Molekularne podstawy chorób roślin 5-10, STUDIA, choroby roślin


W y k ł a d 5

Objawy chorób wirusowych

Istnieje możliwość bezobjawowego przebiegu choroby.

Z reguły jednak objawy porażenia pojawiają się, ale tylko na krótko tuż po zakażeniu, potem zanikają.

Objawy mogą pojawiać się w późniejszym czasie (lub kolejnymi sezonami wegetacyjnymi), pod wpływem czynników zewnętrznych, np. istotna zmiana temperatury, cięcie drzew (zmiana stężenia giberelin), nawożenie azotem.

Zakażona roślina nawet, gdy nie wykazuj objawów choroby jest źródłem zakażenia dla innych roślin.

Przykładowe choroby: korkowatość korzeni pomidora, wirus mozaiki pomidora, zgnilizna pierścieniowa.

Choroby wirusowe drzew

Najczęściej występujące choroby wirusowe drzew w Polsce to:


Do drzew najczęściej porażanych przez wirusy zaliczamy: sosna, świerk, wierzba, buk, brzoza, dąb, wiąz.

Wirus PPV

Ospowatość śliw (określana z j. bułgarskiego szarką) jest jedną z najgroźniejszych chorób wirusowych drzew owocowych
w Polsce.

Chorobę tę wywołuje wirus Plum Pox Virus (PPV).

Szkodliwość choroby wynika z:

Wirus PPV poraża śliwy: morelę, brzoskwinie i ałyczkę (najczęściej stosowana podkładka do szczepienia drzew pestkowych).

Choroba pochodzi z regionu Bałkańskiego, gdzie pierwszy raz zaobserwowano ją w latach 30. XX w.

W Polsce pojawiła się 20 lat później na Podkarpaciu, co było związane z dużymi uprawami śliw na tym terenie, tradycyjnym rozmnażaniem drzew przez odrosty (wirus nie przenosi się przez nasiona) i cieplejszym klimatem w stosunku do regionów północnych. Obecnie występuje na obszarze całego kraju.

Wczesne objawy choroby występują na liściach. W okresie tuż po kwitnieniu (połowa czerwca), na liściach pojawiają się plamy chlorotyczne o różnych kształtach i różnych rozmiarach (najczęściej pierścienie i drobne nieregularne cętki lub paski wzdłuż bocznych nerwów). Plamy chlorotyczne powiększając się mają charakter zlewny i często obejmują w końcowej fazie całą blaszkę liściową (charakterystyczne bielenie drzewa).

Objawy na owocach pojawiają się późno, ok. 3 tygodnia, przed zbiorem. Na owocach pojawiają się fioletowo-czerwone plamy lub pierścienie. W miarę dojrzewania owoców plamy ciemnieją i zapadają się w głąb tkanki miękiszowej (powierzchnia owoców staje się ospowata - stąd nazwa choroby).

Miękisz staje się gąbczasty i zawiera liczne skupiska martwych komórek. Owoce z chorych drzew opadają.
Są zdeformowane i zawierają niskie stężenie cukrów, a wysokie kwasów organicznych - są niesmaczne i nie nadające się do przetworzenia.

Porażone drzewa tracą mrozoodporność.
Wirus PPV najczęściej jest przenoszony mechanicznie przez człowieka ( zabiegi agrotechniczne) lub przez mszyce. Ostatnio stwierdzono, że źródłem pierwotnym wirusa mogą być porażone rośliny zielne, takie jak: złocień, koniczyna, tytoń, komosa.

WIROIDY

Choroby powodowane przez wiroidy z dużym nasileniem występują na obszarach tropikalnych.

W naszej strefie klimatycznej wywołują choroby u roślin uprawnych, takich jak: chmiel, ziemniak, ogórek, jabłoń, śliwa.

Systematyka wiroidów

Wiroidy zostały włączone do systematyki wirusów i tworzą dwie podrodziny:


  1. Pospiviroidae;

  2. Avsunviroidae.


Do chwili obecnej poznano ok. 20 chorób wywoływanych przez wiroidy. Cechą charakterystyczną chorób wywoływanych przez wiroidy jest to, że jeden gatunek rośliny może być porażony przez kilka typów wiroidów, np. chmiel przez 3.

