Marker- cecha odróżniająca dwa osobniki od siebie (np. cecha fenotypowa, choroba dziedziczna, wyst lub brak jakiegoś polipeptydu, różnice w sekw DNA). Jest ona: 1.łatwa do śledzenia w potomstwie(cecha jakościowa a nie ilościowa) 2.wolna od wpływów środ 3.monogeniczna(nie modyf epistatycz) 4.dziedziczona koodominacyjnie 5.polimorficzna (zróżnicowana w populacji). Marker idealny- nieinwazyjna analiza (przeżyciowa),powtarzalny,wykrywalny we wczesnych etapach rozw,losowo wyst w genomie,analiza zautomat. Podział: morfologiczne-na poziomie fenotypu,biochemiczne-na poz produktu genu,molekularne-białkowe,bazują na DNA,poziom DNA. Dobre populacje do mapowania: jak największa zmienność, nie wyst heterozygotyczność, np. RiL- rekombinowane linie wsobne(powst w wyniku samozapylenia 7-8x, okrojona różnica homozygot w pok.R), DH- podwójne haploidy(z kultur mikrospor F1)
Metoda linii prawie izogenicznych(NiL’s): są to linie identyczne pod wzgl.wszystkich loci poza rejonem otaczającym gen będący celem selekcji (różnią się 1 genem); uzyskiwane przez krzyż.form skrajnych pod wzgl.badanej cechy i wielokr. krzyż. wsteczne z jednoczesną selekcją na pożądaną cechę- (wprow dominującego genu odporności R do wrażliwej odmiany uprawnej-1 rok odporna RR:rr wrażliwa…wielokrotne krzyż.wstecz.(6-8x) daje linie prawie izogen.)- uzyskany marker jest sprzężony z badaną cechą. Wada-trudne do uzyskania. ODPOWIEDZI: markery dominujące-RAPD|faza górna wodna|po dodaniu 90% alk|5000 ug/ml|świecenie DNA-bromek etydyny| elektroforeza od – do +|1,95=DNA jest czyste| bufor TE-rozpuszcza DNA|hybrydyzacja-źródło zmienności biotech|wektor-klonowanie sekw DNA|Restryktazy-enzymy endonukleolityczne tnące DNA w ściśle|modyfikuje końce DNA=kinaza|