątkiem X i Y u mężczyzn ) występują w parach ( są homologiczne ), a więc każda osoba ma dwa allele w każdym locus
Dziedziczenie
Polega na wiernym przekazywaniu genów będących odcinakami DNA o określonej kolejności nukleotydów, która wyznacza swoisty skład aminokwasów w białku.
Swoiste białka decydują o wykształceniu wszystkich cech organizmu.
Dziedziczenie – przekazywanie informacji genetycznej z pokolenia na pokolenie.
Prawa dziedziczenia wynikają bezpośrednio z zachowania chromosomów wyst. w jądrze komórkowym podczas mitozy, mejozy i zapłodnienia.
Odkrył je Grzegorz Mendel ( 1866r. )
I. Prawo mówi o czystości gamet.
II. Mówi o niezależnej segregacji genów.
Rodzaje ( wzorce dziedziczenia )
Dziedziczenie autosomalne dominujące i dziedziczenie autosomalne recesywne.
Rodzice P: AA, aa
Gamety: A x a
Pokolenie: F1 , Aa
Gamety: A Aa a , x A Aa a
g | A | a |
---|---|---|
A | AA | Aa |
a | Aa | aa |
Pokolenie: F2
Dziedziczenie autosomalne dominujące.
Genotyp | Fenotyp |
---|---|
AA | Osoba chora, najczęściej genotyp letalny |
Aa | Osoba chora |
aa | Osoba zdrowa |
Dziedziczenie autosomalne recesywne
Genotyp Fenotyp
AA Osoba zdrowa
Aa Osoba zdrowa, nosiciel
Aa Chora
W dziedziczeniu autosomalnym, dominującym wystarczy obecność jednego allelu ( A ) aby ujawniła się dana cecha w fenotypie ( AA, Aa ).
Dziedziczenie autosomalne recesywne – tak uwarunkowana cecha ujawnia się tylko u homozygot ( aa ), konieczna jest zatem obecność dwóch odpowiednich alleli.
Lp. | Genotypy rodziców | Proporcje genotypów w potomstwie | ||
---|---|---|---|---|
AA | Aa | aa | ||
1 | AA x AA | 1 | 0 | 0 |
2 | AA x Aa | 1 / 2 | 1 / 2 | 0 |
3 | Aa x Aa | 1 / 4 | 1 / 2 | 1 / 4 |
4 | AA x aa | 0 | 1 | 0 |
5 | Aa x aa | 0 | 1 / 2 | 1 / 2 |
6 | aa x aa | 0 | 0 | 1 |
Allele wielokrotne w populacji może występować więcej alleli jednego genu przykład grupa krwi w układzie ABO ( kodominacja A i B )
Fenotyp Genotyp
A IAIA lub IAi
B IB IB lub IB i
AB IA IB
0 i i
p. Ai x Bi
Gamety A i B i
A | I | |
---|---|---|
B | AB | Bi |
i | Ai | ii |
Dziedziczenie sprzężone z płcią.
Płeć żeńska takie same prawa jak w dziedziczeniu autosomalnym.
Płeć męska wystarczy 1 allel dla ujawnienia się cechy recesywnej.
Dziedziczenie sprzężone z chromosomem X dominujące.
Genotyp Fenotyp
Kobiety:
XA XA Chora, najczęściej genotyp letalny
XA Xa Chora
Xa Xa Zdrowa
Mężczyźni:
XA Y Chory, często cecha letalna
Xa Y Zdrowy
Dziedziczenie sprzężone z chromosomem X recesywne.
Genotyp Fenotyp
Kobiety:
XA XA Zdrowa
XA Xa Zdrowa, nosicielka
Xa Xa Chora
Mężczyźni:
XA Y Zdrowy
Xa Y Chory
Dziedziczenie wielogenowe
Zwiększenie liczby genów zwiększa liczbę fenotypów ( zwiększa się liczba kombinacji )
Dziedziczenie barwy skóry ( dwie pary genów 2n, gdy n=2. 4 kombinacje, 2n, n =3 daje 8 kombinacji ).
P: AaBb AaBb
Mulaci
Gamety: AB Ab aB ab AB Ab aB ab
Potomstwo: AABB fenotypowo murzyn ( 1 z 4 dom. )
(2) AaBB i AABb (2) ciemni ( 4 z 3 dom.)