Wiroidy są termofilne, najlepiej namnażają się w temperaturze powyżej 25°C (ok. 30°C).
Istnieją wyjątki - wiroid bliznowatości skórki jabłek namnaża się w 18°C.

Wiroidy wykazują bardzo dużą stabilność termiczną.

Na namnażanie się wiroidów wpływa intensywność i jakość światła. Wiroidy lepiej namnażają się w warunkach intensywnej fotosyntezy (komórka roślinna jest lepiej zaopatrzona w odpowiednią ilość związków i energii).

Budowa wiroidów

Wiroidy są zbudowane z kwasu RNA. Jednoniciowy RNA wiroidu (ssRNA) przyjmuje strukturę kolistą dzięki kowalencyjnemu związaniu końców nici kwasu.

Struktura to w wyniku sparowania dużej liczby nukleotydów przyjmuje formę pozornie dwuniciowego RNA z pętlami zawierającymi niesparowane nukleotydy (struktura spinki do włosów).

Możliwa jest też struktura główki młotka (wiroid utajonej mozaiki brzoskwini).

Te struktury wykazują właściwości biokatalityczne i stąd nazywane są rybozymami.

Obydwie struktury wiroidowego RNA „spinki do włosów” (hairpin) i struktury „młotkowej” (hammerhead) przypominają strukturę rybosomalnych RNA.

Kwas nukleinowy

Masa cząsteczkowa wiroidów jest rzędu 100-125 tys. D. przeciętne RNA wiroidów jest 10 razy krótszy od najkrótszych kwasów nukleinowych wirusów satelitarnych i ok. 20 razy krótszy od kwasu RNA wirusa mozaiki tytoniu.

Taka długość cząsteczki RNA pozwala na zakodowanie peptydu zawierającego najwyżej 50 aminokwasów (prawdopodobnie z tego powodu wiroidy nie mają kapsydu i nie są w stanie w oparciu o własny genom syntetyzować polimerazy (replikazy)).

Brak tego enzymu uniemożliwia namnożenie się wiroidów w komórkach roślinnych w taki sam sposób jak ma to miejsce
w przypadku wirusów.

Cechy odróżniające wiroidy od wirusów:

  1. nie tworzą kapsydu;

  2. nie powodują w komórkach roślinnych syntezy białek specyficznych dla wiroidów.

Wirusy są pasożytami systemu translacyjnego, natomiast wiroidy są pasożytami systemu transkrypcyjnego.

U wiroidów o strukturze spinki do włosów Pospiviroidae wyróżnia się 5 fragmentów (domen) odpowiedzialnych za różne funkcje:

Mechanizm namnażania się wiroidów

Ponieważ RNA wiroidów jest zbyt małe by kodować białka niezbędne do replik wiroidów proces ten musi się odbywać w oparciu o odpowiednie enzymy komórki roślinnej.

Replikacja wiroidów odbywa się:

Mechanizm namnażania się wiroidów nazywany jest mechanizmem toczącego się koła (droga symetryczna
i niesymetryczna). Z namnażaniem wiroidu jest związana kolista nić plusowej (sensowej) formy RNA tzw. (+) ssRNA.
Nić (+) ssRNA wiroidu jest przekształcana przez polimerazę RNA do oligomerycznej formy zbudowanej z połączenia ze sobą kolejnych nici minusowych (antysensowych) (-ss)RNA.

Powstająca oligomeryczna minusowa (antysensowa) forma RNA (-ss)RNA jest matrycą do transkrypcji.

(-ss)RNA→(+)ssRNA

W wyniku tego procesu powstaje oligomeryczna forma (+)ssRNA, która jest cięta przez nukleazę, a powstające monomeryczne fragmenty odpowiadają pierwotnej formie RNA wiroidu. Fragmenty te przy udziale ligazy łączą swoje końce i powstaje forma kolista.

Wiroidy do syntezy swojego RNA wykorzystują nukleotydy roślinne i jej rezerwy energetyczne.

Proces syntezy wiroidowego RNA powoduje ograniczenie syntezy roślinnych kwasów RNA przez zajęcie miejsca do ich syntezy.

