GENETYKA
1. Aktywność potowych (już zsyntetyzowanych) białek:
2. Któryś z etapów syntezy odpowiednich białek.
Przykłady: |
Poziom regulacji | ||||
wpływ insuliny na poziom cAMP w komórkach wątroby i mięśni; wpływ sterydów na transkrypcję pewnych odcinków DNA |
REGULACJA HORMONALNA |
TT *- | 5 f |
Mechanizmy kontroli metabolizmu |
Hf | |
modyfikacja allosteryczna; przyłączanie i odłączanie koenzymu |
KONTROLA AKTYWNOŚCI GOTOWYCH ENZYMÓW |
: T *• i |
Wewnątrzkomórkowy |
Dotyczy wszystkich organizmów | |
usuwanie odcinków- sygnałowych zasłaniających centrum aktywne |
OBRÓBKA POSTTRANSLACYJNA | ||||
wpływ na szybkość translacji |
TRANSLACJA | ||||
składanie egzonów; redagowanie* |
OBRÓBKA POSTIRANSKRYPCYJNA |
3 1 s | |||
oddziaływa nie enha nce rów; operony i regulony |
TRANSKRYPCJA | ||||
urpi Nic należy do mechanizmów Ki.rLiKACJA kontroli metabolizmu! |
lab. 4. Poziomy regulacji metabolizmu w organizmach żywych wraz z wybranymi przykładami. Oznaczone gwiazdką redagowanie nie jest omawiane h- szkole średniej, wymienienie go ma Ci jedynie pokazać, że w rzeczywistości jest wiele różnych, specyficznych systemów regulacyjnych (opis w tekście).
Najbardziej oczywiste dla każdego jest sterowanie aktywnością gotowych enzymów. W sytuacji, gdy komórka bardzo szybko ..potrzebuje włączenia” jakiegoś białka enzymatycznego lub odwrotnie, jest to bardzo dobre, powszechnie „stosowane” rozwiązanie. Typowym przykładem jest tu regulacja przy pomocy inhibitora allosteryczncgo, który modyfikuje pośrednio centrum aktywne i dany enzym przestaje katalizować „swoją” reakcję. Mówimy wówczas o regulacji na poziomie gotoweenzymu (por. Tab. 4 i przykład na Ryc. 100).
Obok niewątpliwych zalet, takie sterowanie metabolizmem ma też istotną wadę — jego stosowanie wymaga zsyntetyzowania białka enzymatycznego. To zaś może oznaczać:
A) duże koszty energetyczne związane z transkrypcją i translacją:
B) blokowanie aparatu translacyjncgo, który może być potrzebny do syntezy innego białka;
C) angażowanie pewnej ilości substratów — aminokwasów, które też mogą akurat być potrzebne do innych celów;
D) że cząsteczki tego białka zajmą pewną przestrzeń w komórce. Biorąc pod uwagę rozmiary tej ostatniej nie jest to problem marginalny.
Powstaje więc pytanie, czy zawsze sensowne jest najpierw- budowanie cząsteczek białkowych, a dopiero potem regulowanie ich aktywności? Oczywiście, że nie! W pewnych przypadkach
lepszym rozwiązaniem może być wpływanie już na etapie syntezy białka. Spośród wielu możliwości najważniejszą i najprostszą jest ..włączanie" albo „wyłączanie" procesu przepisywania informacji genetycznej z DNA na mRNA, czyli ręgulacia na poziomie transkrypcji-
a
kwas asparaginowy +
karhnmnilolosfoian
E, -i--
I ranskarbamytaza
asparaginowa kwas karbam>1o-
^ -asparaginowy
(PP.)
HAMOWANIE
Ł3 E4 Infosforan
NPp,) ► cytydyny
E,
(D — stosunkowo niski poziom Pk (tu: trifosforan cytydyny). E, jest więc aktywny;
Q) — przy wyższym Pk działa on jako inhibitor allosteryczny blokujący E,.
b.
substrat
Ryc. 100. Allosteryczna regulacja aktywności enzymu transkarbamylazy asparaginowej u E. coli — poziom regulacji aktywnego enzymu: a — przykład szlaku syntezy trifosforanu cytydyny. b, — model systemu działającego, b, — zablokowanie przemian przez inhibitor allosteryczny (Pp,. Pp,— kolejne produkty przejściowe. Pt —produkt końcowy).
UWAGA: Inne sposoby sterowania ekspresją informacji genetycznej częściowo zostały opisane w poprzednich rozdziałach i to musi Ci na razie wystarczyć (por. też koniecznie CZĘŚĆ: MOLEKULARNE PODŁOŻE ... ROZDZ: 4.2).
WŁĄCZANIE! WYŁĄCZANIE GENÓW U PROCARYOTA JEST PROSTSZE NIŻ U EUCARY-
OTA
Systemy regulacyjne Procaryota cechuje relatywnie duża prostota, ponieważ funkcje takich komórek są wyraźnie mniej skomplikowane niż eukariotycznych (por. później ROZDZ: 7.2). Podobnie ma się rzecz z organizacją genomów. Nie dziwi więc, że systemy kontrolne u Procaryota zostały znacznie lepiej poznane — szczególnie u E. coli. Bakteria ta, rosnąc na pełnej pożywce z glukozą, syntetyzuje ok. 800 różnych białek enzymatycznych. Część z nich, np. enzymy szlaku glikolitycznego syntetyzowana jest w sposób ciągły, niezależnie od warunków zewnętrznych. Geny kodujące takie białka nazywamy konstytutywnymi, ponieważ ich transkrypcja trwa przez cały cykl życiowy komórki. Podobnie ma się sprawa w przypadku większości białek budulcowych, ale i tak
159