(4) AaBb, (1) aaBB mulaci ( 6 z 2 dom. )
(2) Aabb, (2) aaBb jasny ( 4 z 1 dom. )
(1) aabb fenotypowo biały bez żadnego dominującego
Dziedziczenie wieloczynnikowe
Cechy uwarunkowane wieloma genami ( poligeniczne ) o wpływie addytywnym i czynnikami środowiskowymi.
Dziedziczenie cytoplazmatyczne.
Choroby mitochondrialne.
- Powstają przy występowaniu mutacji w genach mitochondrialnych kodujących białka łańcucha oddechowego.
- Objawy chorobowe występują gdy mutacja występuje w wystarczająco dużej liczbie mitochondriów ( efekt progowy )
- Najcięższe objawy powstają w obrębie układu nerwowego, gdyż komórki tego układu są bardzo uzależnione od dostaw energii.
* Choroba Lebera ( wrodzona neuropatia wzrokowa )
- Wczesna utrata wzroku.
- Objawy podobne do stwardnienia rozsianego.
* Zespół Leigha.
- Napady padaczkowe.
- Zaburzenia świadomości.
- Demencja.
- Zaburzenia oddychania.
* NARP.
- Neuropatia.
- Ataksja.
- Barwnikowe zwyrodnienie siatkówki.
- Opadanie powiek
Czynniki mogące skomplikować schematy dziedziczenia:
Nowa mutacja ( często w chorobach dziedziczonych w sposób autosomalny dominujący np. Achondroplazja ).
Mozaicyzm linii zarodkowych – wszystkie lub część komórek rozrodczych rodzica ulega mutacji, która jednocześnie nie występuje w komórkach somatycznych. Zwiększa to ryzyko ponownego wystąpienia choroby u kolejnych potomków ‘ mozaikowatego rodzica ‘ np. nerwiakowłókniakowatość lub I. dystrofia Duchenne’a.
Zmniejszona penetracja – osoba mająca genotyp danej choroby może nie wykazywać fenotypu tej choroby np. w nerwiakowłókniakowatości – ch. Recklinghausena.
Zmienna ekspresja – rozmiar ekspresji fenotypu choroby, może być spowodowana zdarzeniami środowiskowymi np. nerwiakowłókniakowatości - ch. Recklinghausena.
Plejotropizm – geny wpływające na wiele cech, powszechnie spotykana cecha genów człowieka np. zespół Marfana.
Piętnowanie genomowe.
Zjawisko braku wyrażania się pewnych genów ( nie jest produkowane białko kodowane przez ten gen ) choć są one obecne w genomie.
Napiętnowane geny są unieczynnione ( zmiany w strukturze chromatyny ). Piętnowanie genów zaczyna się już w czasie rozwoju komórek rozrodczych.
Doprowadza do pewnej asymetrii genetycznej pomiędzy matczyną a ojcowską częścią genomu. Wyjaśnia dlaczego czasami ujawnia się fenotypowo cecha jednego z rodziców.
Inprinting genowy – wdrukowanie ( w naturę ) inne odmiany choroby jeśli zdeformowany chromosom pochodzi od ojca lub matki.
Klasyczną wadą jest wypadnięcie – delecja kawałka chromosomu.
Ekspresja – manifestowanie się cechy fenotypu.
d. kobiety – zespół Angelmana – głębokie upośledzenie umysłowe, niezgrabny, nieskoordynowany ruch, wybuchy śmiechu.
d. mężczyzny – zespół Prader-Williego – wybuchy złości na przemian z depresją, niski wzrost, przejadanie się i otyłość.
Antypacja – występowanie choroby genetycznej w kolejnych generacjach w młodszym wieku lub z większym nasileniem objawów klinicznych.
Zjawisko antycypacji powszechne jest w neurodegeneracyjnych i neuroumięśnioiwych chorobach genetycznych zwanych chorobami spowodowanymi powtórzeniami trójnukleotydów, do których zalicza się pląsawicę Huntingtona, zespół łamliwego chromosomu X, dystrofię miotoniczną, chorobę Friedreicha i kilka typów ataksji rdzeniowo-móżdżkowych. W chorobach tych, trójnukleotydowe powtórzenia znajdujące się w genach powiązanych z rozwojem schorzeń ulegają z pokolenia na pokolenie systematycznej ekspansji ( mutacja dynamiczna ), przez co choroba ujawnia się coraz wcześniej, a jej objawy są coraz cięższe.