Tempo biosyntezy wiroidowego RNA stanowi ok. 0,1- 3% tempa biosyntezy roślinnego tRNA (może to być przyczyną długiego czasu inkubacji wiroidów w tkankach roślinnych).

Patogeneza

Proces patogenezy wiroidów nie został jeszcze poznany.

Wiroidy mogą funkcjonować jako fałszywe czynniki sygnałowe w regulacji wielu procesów komórki roślinnej lub też jako czynniki inicjujące proces posttranskrypcyjnego wyciszania genów co prowadzi do degradacji mRNA komórki roślinnej.

Jeśli działają jako fałszywe czynniki sygnalizacyjne to muszą być rozpoznawane przez komórki gospodarza. Jest to możliwe gdyż w komórkach roślinnych wiroidów występują jako pewna populacja różnych form tego samego wiroidu.

Mogą one tworzyć kompleksy z białkami (w jądrze i chloroplastach).

Wyciszenie genów (posttranskrypcyjne wyciszenie genów) - funkcjonowanie siRNA (małych interferujących RNA).

Lokalizacja wiroidów w jądrze komórkowym i chloroplastach prawdopodobnie związane jest z ochroną RNA wiroidu przed degradacją enzymatyczną, która zachodzi głównie w cytoplazmie.

RNA wiroidu może też tworzyć introny w RNA jądrowym rośliny lub może zachodzić specyficzna interkalacja między RNA wiroidu, ze związkami występującymi w komórkach roślinnych.

Transport wiroidów odbywa się przez plazmodesmy i przez floem. We floemie odbywa się zgodnie z przepływem asymilatów, ale wiroidowy RNA może przechodzić do komórek towarzyszących i tam się namnażać.

Wiroidowy RNA jest też aktywnie pobierany przez organy akceptorowe gdyż wiroidowy RNA mają specyficzne motywy strukturalne naśladujące motywy strukturalne RNA roślinnego.

Choroby wywołane przez wiroidy mają długi okres inkubacji pojawiające się objawy mają charakter choroby systemicznej.

Po objawach systemicznych następuje degeneracja porażonych roślin.

Często pojawiają się deformacje i odbarwienia organów rośliny (zmiana barwy części zielonych na pstrości, a nawet nekroza).

W Polsce głównie choroby wiroidowe to:


Chorobą wywołaną przez wiroid o dużym znaczeniu ekonomicznym jest wrzecionowatość bulw ziemniaka (PSTV).

Rozprzestrzenianie się wiroidów

Wiroidy rozprzestrzeniają się w sposób bierny:

Diagnostyka wiroidów

Testy biologiczne

Wiroid PSTV wykrywany jest przy użyciu pomidora odmiany Rutgers (roślina wskaźnikowa).

U zakażonego pomidora obserwuje się:

Metody biochemiczne - elektroforeza RNA

Metody molekularne:

Choroby powodowane przez wiroidy należą do chorób kwarantannowych.

Kwarantanna jest jedną z form profilaktyki zwalczania chorób:

Definicja metody kwarantannowej wg Kochmana: kwarantanna roślin to forma profilaktyki, której celem jest niedopuszczenie do wprowadzenia lub rozwleczenia groźnych chorób lub szkodników roślin z kraju do kraju (kwarantanna zewnętrzna) bądź ograniczeniu rozprzestrzeniania się chorób i szkodników roślin wewnątrz danego kraju (kwarantanna wewnętrzna).

Przykłady stosowania kwarantanny:

Obowiązuje zakaz wywożenia z Europy do Ameryki Północnej sadzonek sosny wejmutki (rak kory sosny wejmutki - choroba grzybowa).

F I T O P L A Z M Y

Mykoplazmy

Obecność mykoplazm w organizmach roślinnych po raz pierwszy stwierdzono w 1967r. - tkanka łykowa morwy z objawami żółtaczki (mikroskopia elektronowa). Do tego czasu uważano, że mykoplazmy są patogenami tylko dla zwierząt.

W 1993r. Sears i Kikpatric zaproponowali, by w odróżnieniu od zwierzęcych roślinne mykoplazmy określać terminem fitoplazmy.

Fitoplazmy zalicza się do bakterii pozbawionych ściany komórkowej. Dominującym rodzajem jest C. phyloplasma (26gatunków).

Fitoplazmy charakteryzują się różnokształtnością (pleomorfizmem - przybierają kształt w zależności od środowiska): kulisty, owalny, jajowaty, nieregularny ( od rurkowatego do nitkowatego), np. fitoplazma żółtaczki morwy.

Cechy fitoplazm:

Genofor fitoplazm (nazywany chromosomem) jest bardzo mały (680-160kbp). Na tej podstawie uważa się, że fitoplazmy to najprostsze samoreplikujące się organizmy. Fitoplazmy są typowymi pasożytami wewnętrznymi.

Zsekwencjonowano dwa genomy fitoplazm wykazujące, że ich genofory zawierają odpowiednio 671 i 754 geny.

Fitoplazmy nie posiadają genów odpowiedzialnych za syntezę aminokwasów, kwasów tłuszczowych i nukleotydów (związki te pobierają od żywiciela).

Z uwagi na brak ściany komórkowej są niewrażliwe na antybiotyki z grupy antybiotyków β-laktamowych (penicylina) a są wrażliwe na tetracykliny.

Spośród fitoplazm wyodrębniono grupę określaną jako spiroplazmy.

Spiroplazmy rozmnażają się przez podział i można je hodować na podłożach sztucznych.

Spiroplazmy mają zróżnicowaną budowę i różny kształt:

Genofor spiroplazm jest większy niż typowy fitoplazm (780-2200kbp).

Spiroplazmy wykazują zdolność do ruchu mimo braku specjalnych tworów typu np. rzęski. Dzieje się to w wyniku funkcjonowania wewnątrzkomórkowych włókien białkowych, które zmieniają swoją konformację powodując zmianę skrętu spirali komórki, co daje w efekcie zygzakowate przemieszczanie się spiroplazm.

Cykl życiowy fitoplazm obejmuje fazę w dwóch żywicielach: wektorach owadzich i tkankach łykowych roślin. Po dostaniu się z jelita do hemoglobiny owada żerującego na zainfekowanej roślinie następuje kolonizacja owada (konieczność namnożenia się fitoplazm w odpowiedniej ilości).

W okresie kolonizacji owada nazywanym okresem latencji trwa od kilku dni do kilku tygodni w zależności od:

Fitoplazmy mogą wpływać na funkcje życiowe owadów-wektorów.

W roślinach fitoplazmy najpierw rozprzestrzeniają się w tkance, do której zostały wprowadzone, a po dostaniu się do floemu porażają roślinę systemicznie. Kolonizują głównie rurki sitowe, ale można je stwierdzić w innych tkankach, a nawet nasionach - fitoplazma śmiertelnego żółknięcia palmy w zarodku palmy kokosowej czy w nasionach lucerny.

Rozprzestrzenianie się fitoplazm w roślinie (dwie możliwości):

  1. Komórki fitoplazm są bezpośrednio wprowadzane przez owada wraz ze śliną do tkanki łykowej i rozprzestrzeniają się systemicznie w obrębie całej rośliny wraz z zstępującym transportem asymilatów. Pleomorfizm pozwala fitoplazmom na przemieszczanie się przez otwory w polach sitowych.

  1. Fitoplazmy mają zdolność do przylegania do komórek żywiciela. W takich przypadkach rozmnażają się a następnie aktywnie przemieszczają się z jednej rurki sitowej do drugiej.

Rurki sitowe z uwagi na brak ufosforylowanych heksoz i nukleotydów nie są dobrym środowiskiem dla fitoplazm.
Te niezbędne im związki fitoplazmy pobierają z komórek towarzyszących.

Objawy powodowane przez fitoplazmy mają bezpośredni związek z:

Zaburzenia w równowadze hormonalnej rośliny powodują:

Zasiedlenie floemu przez fitoplazmy wywołuje reakcje obronne rośliny, takie jak, np. odkładanie kalozy w otworach pól sitowych (blokowanie transportu asymilatów). Blokowanie transportu asymilatów może być bezpośrednio wywołane przez fitoplazmy, jeśli namnożą się w znacznej ilości.

Fitoplazmy - objawy

Zahamowanie transportu asymilatów z donorów powoduje:

Fitoplazmy rozprzestrzeniają się w sposób bierny

Są przenoszone przez owady wektorowe i człowieka (prace pielęgnacyjne i wegetatywne rozmnażanie roślin).
Owady wektorowe przenoszące fitoplazmy to głównie skoczki i miodówki. Poza owadami fitoplazmy są przenoszone przez większość gatunków kanianki (roślina pasożytująca na innych roślinach).

Obecnie znamy 600 chorób powodowanych przez fitoplazmy.

Wywołują objawy takie jak:

Podstawowe objawy żółtaczki to:

Najczęściej spotykane w Polsce choroby to:

Fitoplazmy wywołują w Polsce 70 chorób występujących na roślinach sadowniczych, warzywnych i ozdobnych.

B A K T E R I E

Choroby roślin wywoływane prze bakterie określa się terminem BAKTERIOZY.

Choroby bakteryjne są:



Spośród 4 tys. poznanych gatunków bakterii związanych z roślinami 200 to patogeny.

Większość bakterii to saprofity bezwzględne bytujące w tym samym środowisku, co rośliny. Bakterie, które wywołują choroby roślin to saprofity okolicznościowe.

Źródło pierwotnego zakażenia i rozprzestrzeniania się bakterii patogenicznych dla roślin:

Większość bakterii patogenicznych może przetrwać na powierzchni organów rośliny np. liściach, pąkach, korze, jako epifity (stadium epifityczne) nie wywołując zakażenia. Stanowią jednak istotne źródło infekcji pierwotnych i wtórnych.

Prawie wszystkie bakterie fitopatogeniczne rozmnażają się w tkankach roślin-gospodarzy jako pasożyty.

Rozprzestrzenianie się bakterii porażających nadziemne części roślin odbywa się za pośrednictwem: wiatru; deszczu; owadów; ptaków; człowieka (zabiegi agrotechniczne, przenoszenie z materiałem rozmnożeniowym - nasiona, sadzonki, bulwy, cebule itp.)

Rozprzestrzenianie się bakterii porażających podziemną część rośliny odbywa się za pośrednictwem:


Komórki bakterii mogą mieć różny kształt, np. kuliste - ziarniaki, walcowate - pałeczki, laseczki, spiralne - przecinkowce i krętki.

Bakterie wywołujące choroby u roślin mają przeważnie kształt pałeczek. Wyjątek stanowią promieniowce z rodzaju Streptomyces, które są nitkowate.

Wszystkie bakterie fitopatogeniczne dzielimy na 4 kategorie:


  1. gramujemne bakterie właściwe;

  2. gramdodatnie bakterie właściwe;

  3. bakterie pozbawione ściany komórkowej (mykoplazmy);

  4. archebakterie.


Charakterystyka fitopatogenicznych bakterii właściwych:

Charakterystyka bakterii wywołujących choroby u roślin:

Wielkość plazmidu wynosi do kilku procent długości chromosomu np. u Agrobacterium tumefaciens jest wyjątkowo duży, sięga kilkunastu procent (200 kpz.). Plazmid replikuje się niezależnie od chromosomu.

Geny wchodzące w skład plazmidu związane są z określonymi cechami bakterii, np. kodują syntezę bakteriocyn (toksyn bakteryjnych), czynników odpowiedzialnych za odporność na czynniki środowiska i infekcyjność.

Zdolność bakterii do wytwarzania śluzu odgrywa dużą rolę w patogenezie bakterioz:

W y k ł a d 6

Objawy bakterioz

Objawy bakterioz są bardziej specyficzne niż objawy wiroz (łatwiejsza diagnostyka, dodatkowo bakterie często pojawiają się w postaci kolonii bakteryjnych)


Z tego względu bakterie fitopatogeniczne dzielimy na: nekrogeny, macerogeny, onkogeny

Patogeneza bakterioz

Bakterie nie są zdolne do czynnego przenikania przez kutynę. Zakażenie rośliny przez bakterie następuje w sposób bierny w wyniku otwarcia wrót zakażenia, np. przez zranienie.

W warunkach środowiskowych często następuje zakażenie rośliny przez szparki. Zakażenie przez szparki powoduje z reguły plamistość liści, np:

O zakażeniu organów w roślinie przez szparki decyduje:

Plamistość bakteryjna może rozwinąć się z zakażenia przez hydatody (Xanthomonas campestris pv campestris przez hydatody zakaża liście kapusty).

Patogeneza bakterioz organy roślinne niepokryte kutikulą (słupki i pręciki kwiatowe, nektaria, włoski). Nektar z uwagi na skład jest dobrą pożywką do namnażania się bakterii.

Przykładem bakterii zakażającej rośliny przez uszkodzone włoski jest Clavibacter michiganesis sub. sp. Michiganesis. Bakteria wywołuje raka pomidora. W tym przypadku zakażeniu ulega najpierw komórka podstawowa włoska.

Istnieją bakterie, które mają zdolność wykorzystywania wielu różnych wrót zakażenia.

Erwina amylovora wywołująca zarazę ogniową u drzew ziarnkowych i pestkowych może do organów rośliny przedostać się przez:


Zakres roślin - gospodarzy

Od bardzo szerokiego, obejmującego kilkaset gatunków roślin (np. Agrobacterium tumefaciens) do bardzo wąskiego
(np. Xanthomonas fragariae poraża tylko truskawkę).

W obrębie niektórych gatunków bakterii wyróżnia się patowary, czyli szczepy różniące się zakresem roślin-gospodarzy:

  1. Pseudomonas savastanoi pv phaseolicola - patogen fasoli (wywoła chorobę)

  2. P. syringae pv syringae - patogen roślin, ale szczep niepatogeniczny dla fasoli (wywoła HR)

  3. Pantoea agglomerans (niepatogen, epifit, saprofit)

Inwazyjność to zdolność patogenu do opanowania tkanek gospodarza.

Obejmuje ona mechanizmy kolonizacji (wniknięcie i wstępne namnożenie), produkcję pozakomórkowych substancji ułatwiających inwazję i potrzebnych do ominięcia lub przezwyciężenia mechanizmów obronnych gospodarza.

Pierwszym etapem choroby bakteryjnej jest infekcja.

Zapoczątkowanie procesu infekcji uzależnione jest od wielu czynników, np.:

Bakterie

Odpowiednia liczebność populacji bakteryjnej w miejscu infekcji.

Często występujące zjawisko określane terminem - sygnalizatorów zagęszczenia (QS), związane z regulacją ekspresji genów warunkujących patogeniczność, np. ekspresja genów kodujących enzymy uczestniczące w procesie patogenezy.

  1. bakterie Gram-ujemne wytwarzają laktony acylo-homoseryny (AHL)

  2. bakterie Gram-dodatnie wytwarzają oligopeptydy

Szybkość namnażania się bakterii zależy głównie od:


Fazy wzrostu bakterii (in vitro):

  1. Faza zastoju (log-faza). W tej fazie bakterie przystosowują się do nowego środowiska jakie stwarza im roślina
    (3-4 godz.)

  2. Faza namnażania się bakterii to faza, w której liczba komórek bakteryjnych wzrasta w postępie geometrycznym
    (log-faza) (24-78 godz.)

  3. Faza stacjonarna - szybkość namnażania bakterii ulega stabilizacji (wyczerpanie składników pokarmowych, akumulacja metabolitów pochodzących z obumierających komórek roślinnych, trwa od kilku godzin do kilku dni)

  4. Faza zamierania

Czynniki patogeniczności i wirulencji (siły zakażenia bakterii)

  1. Obecność w genomie bakterii określonej grupy genów

  2. Zdolność do syntezy i wydzielanie:

Inne czynniki związane z patogenezą to zdolność do:

Bakterie - wirulencja

Grupy genów (plant inducing genes), od których zależy wirulencja bakterii to geny, których ekspresja jest indukowana przez substancje powstające w procesie rozpadu tkanki roślinnej w czasie interakcji roślina-patogen bakteryjny.

Wirulencja patogenicznych dla roślin bakterii często jest związana z ich zdolnością (zwłaszcza bakterii wywołujących więdnięcia i zgnilizny) do wytwarzania pozakomórkowych polisacharydów, które stymulują namnażanie się bakterii (powstawanie kolonii bakteryjnych) i umożliwiają przeżycie bakterii na zewnątrz i wewnątrz części rośliny.

Proces infekcyjny przeprowadzany przez bakterie bytujące w przestworach międzykomórkowych wiąże się z wydzielaniem zewnątrzkomórkowym enzymów:

Często w procesach infekcyjnych uczestniczą też enzymy przeprowadzające rozkład składników błon komórkowych takich jak: proteazy i fosfolipazy

Konsekwencją uszkodzenia przez bakterie ściany i błony komórkowej jest wyciek treści komórkowej do przestworów międzykomórkowych gdzie jest ona wykorzystywana przez bakterie, które namnażają się i atakują kolejne komórki roślinne.

Charakter podłoża interakcji roślina-bakterie fitopatogeniczne może być zróżnicowany. Może mieć podłoże genetyczne lub mieć związek z toksynami bakteryjnymi:

Objawem wbudowania do genomu rośliny-żywiciela odcinka DNA Agrobacterium sp. tzw. transferowego T-DNA jest tworzenie się korzeni włośnikowatych (Agrobacterium rhizogenes, włośnikowatość - przerost korzeni) lub zrakowacenia korzeni (Agrobacterium tumefaciens, komórki roślinne w wyniku transformacji ulegają hiperplazji i hipertrofii)

Agrobacterium tumefaciens jest bakterią glebową, która w formie saprofitycznej może przetrwać w glebie nawet kilka lat. Infekuje korzenie roślin dwuliściennych (formy drzewne i zielne) oraz niektórych jednoliściennych. Jest polifagiem i ma największą ze wszystkich patogenów bakteryjnych liczbę roślin-gospodarzy (ok. 800 gatunków). A. tumefaciens jest G(-), tlenową, ruchliwą pałeczką o wymiarach 0,7 - 0,8 x 1,5 - 3 mm.

Zranione komórki roślin wytwarzają szereg związków fenolowych, np. acetosyringon rozpoznawany przez A. tumefaciens. Wzór acetosyringonu (Me = CH3)

Acetosyringon jest nie tylko czynnikiem chemotaktycznym dla bakterii, powoduje też uaktywnienie genów wirulencji patogenu, tzn. genów vir obecnych w części plazmidu tzw. T-DNA.

T-DNA zanim zostanie przetransportowane do komórki roślinnej wchodzi w skład plazmidu zwanego Ti, w przypadku
A. tumefaciens lub Ri - w przypadku A. rhizogenes.

Geny kodujące czynniki wirulencji - geny vir (ok. 24 genów) zgrupowane są w 8 operonach - A, B, C, D, E, F, G, H (oznaczone symbolami virA, virB itd.). Geny te tworzą obszar megaplazmidu zwany regionem vir i współdziałają z genami wirulencji wchodzącymi w skład genoforu (bakteryjnego chromosomu) chvA, chvB, itd. W skład megaplazmidu wchodzą też geny wywołujące tworzenie się korzeni włośnikowatych lub zrakowaceń (geny dla fitohormonów) określano terminem onkogenów i geny umożliwiające bakteriom metabolizm opin (geny metabolizmu opin).

W obszarach T-DNA znajdują się geny syntezy opin, auksyn i cytokinin. W T-DNA identyfikowano min. 3 geny dla regulatorów wzrostu odpowiedzialnych za wzrost tkanki guzowej. 2 z tych genów odpowiadają za syntezę IAA, trzeci za syntezę cytokinin (trans-zeatyny lub/i izopentylodiadeniny)

Geny dla auksyn:

Geny dla cytokinin:

Geny domen T-DNA nie ulegają ekspresji w komórce Agrobacterium

Zakażona A. tumefaciens komórka gospodarza obok proliferacji w tkankę guza zaczyna syntetyzować jedną z grup pochodnych aminokwasów - opiny. Geny katabolizmu opin nie są składnikiem T-DNA (stanowią osobny obszar megaplazmidu) i nie są przekazywane do genomu rośliny. Rośliny nie są zdolne do włączania opin w swoje szlaki metaboliczne.

Opiny mogą mieć charakter związków azotowych i bezazotowych:

Opiny są źródłem energii dla bakterii i występują tylko w zainfekowanych komórkach. Ich tworzenie wynika z ekspresji genów bakteryjnych w komórce gospodarza.

Rodzaj tworzonej opiny (czasami kilku) jest podstawą klasyfikacji szczepów Agrobacterium.

Przykłady opin:


Guzy powstają w miejscach uszkodzeń mechanicznych. Początkowo mają postać niewielkich obrzmień pod tkanką okrywająca. Z czasem osiągają wielkość od kilku mm do nawet kilkudziesięciu cm. Wielkość tworzącego się guza zależy od gatunku rośliny gospodarza, intensywności jego wzrostu i warunków środowiska. Młode guzy mają kształt kulisty, są gładkie
i miękkie o jasnokremowym zabarwieniu. W miarę starzenia się drewnieją, zmienia się ich kształt, powierzchnia staje się chropowata w wyniku obumierania zewnętrznej warstwy komórek, a barwa zmienia się na ciemnobrązową do czarnej. Szkodliwość bakteriozy powodowanej przez A. tumefaciens polega na ograniczeniu przewodzenia wody i składników mineralnych od korzeni do części nadziemnych rośliny. Najbardziej szkodliwe są guzy powstające w obrębie szyjki korzeniowej i korzeniach głównych, ponieważ dodatkowo osłabiają podstawę pędu lub pnia, zwiększa się ryzyko złamań,
a powstanie nowych ran najczęściej prowadzi do zakażeń wtórnych. Powstające na szyjce korzeniowej guzy zwykle zmniejszają długość pędu i wielkość rośliny o ok. 20%. Guzowate narośla mogą tworzyć się tylko na korzeniach, ale też na nadziemnych częściach rośliny.

Bakterie

Szkodliwość bakterii może wynikać z ich toksykogenności.

Toksykogenność to zdolność do wytwarzania endo- i egzotoksyn.

Endotoksyny to główne związki występujące w ścianie komórkowej bakterii uwalniane do środowiska po śmierci komórki bakteryjnej. W klasycznym sensie, termin endotoksyna odnosi się do składnika lipopolisacharydu zewnętrznej błony bakterii G(-). Endotoksyny mogą być uwolnione do środowiska, np. w wyniku skutecznej reakcji obronnej gospodarza, która prowadzi do lizy komórki bakteryjnej lub działań niektórych antybiotyków

Egzotoksyny są wydzielane przez żywe komórki bakteryjne do tkanek roślinnych.

Toksyny bakteryjne mogą być transportowane przez floem i działać cytotoksycznie na tkanki odległe od pierwotnego punktu inwazji lub wzrostu. Niektóre toksyny bakteryjne mogą również działać w miejscu kolonizacji i odgrywać rolę
w inwazji

Toksyny bakteryjne mogą działać w sposób:

Większość toksyn bakterii fitopatogenicznych to toksyny niespecyficzne w stosunku do rośliny - gospodarza choć powodując bezpośrednią reakcję u gospodarza dają charakterystyczne objawy.

Najważniejsze toksyny bakteryjne:

Bakterie fitopatogeniczne mogą syntetyzować i wydzielać na zewnątrz fitohormony (auksyny (IAA) i cytokininy), które są odpowiedzialne za tworzenie narośli na roślinach, np.:

Tworzenie ośrodków krystalizacji lodu (ang. ice nucleation active, INA). W ścianie komórkowej niektórych bakterii fitopatogenicznych (P. syringae, P. vividiflava, Pantoea stewavtii, Xantomonas translucens) występują białka, które działają jak ośrodki krystalizacji lodu.

Bakterie - zasiedlanie i rozmnażanie w roślinie - gospodarzu

Zdolność do zasiedlania i rozmnażania w roślinie-gospodarzu uwarunkowana jest przez:

  1. czynniki ochronne np. egzopolisacharydy śluzu bakteryjnego zapobiegają wysychaniu komórek bakteryjnych, zatrzymują wodę, ograniczają przewodzenie wody w roślinie, nie dopuszczają do unieruchomienia bakterii w ścianie komórkowej komórki roślinnej, uczestniczą w pobieraniu związków węglowodanowych z rośliny